metabolite_name	SN_1	SN_2	SN_3	SN inoculated WT-8h_1	SN inoculated WT-8h_2	SN inoculated WT-8h_3	SN inoculated mFabT-8h_1	SN inoculated mFabT-8h_2	SN inoculated mFabT-8h_3	SN inoculated WT-16h_1	SN inoculated WT-16h_2	SN inoculated WT-16h_3	SN inoculated mFabT-16h_1	SN inoculated mFabT-16h_2	SN inoculated mFabT-16h_3	RPMI_1	RPMI_2	RPMI_3
Trigonelline	0.05	0.045	0.03	0.07	0.035	0.026	0.039	0.06	0.072	0.073	0.069	0.067	0.04	0.052	0.052	0.029	0.029	0.047
TMAO	0.071	0.032	0.036	0.014	0.067	0.036	0.119	0.031	0.086	0.038	0.038	0.045	0.039	0.049	0.042	0.09	0.093	0.044
Ala	38.2	37	39.9	37.4	30.5	39.2	37.7	36.7	38.1	37.1	31.9	39	35.1	31.5	36.6	1.28	1.31	1.31
Arg	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity	Infinity
Asn	375	375	353	392	328	381	394	378	352	371	351	381	341	301	304	290	242	320
Asp	155	158	154	162	165	168	170	175	164	211	163	183	174	182	189	121	103	134
Cys	606	667	590	796	592	582	648	707	621	696	553	636	713	536	530	487	454	480
Gln	4.13	5.16	4.55	3.44	1.78	3.24	2.88	1.75	1.6	1.58	2.6	2.17	1.42	1.4	1.44	1.41	1.41	1.41
Glu	195	190	182	197	172	196	210	191	182	219	184	196	184	162	174	108	90.6	115
Gly	180	180	173	185	164	180	185	186	175	190	167	181	172	160	165	104	90	115
His	85.5	86.4	82.5	93.6	83.5	89.6	91.8	91.3	87.5	92.1	82.4	89.9	83.4	80	82.1	66.9	56.6	73.3
Ile	344	357	333	369	328	365	357	367	348	374	330	371	332	307	328	305	255	332
Leu	325	334	321	361	311	349	349	372	337	363	320	359	322	314	323	298	243	319
Lys	200	199	197	213	188	210	211	218	200	216	195	214	190	183	187	160	133	169
Met	60.2	59.5	58.6	63.6	55.7	63.9	63.8	64.7	61.4	66.6	57.5	63.5	59.2	56.4	58.7	45.9	39.5	51.1
Phe	84.3	87.5	86.8	93.6	80.9	89	89.1	92.6	86.2	94.7	84.4	92.2	82.6	80.3	81.2	67.5	59.4	76.4
Pro	159	161	154	169	152	165	165	173	163	169	155	173	155	148	153	127	107	136
Ser	198	210	200	226	196	217	224	229	215	223	206	220	202	192	198	215	183	228
Thr	164	167	158	172	156	173	170	172	169	177	155	173	158	151	153	130	109	140
Trp	12.8	12.4	12.1	13.2	11.6	12.8	13	12.8	12.7	13.6	11.5	13.1	11.9	11.3	12	10.3	8.48	11.4
Tyr	97.8	98.9	95.6	103	92.4	103	105	105	99.8	108	94	105	93.8	90.6	93.8	77.2	66.1	83.4
Val	145	146	144	154	135	153	151	157	145	156	142	153	138	135	142	127	106	133
1-Met-His	0.352	0.362	0.358	0.373	0.339	0.399	0.358	0.385	0.369	0.368	0.333	0.353	0.364	0.327	0.331	0.268	0.246	0.31
