Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001974)

(Analysis AN003222)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9
palmitate	ME456045	0.45	7.39	0.16	0.58	0.25	0.40	0.25	0.54	0.27
trans-urocanate	ME456109	0.21	7.68	0.13	0.14	0.09	0.12	0.19	0.23	0.72
assymetric_dimethylarginine	ME456239	1.24	NA	0.93	1.11	NA	0.48	0.08	0.33	2.39
methionine_13C6-15N	ME456102	1.45	0.00	0.42	2.22	NA	0.04	NA	NA	2.04
proline	ME456124	0.55	3.61	0.49	0.68	0.71	1.11	0.69	0.72	0.88
glycine	ME456174	0.75	1.58	0.40	0.55	0.70	0.99	0.83	NA	0.99
methylthioadenosine	ME456049	1.43	1.41	NA	0.22	NA	0.94	0.69	NA	0.39
GSSG	ME456243	0.80	1.52	0.61	0.48	0.17	2.62	1.18	0.75	0.55
cystine	ME456208	0.83	1.23	1.01	0.54	0.38	1.70	1.12	0.82	1.19
S-adenosylhomocysteine	ME456134	0.83	1.31	0.54	0.55	0.50	1.88	1.32	0.45	1.12
UDP	ME456228	1.50	0.74	0.83	1.00	0.91	0.86	NA	0.76	1.16
ADP-ribose_unc	ME456205	0.60	1.45	0.80	0.61	0.61	0.89	1.14	1.53	1.50
AMP	ME456159	0.73	1.20	0.79	0.46	0.33	1.27	1.21	2.36	1.20
pantothenate	ME456074	0.80	1.42	1.47	1.95	1.19	0.64	0.54	0.64	0.47
pyridoxal	ME456064	0.99	1.16	0.90	1.60	1.20	0.94	0.72	0.72	0.52
guanine_unc	ME456114	0.70	1.19	0.46	1.38	1.93	0.80	0.88	1.08	1.26
dihydroxyacetone_phosphate	ME456204	0.90	0.71	0.89	0.92	1.29	0.74	1.18	1.12	1.51
GSH_Ellmans	ME456189	0.83	0.93	0.84	1.33	1.39	0.62	0.96	1.22	1.12
hydroxyproline_gammaALA	ME456150	0.72	0.76	0.90	0.89	1.00	0.99	1.11	1.69	1.31
niacinamide	ME456056	0.77	0.56	0.84	1.14	0.89	0.54	1.13	1.68	1.85
nicotinamide	ME456055	0.77	0.56	0.84	1.14	0.89	0.54	1.13	1.69	1.88
allantoin	ME456138	0.84	0.93	0.42	0.95	1.13	1.75	0.59	1.47	1.11
homocitrulline	ME456163	0.68	0.81	0.55	0.81	0.47	1.62	1.17	1.47	0.79
betaine	ME456100	0.73	2.46	0.65	0.95	0.86	0.87	1.04	0.93	0.68
citrulline	ME456185	0.68	2.00	0.80	1.20	1.00	0.86	0.81	1.03	0.94
methionine-sulfoxide	ME456137	0.74	2.11	0.74	1.04	0.84	1.16	0.92	0.85	0.75
aspartate	ME456190	0.71	2.28	0.48	0.67	0.95	0.95	0.83	0.95	1.43
ornithine	ME456253	0.67	2.42	0.71	0.81	0.71	1.04	0.86	0.93	1.15
glutamate	ME456182	0.93	1.88	0.75	0.63	0.69	1.33	0.86	0.74	1.27
thiamine	ME456110	0.75	1.81	0.90	0.75	0.84	0.89	0.70	0.98	1.56
creatinine	ME456079	0.80	1.40	0.71	1.07	1.34	0.97	0.92	1.31	0.68
