Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001188)

(Analysis AN001980)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10
O-Acetylserine	ME281798	1.27	0.43	1.23	1.54	1.79	1.51	0.30	0.62	0.74	0.68
PEEK	ME281924	1.42	0.21	1.33	1.75	1.61	1.52	0.11	0.67	0.37	0.48
1D-myo-Inositol 3-phosphate	ME281840	1.47	0.45	0.90	1.80	1.27	1.41	0.33	0.62	1.19	0.58
TSKY	ME281912	1.59	0.41	0.87	1.84	1.64	1.44	0.30	0.61	0.80	0.60
VLSPAD	ME281906	1.50	0.18	0.75	1.90	1.65	1.62	0.11	0.36	0.65	0.34
Glutamylglycine	ME281829	1.35	0.94	0.57	1.28	1.67	1.40	0.83	0.55	0.80	0.64
Glutamylglutamic acid	ME281845	1.10	0.59	0.83	1.67	2.04	1.03	0.44	0.72	0.99	0.59
Prolyl-Serine	ME281828	1.20	0.69	0.92	1.94	1.76	1.00	0.38	0.78	0.87	0.48
N-Acetyl-aspartyl-glutamate	ME281851	1.43	0.42	0.71	1.73	1.66	1.22	0.34	0.54	0.94	1.06
S-Lactoylglutathione	ME281862	1.23	0.71	0.63	1.74	1.63	1.25	0.68	0.62	0.87	0.66
VHLTP	ME281908	1.23	0.64	0.85	1.77	1.62	1.30	0.49	0.55	0.72	0.87
Glutamyl-D-alanine	ME281832	1.56	0.41	0.40	1.67	1.89	1.81	0.50	0.33	0.72	0.80
L-Lactic acid	ME281895	1.45	0.31	0.33	1.63	2.21	1.69	0.41	0.26	1.01	0.75
Glu-Lys-Gln	ME281866	1.19	0.31	0.59	1.82	2.38	1.11	0.22	0.35	0.94	1.09
PHFD	ME281922	1.38	0.23	0.42	1.82	1.95	1.22	0.21	0.33	1.11	0.99
S-Adenosylhomocysteine	ME281863	1.52	0.20	0.36	2.11	2.12	0.94	0.17	0.31	1.30	0.94
2-C-Methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate	ME281846	1.30	0.25	0.71	2.41	1.40	1.98	0.40	0.62	0.69	0.37
Geranylgeranyl-PP	ME281935	1.91	0.44	0.81	2.29	2.18	1.61	0.25	0.24	0.21	0.21
Pipecolic acid	ME281786	2.03	0.28	0.87	2.16	1.57	1.99	0.19	0.41	0.50	0.21
Farnesyl pyrophosphate	ME281936	1.07	0.19	0.18	1.80	1.86	1.34	0.16	0.15	NA	0.13
VS	ME281830	0.79	0.28	1.04	2.72	2.32	0.69	0.20	0.45	0.53	0.72
PENF	ME281923	1.03	0.18	0.99	1.83	1.66	1.20	0.18	0.53	0.30	0.19
TPDAVM	ME281913	1.12	0.31	0.80	2.35	1.81	1.03	0.26	0.42	0.24	0.09
VDEVG	ME281911	1.24	0.21	0.85	2.28	2.23	1.29	0.17	0.49	0.24	0.11
PVQ	ME281917	1.29	0.43	0.88	2.73	1.63	1.32	0.33	0.82	0.41	0.12
PAVH	ME281928	1.00	0.24	1.16	2.84	2.09	1.18	0.24	0.58	0.48	0.24
PNALS	ME281921	1.08	0.34	1.12	2.65	1.96	1.25	0.22	0.57	0.32	0.18
Fumaric acid	ME281781	2.26	0.45	1.22	1.30	0.29	2.44	0.36	0.71	0.91	0.30
4,5-Dihydroorotic acid	ME281802	2.54	0.35	1.10	1.62	0.38	2.13	0.35	0.58	0.98	0.27
Ureidosuccinic acid	ME281814	2.44	0.40	1.25	1.55	0.29	2.13	0.35	0.71	0.86	0.33
VLSPA	ME281907	1.99	0.33	0.79	2.00	0.76	1.82	0.28	0.45	0.98	0.77
Methyl-thioinosine	ME281849	1.66	0.40	1.03	1.84	0.58	2.09	0.33	0.70	1.24	0.33