3-Met-His	0.042	0.031	0.039	0.041	0.036	0.046	0.048	0.048	0.042	0.05	0.034	0.026	0.041	0.035	0.035	0.025	0.024	0.03
5-AVA	0.015	0.014	0.012	0.014	0.012	0.013	0.012	0.398	0.015	0.013	0.013	0.014	0.012	0.012	0.011	0.012	0.012	0.009
AABA	0.153	0.159	0.151	0.154	0.147	0.151	0.156	0.183	0.147	0.161	0.146	0.155	0.147	0.148	0.151	0.15	0.166	0.154
Ac-Orn	0.015	0.006	0.023	0.022	0.042	0.012	0.017	0.028	0.024	0.01	0.024	0.023	0.016	0.01	0.014	0.012	0.026	0.008
ADMA	0.166	0.136	0.136	0.155	0.127	0.138	0.15	0.139	0.139	0.159	0.133	0.149	0.147	0.138	0.132	0	0.005	0
alpha-AAA	0.474	0.39	0.387	0.441	0.321	0.358	0.466	0.376	0.347	0.485	0.349	0.373	0.42	0.306	0.319	0.002	0.005	0.007
Anserine	0.029	0.037	0.03	0.036	0.03	0.033	0.029	0.038	0.029	0.031	0.034	0.029	0.031	0.035	0.036	0.033	0.031	0.032
BABA	0.009	0.009	0.011	0.017	0.012	0.017	0.014	0.012	0.015	0.016	0.013	0.012	0.011	0.011	0.011	0.005	0.005	0.008
Betaine	4.73	4.33	4.37	4.7	4.04	4.36	4.53	4.55	4.34	4.7	4.16	4.36	3.66	3.95	4.41	3.81	4.39	4.19
c4-OH-Pro	0.159	0.222	0.202	0.179	0.245	0.257	0.244	0.234	0.141	0.242	0.203	0.224	0.105	0.134	0.184	0.132	0.138	0.195
Carnosine	0.056	0.055	0.059	0.057	0.056	0.057	0.057	0.058	0.054	0.057	0.057	0.058	0.055	0.055	0.058	0.055	0.056	0.056
Cit	0.306	0.342	0.301	0.28	0.305	0.294	0.288	0.331	0.311	0.558	0.312	0.328	0.466	0.55	0.617	0.329	0.293	0.303
Creatinine	1.72	1.29	1.67	1.28	1.54	1.51	1.32	1.6	1.57	1.56	1.71	1.68	1.5	1.5	1.68	1.39	1.48	1.56
Cystine	199	208	198	191	193	215	215	199	221	216	208	229	179	190	206	158	96.9	177
DOPA	0.078	0.073	0.071	0.083	0.076	0.086	0.078	0.094	0.097	0.086	0.081	0.095	0.078	0.089	0.085	0.061	0.06	0.062
HArg	0.007	0.008	0.005	0.001	0.001	0.006	0.009	0.008	0.005	0.002	0.006	0.004	0.007	0.005	0.002	0.006	0.006	0.002
HCys	2.53	2.59	2.37	2.57	2.25	2.44	2.39	2.32	2.23	2.43	1.83	2.32	2.35	1.94	2.07	1.42	1.59	1.53
Kynurenine	1.4	1.5	1.44	1.53	1.44	1.52	1.55	1.63	1.42	1.59	1.45	1.61	1.36	1.43	1.39	1.1	0.87	1.21
Met-SO	34.1	35.2	33.7	37	34.4	36.9	36.5	37.4	36	36.8	34.4	37.4	33.4	32.5	32.9	29	24.4	31
Nitro-Tyr	0.102	0.11	0.113	0.094	0.091	0.114	0.1	0.108	0.107	0.105	0.102	0.086	0.102	0.092	0.104	0.094	0.088	0.093
Orn	12.7	11.9	10.4	11.9	9.9	9.92	11.8	11.4	10.2	12.1	9.94	10.1	11.1	9.26	9.11	0.485	0.545	0.575
PAG	0.055	0.074	0.049	0.058	0.074	0.125	0.152	0.091	0.056	0.115	0.073	0.116	0.074	0.063	0.128	0.074	0.106	0.047
PheAlaBetaine	0.006	0.006	0.005	0.007	0.006	0.007	0.007	0.005	0.006	0.006	0.007	0.007	0.006	0.006	0.005	0.006	0.007	0.007