xanthine	ME456119	0.91	1.22	0.60	1.00	1.45	1.07	0.89	0.83	1.24
cytosine_unc	ME456094	1.10	0.97	0.71	1.04	1.02	1.04	0.80	1.03	1.20
dCytidine	ME456086	1.26	1.00	0.68	1.11	1.02	0.87	0.71	1.04	1.25
cAMP_unc	ME456088	0.73	1.63	1.04	1.11	1.08	0.64	1.07	1.09	1.07
3-hydroxybutyrate	ME456085	0.81	0.93	1.32	0.92	0.99	1.26	0.80	0.94	1.23
citrate	ME456248	0.77	1.43	0.59	0.93	1.07	1.32	1.02	1.20	0.91
malate	ME456220	0.86	1.38	0.64	0.85	1.05	1.34	0.96	1.06	0.96
3-phosphoglycerate	ME456241	0.98	1.44	0.87	0.73	0.97	1.21	0.95	0.86	0.97
F6P_G1P_unc	ME456221	1.05	1.72	0.78	0.69	1.01	1.09	0.84	0.97	0.79
glucose_6-phosphate	ME456237	0.90	1.74	0.80	0.77	0.94	1.04	0.90	0.97	0.98
tyrosine_13C9-15N	ME456127	0.63	1.22	1.08	1.09	1.12	1.17	1.15	0.90	1.18
guanosine	ME456120	0.61	1.34	1.01	1.00	1.20	1.34	1.06	0.86	1.29
hypoxanthine	ME456087	0.65	1.34	1.07	0.96	1.12	1.38	1.09	0.84	1.13
adenine	ME456075	0.75	1.33	0.83	0.97	1.16	1.20	1.14	0.99	1.06
phosphocholine	ME456195	0.73	1.31	0.84	0.93	1.12	1.31	1.01	0.97	1.19
2-aminoadipate	ME456192	0.70	1.27	0.87	1.06	1.09	1.29	1.00	1.01	1.06
cytidine	ME456108	0.73	1.25	0.94	1.01	1.03	1.25	0.94	1.01	1.16
O-phosphoethanolamine_unc	ME456212	0.75	1.17	0.94	0.99	1.04	1.18	0.88	1.11	1.27
glycerol_3-phosphate	ME456194	0.81	1.15	0.86	0.94	0.98	1.27	0.96	1.00	1.24
phosphoethanolamine	ME456222	0.83	1.12	0.92	0.99	0.91	1.18	0.91	1.07	1.24
carnosine	ME456168	0.75	1.12	0.87	0.94	0.95	1.30	1.14	1.01	1.21
lactate	ME456089	0.73	1.13	1.03	0.88	1.01	1.30	1.08	0.97	1.18
uridine	ME456082	0.71	1.24	0.99	0.89	1.03	1.31	0.98	1.00	1.27
carnitine	ME456132	0.71	1.44	0.81	0.92	0.95	1.47	1.24	0.87	1.02
acetylcarnitine	ME456095	0.80	1.37	0.74	0.79	0.96	1.44	1.13	0.80	1.22
inosine	ME456097	0.76	1.24	0.97	0.85	0.98	1.46	1.09	0.79	1.15
creatine	ME456148	0.68	1.49	0.68	0.97	1.00	1.42	1.01	1.01	1.29
glycerophosphocholine	ME456155	0.68	1.34	0.84	0.92	0.97	1.32	1.19	0.91	1.39
pseudouridine_unc	ME456115	0.66	1.26	0.91	1.27	1.10	1.04	0.85	1.37	1.12
myo-inositol	ME456218	0.71	1.17	0.82	1.14	1.02	1.39	0.88	1.17	1.11
phosphocreatine	ME456213	0.74	1.07	0.95	1.13	0.89	1.25	0.93	1.27	1.01
glucose	ME456153	0.76	0.92	0.94	1.00	0.89	1.13	1.22	1.23	1.14