Orotic acid	ME281801	2.05	0.31	0.99	1.80	0.79	2.30	0.17	0.49	0.96	0.24
HVDD	ME281931	1.95	0.30	2.20	1.64	0.61	2.22	0.15	0.94	0.30	0.07
PD	ME281927	1.97	0.48	1.15	2.12	0.87	1.83	0.28	0.79	0.59	0.13
Alanyl-theronine	ME281825	1.39	0.55	1.73	2.00	0.67	1.26	0.35	1.18	0.31	0.11
VD	ME281834	1.40	0.69	1.30	1.95	1.03	1.27	0.50	0.89	0.59	0.45
PE	ME281926	1.49	0.52	1.61	2.12	0.78	1.52	0.40	0.87	0.57	0.31
TNVK	ME281914	1.64	0.36	1.56	2.14	0.79	1.52	0.20	0.82	0.45	0.14
Deoxyribose 5-phosphate	ME281831	1.38	0.67	1.27	2.35	0.84	1.37	0.41	0.81	0.55	0.06
PPVQ	ME281920	1.30	0.72	1.44	1.99	0.94	1.44	0.43	0.73	0.25	0.05
GGEAL	ME281933	1.44	0.27	1.46	2.40	1.10	1.56	0.18	0.67	0.32	0.12
PWTQ	ME281915	1.37	0.31	1.52	2.24	1.40	1.53	0.30	0.76	0.22	0.12
HVDPENF	ME281930	1.33	0.36	1.20	2.28	1.11	1.50	0.37	0.63	0.44	0.26
VDPVNF	ME281910	1.41	0.39	1.12	2.68	1.20	1.51	0.31	0.64	0.35	0.15
HLD	ME281932	1.63	0.24	2.08	2.32	0.99	1.75	0.17	0.75	0.26	0.07
PVNF	ME281918	1.75	0.35	1.69	2.45	0.94	1.73	0.21	0.69	0.35	0.07
Gly-Pro-Glu	ME281850	1.80	0.35	1.85	1.89	1.06	1.78	0.21	0.76	0.34	0.14
PEE	ME281925	1.77	0.27	1.51	2.26	1.29	1.89	0.22	0.69	0.26	0.09
PVQA	ME281916	1.61	0.26	1.59	2.15	1.09	1.85	0.17	0.74	0.49	0.29
Dihydroxyacetone phosphate	ME281808	0.62	1.69	1.35	0.31	0.59	0.70	1.69	1.46	0.41	1.16
LysoPG(18:0/0:0)	ME281880	1.05	0.73	1.64	1.05	1.37	1.26	0.60	1.21	0.69	0.49
LD	ME281929	1.27	0.91	1.01	1.04	0.88	1.42	0.93	0.94	0.92	0.76
L-gamma-glutamyl-L-leucine	ME281842	1.33	0.81	1.03	1.09	0.70	1.43	0.85	0.99	1.07	0.78
D-Glyceraldehyde 3-phosphate	ME281807	1.58	0.87	0.87	1.16	1.00	1.56	0.92	0.76	0.77	0.64
D-Sedoheptulose 7-phosphate	ME281848	1.56	0.86	0.73	0.94	0.97	1.67	0.90	0.81	0.80	0.86
cis-Aconitic acid	ME281810	1.06	0.81	0.93	1.59	0.94	1.08	0.81	0.80	1.24	0.76
IDP	ME281870	0.61	1.04	0.93	0.83	1.33	0.85	1.10	0.95	0.83	1.46
1-3-Bisphosphoglycerate	ME281843	0.75	0.88	1.10	0.78	1.07	0.85	1.06	1.07	0.96	1.44
Phosphoenolpyruvic acid	ME281806	0.83	0.87	1.09	0.76	1.03	0.86	1.05	1.04	0.96	1.46
Inosinic acid	ME281860	0.97	1.26	0.76	1.26	0.80	1.09	1.21	0.69	1.13	0.82
D-Ribose	ME281800	1.25	1.13	0.83	0.85	0.76	1.31	1.22	0.97	0.94	0.78
Mannitol	ME281821	1.02	1.17	0.91	0.98	0.87	1.25	1.18	1.01	0.99	0.65
Orotidine	ME281847	1.12	1.15	0.78	1.09	0.88	0.84	1.21	0.97	1.08	0.86
Threonic acid	ME281792	1.09	1.15	0.80	0.96	1.05	0.96	1.31	0.97	1.00	0.70
Citrulline	ME281813	1.12	1.37	0.92	0.76	0.87	1.09	1.39	0.90	0.85	0.74