ProBetaine	0.157	0.16	0.166	0.159	0.16	0.159	0.163	0.162	0.163	0.161	0.159	0.156	0.164	0.157	0.162	0.153	0.152	0.161
Sarcosine	0.072	0.072	0.08	0.074	0.068	0.072	0.071	0.085	0.066	0.074	0.063	0.079	0.066	0.067	0.068	0.063	0.056	0.059
SDMA	0.033	0.032	0.028	0.035	0.028	0.036	0.035	0.035	0.03	0.033	0.032	0.028	0.032	0.031	0.031	0.01	0.01	0.01
t4-OH-Pro	149	147	144	158	137	149	153	158	148	157	144	157	146	139	145	114	95.1	119
Taurine	0.772	1.07	0.833	0.76	0.993	0.804	0.798	1.23	0.791	0.802	0.946	0.858	0.69	0.973	0.751	0.16	0.164	0.165
TrpBetaine	0.007	0.01	0.02	0.01	0.006	0.01	0.008	0.012	0.009	0.012	0.011	0.011	0.008	0.007	0.005	0.004	0.013	0.013
CA	0.005	0.007	0.004	0.009	0.008	0.007	0.006	0.027	0.006	0.007	0.006	0.005	0.005	0.008	0.007	0.014	0.007	0.008
CDCA	0.004	0.076	0.063	0	0.009	0.029	0.037	0.008	0.059	0.013	0.007	0.014	0.012	0.008	0.013	0.009	0.004	0.034
DCA	0.003	0.002	0.003	0.001	0.004	0.004	0.003	0	0.003	0.002	0.002	0.005	0.004	0.004	0.004	0.009	0.005	0.003
GCA	0.022	0.023	0.016	0.012	0.013	0.012	0.013	0.017	0.019	0.01	0.017	0.019	0.015	0.01	0.019	0.025	0.017	0.016
GCDCA	0.002	0.001	0.001	0.003	0.001	0.002	0.001	0.001	0.002	0.002	0.002	0.001	0.001	0.001	0.002	0.001	0	0.001
GDCA	0.001	0.001	0.001	0.001	0.002	0.002	0.001	0	0.001	0.002	0.001	0.002	0.002	0.001	0	0.001	0.002	0.001
GLCA	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.002	0.002	0.002	0.001	0.002	0.002	0.001	0.001	0.002	0.001	0.001	0.002	0.001
GLCAS	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
GUDCA	0.013	0.009	0.01	0.016	0.002	0.017	0.003	0.004	0.013	0.003	0.016	0.012	0.004	0.015	0.011	0.004	0.01	0.016
TCA	0.088	0.094	0.088	0.099	0.088	0.096	0.089	0.093	0.094	0.096	0.087	0.089	0.09	0.082	0.09	0.078	0.074	0.081
TCDCA	0.007	0.006	0.008	0.001	0.008	0.009	0.007	0.004	0.006	0.008	0.001	0.007	0.007	0.007	0.01	0.005	0.008	0.007
TDCA	0.001	0	0	0.001	0.001	0	0	0.001	0.001	0.001	0	0.001	0.001	0	0.001	0.001	0.001	0
TLCA	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0	0.001	0	0.001	0.001
TMCA	0	0	0	0.001	0	0	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0	0	0.001	0	0.001	0.001	0
beta-Ala	5.7	7.11	5.07	6.1	6.92	4.57	5.99	7.23	5.33	6.29	6.41	4.6	6	6.04	4.99	1.36	1.39	1.33
Dopamine	0.1	0.105	0.108	0.107	0.096	0.102	0.101	0.098	0.103	0.102	0.101	0.101	0.099	0.099	0.106	0.096	0.104	0.103