argininosuccinate	ME456231	0.75	1.04	0.89	1.14	1.29	1.16	0.92	1.04	1.13
succinate	ME456199	0.82	1.13	1.01	1.02	1.17	1.06	0.95	1.00	1.08
alpha-ketoglutarate	ME456207	0.88	1.04	1.11	1.01	1.02	1.00	1.11	0.94	1.04
dTTP	ME456232	0.91	1.05	1.02	1.02	1.03	0.99	1.05	1.06	0.96
glycine_13C2-15N	ME456172	0.90	1.14	0.98	1.03	1.05	0.97	1.06	0.98	0.95
glutamine	ME456160	0.65	1.24	0.99	1.21	0.98	1.08	1.22	1.17	0.99
arginine_13C6-15N4	ME456262	0.64	1.23	0.91	1.17	1.19	1.03	1.20	1.22	1.00
histidine_13C6-15N3	ME456147	0.65	1.23	0.92	1.16	1.07	1.03	1.23	1.25	1.02
adenosine_unc	ME456067	0.68	1.26	0.94	1.32	1.15	0.94	1.09	1.09	1.06
arginine	ME456261	0.65	1.27	0.94	1.16	1.22	1.13	1.10	1.09	1.03
cis-aconitate	ME456247	0.72	1.25	0.83	1.17	1.14	1.05	1.07	1.13	1.03
S-adenosylmethionine	ME456187	0.78	1.14	0.81	1.11	1.03	1.15	1.20	1.00	1.02
GSH_13C2-15N-Ellmans	ME456188	0.73	1.24	0.88	1.10	1.11	1.00	1.19	1.08	0.96
proline_13C5-15N	ME456122	0.76	1.25	0.90	1.06	1.05	1.07	1.14	1.00	1.01
valine-13C5-15N	ME456118	0.66	1.14	1.05	1.24	1.08	1.10	1.07	0.99	1.16
isoleucine_13C6-15N	ME456099	0.73	1.14	1.00	1.24	1.05	1.04	1.03	0.99	1.08
leucine_13C6-15N	ME456092	0.75	1.08	1.00	1.30	1.09	1.04	1.00	0.96	1.08
phenylalanine-13C9-15N	ME456084	0.76	1.07	0.98	1.19	1.08	1.03	1.08	1.05	1.01
2-hydroxyglutarate	ME456201	0.72	1.16	0.99	1.13	1.16	1.02	1.13	1.02	1.06
itaconic_acid	ME456196	0.79	1.11	0.99	1.11	1.13	1.01	1.10	0.96	1.05
ascorbate	ME456157	0.77	1.14	0.98	1.08	1.05	1.04	1.10	1.07	1.01
aspartate_13C4-15N	ME456191	0.75	1.09	1.00	1.05	1.08	1.03	1.09	1.14	1.03
glutamate_13C5-15N	ME456183	0.68	1.12	1.06	1.09	1.07	1.07	1.16	1.15	1.02
lysine_13C6-15N2	ME456260	0.68	1.15	0.97	1.11	1.13	1.03	1.15	1.14	1.08
serine_13C3-15N	ME456176	0.71	1.06	1.05	1.13	1.03	1.11	1.05	1.07	1.12
glycerate	ME456125	0.68	1.20	0.98	1.10	1.05	1.13	1.07	1.16	1.07
alanine_13C3-15N	ME456152	0.75	1.13	0.94	1.12	1.02	1.04	1.08	1.10	1.10
threonine_13C4-15N	ME456144	0.68	1.15	0.99	1.17	1.01	1.08	1.11	1.11	1.14
orotate	ME456101	0.99	1.13	0.65	1.31	0.90	1.08	0.92	1.01	0.99
phosphoenolpyruvate	ME456250	0.99	1.27	0.76	0.84	0.95	1.07	0.94	1.09	1.12
acetylserine	ME456107	0.84	1.42	0.78	1.03	0.87	1.03	1.03	1.10	0.99
valine	ME456117	0.90	1.37	0.88	1.02	0.91	1.08	0.93	0.90	1.05