ADP	ME281869	1.01	1.28	0.91	0.76	0.96	1.10	1.25	0.97	0.78	0.98
L-Aspartic acid	ME281790	0.90	1.22	0.96	0.95	1.04	0.93	1.24	1.01	0.91	0.82
Fructose-1-phosphate	ME281841	0.92	1.30	1.01	0.85	0.87	1.00	1.35	1.01	0.87	0.82
N-Acetyl-L-aspartic acid	ME281812	0.86	1.32	0.97	0.88	1.01	0.95	1.33	0.99	0.82	0.84
Pantothenic acid	ME281899	0.83	0.97	0.97	0.92	0.79	0.92	1.25	1.07	1.06	1.19
Oxidized glutathione	ME281887	0.94	0.95	1.04	0.91	1.11	1.13	1.29	0.85	0.72	1.07
CMP-2-aminoethylphosphonate	ME281871	1.05	0.91	0.83	0.96	1.05	1.14	1.08	0.84	0.84	1.31
Ornithine	ME281789	1.03	1.00	0.85	0.82	1.12	1.21	1.18	0.82	0.86	1.13
Glutathione	ME281852	0.92	1.06	1.11	1.01	0.96	0.96	0.97	1.01	0.92	1.08
Gamma-Aminobutyric acid	ME281782	0.90	1.04	1.08	0.93	0.92	1.06	1.15	1.00	0.93	1.00
Pyroglutamic acid	ME281785	0.91	1.05	1.05	0.94	0.94	1.01	1.14	1.03	0.91	1.00
L-Alanine	ME281893	0.90	1.11	1.06	0.90	1.01	0.96	1.17	1.06	0.88	0.94
L-Glutamic acid	ME281797	0.90	1.09	1.00	0.94	0.99	0.98	1.16	1.02	0.91	1.01
L-Isoleucine	ME281788	0.92	0.97	0.96	0.94	0.99	1.04	1.15	0.95	1.02	1.06
L-Methionine	ME281799	0.92	1.05	0.93	0.96	0.97	0.98	1.22	0.96	1.02	0.97
L-Galactose	ME281817	1.07	1.08	0.89	0.96	0.87	1.13	1.25	0.97	0.93	0.87
Sarcosine	ME281894	1.01	1.09	0.90	0.96	0.95	1.13	1.27	0.89	0.97	0.84
Alpha-D-Glucose	ME281816	1.03	1.02	0.83	0.98	0.97	1.13	1.15	0.98	1.04	0.88
2-Hydroxycinnamic acid	ME281803	0.99	1.00	0.95	0.98	1.00	1.19	1.09	0.95	0.93	0.93
L-Tyrosine	ME281819	1.02	0.99	0.92	1.03	1.02	1.09	1.09	0.93	0.99	0.93
Sorbitol	ME281820	0.99	1.01	0.96	1.09	1.02	1.08	1.08	0.96	0.93	0.90
Methyl glutathione	ME281853	1.04	1.15	0.91	1.10	1.09	1.01	1.04	0.95	0.93	0.78
Riboflavin	ME281903	0.92	1.12	0.84	1.03	1.00	1.09	1.16	1.07	1.00	0.75
PPVQAA	ME281919	1.00	0.75	1.02	0.87	1.11	1.24	1.03	0.89	0.99	1.14
3-Phosphoglyceric acid	ME281823	0.95	0.91	1.18	0.91	1.13	0.97	0.90	1.06	0.90	1.10
Flavin Mononucleotide	ME281905	0.96	0.80	1.12	0.93	1.20	0.97	0.83	1.04	0.98	1.19
L-Glutamine	ME281795	0.93	0.84	0.96	1.09	1.01	0.97	0.98	0.94	1.12	1.14
L-Arginine	ME281811	0.91	0.90	0.96	1.03	1.31	0.93	0.97	0.93	0.90	1.14
Uridine diphosphategalactose	ME281884	1.07	0.95	0.97	1.06	1.13	1.07	0.93	0.87	0.95	1.01
5-Aminolevulinic acid	ME281896	0.96	1.00	0.92	0.99	1.04	1.02	1.03	0.96	1.02	1.05
myo-Inositol	ME281815	0.95	0.94	0.91	0.98	1.12	1.01	1.03	0.91	1.01	1.11
Adenosine triphosphate	ME281877	0.95	0.96	1.04	0.92	1.16	1.05	1.00	0.93	0.93	1.08
succinyl-GLUTATHIONE	ME281868	0.99	1.00	0.98	1.01	1.13	1.01	1.00	0.92	0.93	1.02