GABA	0.05	0.059	0.041	0.051	0.05	0.054	0.06	0.084	0.047	0.052	0.048	0.057	0.048	0.042	0.046	0.033	0.039	0.042
Histamine	0.173	0.172	0.174	0.175	0.171	0.173	0.173	0.247	0.173	0.175	0.172	0.175	0.171	0.171	0.172	0.173	0.166	0.173
PEA	0	0	0	0	0	0	0	0.027	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Putrescine	0.026	0.021	0.033	0.023	0.016	0.034	0.022	0.508	0.031	0.021	0.016	0.036	0.019	0.021	0.023	0.075	0.036	0.021
Serotonin	0.016	0.016	0.016	0.015	0.014	0.015	0.015	0.015	0.016	0.015	0.016	0.014	0.015	0.018	0.016	0.014	0.015	0.015
Spermidine	0.09	0.093	0.097	0.088	0.088	0.093	0.088	0.089	0.087	0.087	0.089	0.092	0.086	0.087	0.088	0.092	0.09	0.09
Spermine	0.099	0.099	0.102	0.095	0.096	0.097	0.09	0.096	0.097	0.095	0.085	0.097	0.094	0.095	0.099	0.094	0.097	0.097
AconAcid	0.083	0.068	0.071	0.073	0.061	0.079	0.073	0.077	0.075	0.078	0.072	0.072	0.067	0.069	0.065	0.05	0.051	0.047
DiCA(12:0)	0.083	0.058	0.118	0.137	0.085	0.096	0.068	0.151	0.12	0.083	0.09	0.117	0.109	0.062	0.068	0.055	0.118	0.113
DiCA(14:0)	0.072	0.073	0.061	0.07	0.065	0.078	0.054	0.067	0.054	0.05	0.042	0.063	0.048	0.065	0.065	0.045	0.055	0.046
HipAcid	0.596	0.428	0.351	0.441	0.198	0.403	0.28	0.414	0.124	0.261	0.298	0.253	0.271	0.41	0.433	0.24	0.441	0.478
Lac	2443	2503	2419	2393	2356	2300	2506	2655	2429	2826	2220	2443	2540	2739	2608	40.8	49.7	61.2
OH-GlutAcid	0.222	0.236	0.205	0.245	0.212	0.206	0.225	0.24	0.228	0.236	0.207	0.22	0.201	0.209	0.196	0.164	0.152	0.172
Suc	0.44	0.418	0.408	0.454	0.426	0.443	0.388	0.485	0.443	0.454	0.413	0.38	0.392	0.363	0.389	0.4	0.37	0.32
p-Cresol-SO4	0.013	0.016	0.012	0.016	0.012	0.015	0.032	0.011	0.014	0.015	0.014	0.025	0.014	0.01	0.017	0.008	0.019	0.013
AbsAcid	0.012	0.012	0.011	0.008	0.012	0.016	0.011	0.007	0.017	0.006	0.024	0.017	0.006	0.011	0.019	0.014	0.003	0.016
Cortisol	0.035	0.03	0.024	0.031	0.025	0.022	0.017	0.027	0.021	0.032	0.022	0.032	0.026	0.019	0.018	0.022	0.019	0.023
Cortisone	0.053	0.049	0.029	0.041	0.042	0.043	0.041	0.036	0.032	0.035	0.041	0.043	0.045	0.036	0.044	0.039	0.042	0.039
DHEAS	0.014	0.013	0.012	0.013	0.012	0.012	0.012	0.012	0.013	0.014	0.013	0.012	0.013	0.012	0.014	0.013	0.013	0.012
3-IAA	0.129	0.104	0.09	0.081	0.089	0.114	0.09	0.074	0.113	0.091	0.078	0.085	0.089	0.08	0.1	0.095	0.093	0.129
3-IPA	0.013	0.011	0.013	0.008	0.009	0.013	0.008	0.017	0.011	0.011	0.01	0.011	0.008	0.009	0.012	0.011	0.011	0.01
