Data for Differences in metabolism in mouse embryonic fibroblasts (control vs SCF-beta-TrCP knockout) (Study ST000701)

(Analysis AN001090)

Values for each metabolite have been scaled by dividing by the mean across all factors

Run Hierarchial cluster analysis on this study | Run Heatmap cluster analysis on this study

MetaboliteF1F2F3F4F5F6F7
1-AMINOCYCLOPROPANE-1-CARBOXYLIC ACID NA 1.0805 0.9587 NA 0.9608 NA NA
3-METHOXYTYROSINE NA 0.9218 1.0845 NA 0.9937 NA NA
4-ACETAMIDOBUTANOATE NA 0.9605 1.0686 NA 0.9709 NA NA
4-METHYL-2-OXOPENTANOATE (2M+H) NA 0.9930 1.0952 NA 0.9118 NA NA
4-PYRIDOXIC ACID NA 1.3943 0.8708 NA 0.7350 NA NA
5-AMINOPENTANOIC ACID NA 1.1084 0.8340 NA 1.0576 NA NA
5-HYDROXYINDOLEACETIC ACID NA 0.3368 1.4870 NA 1.1762 NA NA
5-METHYLCYTOSINE NA 0.9892 1.1012 NA 0.9095 NA NA
5-OXOPROLINE NA 0.8248 1.3391 NA 0.8362 NA NA
5-OXOPROLINE + 1.1064999 NA NA 1.0000 NA NA NA NA
5-OXOPROLINE + 1.193 NA 1.0000 NA NA NA NA NA
5-OXOPROLINE + 1.1945 NA 1.0000 NA NA NA NA NA
5-OXOPROLINE + 1.1962668 NA 0.9208 0.9579 NA 1.1213 NA NA
ASPARAGINE (2M+H) NA 0.8626 1.0105 NA 1.1268 NA NA
AZELAIC ACID (M+Na) NA 0.8035 1.3787 NA 0.8178 NA NA
CORTISONE (M+Na) NA NA 1.0000 NA NA NA NA
CREATINE NA 1.3759 0.9831 NA 0.6409 NA NA
CYTIDINE + 0.84499997 NA 0.9991 0.6783 NA 1.3226 NA NA
CYTIDINE + 0.9324 NA 1.4205 0.7816 NA 0.7979 NA NA
CYTIDINE (2M+Na) NA 0.6312 0.5107 NA 1.8581 NA NA
DEOXYCYTIDINE NA 0.1362 1.7805 NA 1.0833 NA NA
DEOXYCYTIDINE + 0.94733334 NA 0.2222 2.5035 NA 0.2743 NA NA
DEOXYCYTIDINE + 0.95839995 NA 0.7453 1.6252 NA 0.6295 NA NA
DIOCTYL PHTHALATE + 23.077934 NA 1.0564 1.0366 NA 0.9070 NA NA
DIOCTYL PHTHALATE + 23.0814 NA 1.0103 1.1022 NA 0.8875 NA NA
DIOCTYL PHTHALATE (2M+Na) NA 1.1198 1.1164 NA 0.7638 NA NA
DL-3-AMINO-ISOBUTANOIC ACID NA 1.0631 1.0351 NA 0.9018 NA NA
DL-PIPECOLIC ACID NA 0.9135 0.9344 NA 1.1522 NA NA
DL-PIPECOLIC ACID + 0.94628567 NA 1.1464 0.8536 NA NA NA NA
D-PSICOSE NA 1.4071 0.6528 NA 0.9401 NA NA
D-SORBITOL (M+Na) NA 1.6248 0.8546 NA 0.5206 NA NA
FOLIC ACID NA 0.7489 1.2422 NA 1.0089 NA NA
GLUCOSE + 0.677 NA NA NA NA 1.0000 NA NA
GLUCOSE (2M+Na) NA 1.3410 1.0614 NA 0.5976 NA NA
GUANINE NA 1.9280 0.3923 NA 0.6798 NA NA
HIPPURIC ACID NA 0.7175 1.2038 NA 1.0787 NA NA
HYPOXANTHINE NA 1.9490 0.4685 NA 0.5825 NA NA
ISOLEUCINE NA 0.8346 1.1222 NA 1.0432 NA NA
KYNURENINE NA 0.8804 1.1025 NA 1.0171 NA NA
L-CARNITINE NA 0.9466 1.0489 NA 1.0045 NA NA
L-CARNITINE + 0.7405333 NA 1.0014 0.9991 NA 0.9995 NA NA
METHIONINE NA 1.0181 0.9709 NA 1.0110 NA NA
METHYL JASMONATE (M+Na) NA 1.0279 1.1296 NA 0.8425 NA NA
N-ACETYLGALACTOSAMINE (M+Na) NA 1.1073 1.1039 NA 0.7888 NA NA
N-CYCLOHEXYLFORMAMIDE NA 0.9999 0.7675 NA 1.2326 NA NA
NICOTINAMIDE NA 0.9910 NA NA 1.0090 NA NA
O-ACETYLCARNITINE NA 1.1356 0.9718 NA 0.8927 NA NA
PANTOTHENIC ACID + 3.2942002 NA 0.9465 1.0749 NA 0.9786 NA NA
PANTOTHENIC ACID + 3.2942002 :5 NA 0.9514 1.0800 NA 0.9686 NA NA
PANTOTHENIC ACID (-H2O) NA 0.9843 1.0054 NA 1.0103 NA NA
PIMELIC ACID (2M+H) NA 0.7225 1.3801 NA 0.8975 NA NA
PROLINE NA 0.3425 1.0871 NA 1.5704 NA NA
RIBOFLAVIN (VITAMIN B2) NA 0.8982 1.0470 NA 1.0549 NA NA
RIBOFLAVIN (VITAMIN B2) + 7.631134 NA 0.9180 1.0454 NA 1.0366 NA NA
SALICYLAMIDE NA 0.9331 1.1359 NA 0.9311 NA NA
SORBITOL (M+Na) NA 1.0871 1.0345 NA 0.8784 NA NA
THYMIDINE (M+Na) NA 0.7183 0.8103 NA 1.4714 NA NA
TRYPTOPHAN NA 1.0000 1.0738 NA 0.9262 NA NA
TYROSINE NA 1.0080 1.0200 NA 0.9720 NA NA
TYROSINE + 1.2937 NA 0.9709 1.0291 NA NA NA NA
URIDINE + 1.3391539 NA 0.7992 0.6715 NA 1.5293 NA NA
URIDINE (M+Na) NA 0.8026 0.6400 NA 1.5574 NA NA
UROCANIC ACID NA 0.4754 1.3203 NA 1.2043 NA NA
VALINE NA 1.0485 0.9632 NA 0.9884 NA NA
XANTHOSINE NA 0.5510 1.0220 NA 1.4270 NA NA
XANTHOSINE + 2.3653998 NA 0.7794 1.1681 NA 1.0525 NA NA
Run Hierarchial cluster analysis on this study | Run Heatmap cluster analysis on this study

Factors:

F1GENOTYPE:Control | Sample type:Fibroblasts
F2GENOTYPE:Control | Sample type:Fresh media
F3GENOTYPE:Control | Sample type:Spent media
F4GENOTYPE:Knockout | Sample type:Fibroblasts
F5GENOTYPE:Knockout | Sample type:Spent media
F6GENOTYPE:Pooled | Sample type:Fibroblasts
F7GENOTYPE:Pooled | Sample type:Spent media
  logo