Guanosine monophosphate	ME281861	1.04	1.07	0.58	1.20	1.40	0.91	0.83	0.88	1.03	1.01
L-Methionine S-oxide	ME281804	0.75	0.91	0.86	1.18	1.28	0.92	0.78	0.93	1.25	1.10
Coenzyme A	ME281890	1.11	0.75	0.86	1.16	1.34	1.24	0.77	0.71	0.92	1.16
UDP-N-acetyl-D-galactosamine	ME281886	1.05	0.81	0.78	1.17	1.32	1.06	0.85	0.77	0.99	1.19
Deoxyadenosine triphosphate	ME281878	1.14	0.75	0.92	1.16	1.10	1.15	0.77	0.77	1.07	1.19
NADP	ME281889	1.21	0.63	1.02	1.11	1.06	1.17	0.73	0.83	0.96	1.32
Adenosine diphosphate ribose	ME281883	1.12	0.98	0.81	1.06	1.35	1.40	0.86	0.86	0.85	0.74
Acetyl-CoA	ME281892	1.04	0.95	0.93	1.16	1.40	1.14	0.96	0.82	0.91	0.70
D-Galactose 6-phosphate	ME281839	1.14	0.79	0.88	1.33	1.34	1.15	0.80	0.79	1.09	0.69
Glucose 6-phosphate	ME281837	1.08	0.81	0.90	1.29	1.28	1.12	0.86	0.82	1.09	0.77
Fructose 6-phosphate	ME281838	1.30	0.86	0.87	1.11	1.14	1.40	1.01	0.81	0.95	0.61
L-Valine	ME281783	1.24	0.83	0.87	1.22	1.15	1.28	0.90	0.81	0.95	0.79
6-Phosphogluconic acid	ME281844	1.08	0.97	0.89	1.12	1.06	1.09	0.97	0.97	1.00	0.85
L-Threonine	ME281784	1.02	1.01	0.83	1.17	1.11	1.13	0.97	0.86	1.04	0.85
Inosine	ME281900	1.01	0.81	0.98	1.17	1.08	1.18	0.95	0.88	1.02	0.93
L-Phenylalanine	ME281805	1.18	0.87	0.92	1.14	1.10	1.24	0.94	0.83	0.94	0.87
L-Leucine	ME281787	1.09	0.88	0.92	1.11	1.06	1.20	1.01	0.85	0.99	0.90
L-Proline	ME281780	1.12	0.91	0.85	1.16	1.14	1.17	0.98	0.83	0.99	0.86
GEYG	ME281934	1.00	0.86	0.83	1.19	1.26	1.24	1.09	0.80	0.89	0.85
L-Malic acid	ME281791	1.11	0.86	0.88	1.27	1.23	1.11	0.92	0.77	0.90	0.95
Glycerol 3-phosphate	ME281809	0.56	1.50	1.35	0.73	0.67	0.66	1.59	1.40	0.83	0.66
Pyridoxine	ME281898	0.35	1.23	1.03	0.99	1.10	0.43	1.39	1.19	1.08	1.08
Fructose 1,6-bisphosphate	ME281858	0.79	1.23	1.10	0.68	0.98	0.96	1.22	1.07	0.68	1.26
Gluconic acid	ME281827	0.72	1.25	1.20	0.89	0.83	0.88	1.30	1.04	0.96	0.91
Acetylphosphate	ME281897	0.68	1.38	1.27	0.73	0.93	0.63	1.28	1.34	0.70	1.02
D-Ribose 5-phosphate	ME281833	0.66	1.29	1.19	0.84	1.01	0.70	1.37	1.13	0.77	0.98
Citric acid	ME281826	1.20	1.43	1.04	0.69	0.64	1.28	1.52	0.97	0.66	0.62
D-Fructose	ME281818	0.97	1.39	1.05	0.77	0.61	0.98	1.52	1.06	0.90	0.75
Adenosine monophosphate	ME281859	1.09	1.65	0.72	0.65	0.80	1.15	1.45	0.86	0.65	0.96
dTDP	ME281864	1.09	1.61	0.53	0.75	1.09	0.92	1.39	0.98	0.63	1.16
L-Lysine	ME281796	0.96	0.75	0.90	1.21	2.49	0.94	0.87	0.61	0.49	0.76
Cytidine triphosphate	ME281876	1.14	0.38	1.16	1.19	1.75	1.08	0.34	0.77	0.96	1.28
CDP-Ethanolamine	ME281872	1.34	0.24	0.84	1.27	1.46	1.51	0.25	0.72	1.09	1.36