histidine	ME456146	0.77	1.23	0.84	1.13	0.85	1.03	1.11	1.22	1.02
N-acetylglutamine	ME456106	0.77	1.42	0.68	1.27	0.73	1.08	1.15	1.08	0.96
tyrosine	ME456126	0.68	1.76	0.99	0.98	0.97	1.27	0.80	0.71	1.20
saccharopine_unc	ME456206	0.70	1.61	0.73	1.27	0.77	1.29	0.97	0.94	0.94
alanine	ME456151	0.78	1.51	0.71	1.02	1.03	1.21	0.95	0.95	1.08
N2-acetyllysine	ME456128	0.77	1.66	0.76	0.99	0.92	1.22	1.07	0.83	0.92
tryptophan	ME456104	0.71	1.53	1.05	1.29	1.04	1.20	0.73	0.76	0.99
threonine	ME456143	0.71	1.48	1.00	1.18	1.18	1.01	1.00	0.77	1.01
serine	ME456175	0.70	1.59	0.98	1.21	0.96	0.98	0.90	0.94	1.04
lysine	ME456259	0.68	1.42	0.93	1.14	1.05	1.07	1.06	1.00	1.08
methionine	ME456103	0.73	1.38	0.92	1.28	0.93	1.09	1.03	0.94	0.92
phenylalanine	ME456083	0.75	1.36	0.92	1.16	0.96	1.22	0.86	0.95	1.07
isoleucine	ME456098	0.72	1.45	0.90	1.10	0.97	1.23	0.85	0.89	1.20
leucine	ME456091	0.71	1.39	0.95	1.20	0.94	1.13	0.85	0.93	1.24
asparagine	ME456164	0.70	1.53	0.83	1.09	1.00	1.04	0.87	1.08	1.21
uric_acid	ME456135	0.74	1.40	0.76	0.97	1.11	1.18	0.86	1.02	1.32
C5_carnitines	ME456057	0.99	1.13	0.68	0.86	0.78	1.22	0.86	0.85	1.79
anserine_unc	ME456145	0.77	1.41	0.51	0.64	1.14	1.59	0.83	0.99	1.52
taurine	ME456162	0.64	1.39	0.79	0.77	1.25	1.36	0.93	0.94	1.72
propionylcarnitine	ME456078	0.91	1.33	0.81	0.78	0.94	1.62	1.04	0.59	1.03
ribose_ribulose_5-phosphate	ME456214	1.07	0.87	0.75	0.52	1.09	1.43	1.03	0.85	1.16
ribose_1-phosphate_unc	ME456202	0.94	0.93	0.78	0.60	1.32	1.60	0.87	0.82	1.32
thimethyllysine	ME456215	0.90	1.03	0.77	0.71	1.27	1.54	0.84	0.76	1.27
butyryl_carnitine	ME456061	0.91	1.18	0.79	0.83	1.05	1.51	0.89	0.81	1.14
guanidinoacetate	ME456180	0.81	1.24	0.70	0.89	1.19	1.46	0.87	0.78	1.40
xanthosine_unc	ME456130	0.58	NA	0.48	NA	1.11	0.77	NA	NA	2.29
hypotaurine	ME456161	0.53	0.75	0.39	NA	0.44	1.54	1.24	0.56	2.22
IMP	ME456209	0.72	1.35	0.26	0.14	0.96	1.67	0.70	0.67	2.62
ADP	ME456197	1.04	1.44	0.54	0.23	3.26	1.00	0.67	0.71	1.36
NAD	ME456165	1.28	1.06	0.34	NA	1.79	2.65	0.34	NA	1.07

Factors:

F1	Factor:-
F2	Factor:female 24h
F3	Factor:female 48h
F4	Factor:female 4h
F5	Factor:female ctl
F6	Factor:male 24h
F7	Factor:male 48h
F8	Factor:male 4h
F9	Factor:male ctl

Data matrix