Uridine 5^-diphosphate	ME281867	1.43	0.35	0.83	1.44	1.53	1.36	0.30	0.67	1.00	1.16
D-4^-Phosphopantothenate	ME281901	0.68	0.68	1.20	1.66	1.86	0.75	0.49	0.55	1.04	1.14
Nicotinic acid mononucleotide	ME281857	0.82	0.54	0.74	1.11	1.81	0.85	0.67	0.75	1.06	1.57
VHLT	ME281909	0.99	0.58	0.55	1.37	1.90	1.04	0.72	0.47	0.81	1.43
Oxoglutaric acid	ME281794	1.16	0.64	0.79	1.42	1.51	1.12	0.49	0.59	1.35	0.94
Succinic acid semialdehyde	ME281779	1.20	0.59	0.79	1.40	1.44	1.15	0.49	0.64	1.31	1.01
NAD	ME281888	1.02	0.86	0.85	1.45	1.40	0.96	0.58	0.82	1.10	0.95
Cyclic ADP-ribose	ME281882	1.00	0.72	0.93	1.26	1.50	1.11	0.63	0.76	1.07	1.04
Cyclic AMP	ME281856	1.11	0.63	1.03	1.06	1.52	1.12	0.63	0.70	1.06	1.02
N-Acetylglutamic acid	ME281824	0.96	0.74	1.04	0.93	2.00	1.24	0.92	0.77	0.63	0.80
LysoPE(0:0/18:3(6Z,9Z,12Z))	ME281874	0.81	0.93	0.94	1.41	1.55	0.93	0.92	0.97	0.68	0.79
LysoPE(0:0/20:4(5Z,8Z,11Z,14Z))	ME281879	0.92	0.90	0.70	1.49	1.61	0.92	0.83	0.78	0.76	1.03
FAD	ME281891	0.97	0.78	0.95	1.16	1.66	1.08	0.80	0.82	0.89	0.89
Guanosine diphosphate	ME281904	0.97	0.90	0.95	1.06	1.66	0.96	0.75	0.82	0.81	1.10
Guanosine diphosphate mannose	ME281885	0.91	0.88	0.86	1.02	1.68	0.93	0.83	0.78	0.93	1.15
1-Acyl-sn-glycero-3-phosphoglycerol	ME281835	0.94	0.82	0.67	1.23	2.04	0.98	0.74	0.63	0.91	0.96
Guanosine triphosphate	ME281881	0.93	0.70	0.98	1.10	1.98	0.94	0.66	0.75	0.83	1.12
gamma-Glutamylcysteine	ME281836	1.06	NA	1.08	1.18	0.85	0.73	NA	NA	1.05	1.02
Thymidine 5^-triphosphate	ME281875	1.31	0.07	0.53	1.80	1.25	1.18	0.08	0.29	1.32	1.97
dCTP	ME281873	1.21	0.42	0.65	1.69	1.32	1.16	0.45	0.48	1.03	1.61
Pantetheine 4-phosphate	ME281902	1.08	0.41	0.76	1.94	1.06	0.97	0.47	0.68	1.28	1.33
Cytidine monophosphate	ME281854	0.60	0.13	0.32	0.76	1.71	0.53	0.19	0.28	0.97	4.36
Phosphorylcholine	ME281822	0.82	0.26	0.64	1.02	1.28	0.56	0.30	0.53	1.56	2.93
O-Phosphoethanolamine	ME281793	0.85	0.21	0.24	1.01	2.54	1.02	0.29	0.27	0.91	2.57
CDP	ME281865	0.98	0.34	0.65	0.91	1.80	0.95	0.35	0.61	0.91	2.46
Uridine 5^-monophosphate	ME281855	1.08	0.22	0.39	1.46	2.13	0.84	0.22	0.38	1.11	2.10

Factors:

F1	Treatment:Control \| Time (hr):30
F2	Treatment:Control \| Time (hr):58
F3	Treatment:Control \| Time (hr):68
F4	Treatment:Control \| Time (hr):78
F5	Treatment:Control \| Time (hr):88
F6	Treatment:Indolmycin \| Time (hr):30
F7	Treatment:Indolmycin \| Time (hr):58
F8	Treatment:Indolmycin \| Time (hr):68
F9	Treatment:Indolmycin \| Time (hr):78
F10	Treatment:Indolmycin \| Time (hr):88

Data matrix