Ind-SO4	0.004	0.001	0.003	0.003	0.004	0.004	0.003	0.009	0.001	0.004	0.007	0.006	0.005	0.003	0.005	0.003	0.003	0.008
Indole	106	93.8	98.8	102	96.9	88.7	102	106	75.4	107	90.9	94.8	92.2	69.5	83.2	96.7	85.2	89.3
Hypoxanthine	0.171	0.248	0.186	0.148	0.07	0.092	0.122	0.078	0.087	0.078	0.143	0.085	0.075	0.068	0.063	0.044	0.056	0.062
Xanthine	0.338	0.374	0.317	0.305	0.106	0.241	0.281	0.137	0.102	0.097	0.26	0.182	0.082	0.067	0.087	0.055	0.069	0.057
H1	9672	9746	9962	10393	9172	10093	10243	9859	10215	10244	9217	10213	9411	8581	8967	8212	6915	8642
Choline	13.1	13.3	13.1	14.4	12.7	13.7	14.1	14.4	13.5	14	12.7	14.4	13.2	12.3	12.8	11.2	10.1	12.3

metabolite_name	Class	Limit of detection [µM]
Trigonelline	Alkaloids	0.393
TMAO	Amine Oxides	0.297
Ala	Aminoacids	469
Arg	Aminoacids	81.3
Asn	Aminoacids	102
Asp	Aminoacids	153
Cys	Aminoacids	2084
Gln	Aminoacids	112
Glu	Aminoacids	386
Gly	Aminoacids	103
His	Aminoacids	20.1
Ile	Aminoacids	205
Leu	Aminoacids	377
Lys	Aminoacids	104
Met	Aminoacids	44.6
Phe	Aminoacids	126
Pro	Aminoacids	93.8
Ser	Aminoacids	156
Thr	Aminoacids	116
Trp	Aminoacids	18.5
Tyr	Aminoacids	42.2
Val	Aminoacids	242
1-Met-His	Aminoacids Related	0.073
3-Met-His	Aminoacids Related	0.034
5-AVA	Aminoacids Related	5.02
AABA	Aminoacids Related	13
Ac-Orn	Aminoacids Related	0.559
ADMA	Aminoacids Related	0.379
alpha-AAA	Aminoacids Related	1.15
Anserine	Aminoacids Related	0.205
BABA	Aminoacids Related	0.155
Betaine	Aminoacids Related	72
c4-OH-Pro	Aminoacids Related	2.03
Carnosine	Aminoacids Related	0.209
Cit	Aminoacids Related	18.7
Creatinine	Aminoacids Related	4.62
Cystine	Aminoacids Related	0.315
DOPA	Aminoacids Related	0.206
HArg	Aminoacids Related	0.099
HCys	Aminoacids Related	26.5
Kynurenine	Aminoacids Related	0.285
Met-SO	Aminoacids Related	27.9
Nitro-Tyr	Aminoacids Related	0.235
Orn	Aminoacids Related	27.2
PAG	Aminoacids Related	0.29
PheAlaBetaine	Aminoacids Related	0.015
ProBetaine	Aminoacids Related	0.543
Sarcosine	Aminoacids Related	0.125
SDMA	Aminoacids Related	0.187
t4-OH-Pro	Aminoacids Related	3.76
Taurine	Aminoacids Related	19.3
TrpBetaine	Aminoacids Related	0.03
CA	Bile Acids	0.024
CDCA	Bile Acids	0.074
DCA	Bile Acids	0.011
GCA	Bile Acids	0.072
GCDCA	Bile Acids	0.013
GDCA	Bile Acids	0.008
GLCA	Bile Acids	0.003
GLCAS	Bile Acids	0
GUDCA	Bile Acids	0.009
TCA	Bile Acids	0.109
TCDCA	Bile Acids	0.009
TDCA	Bile Acids	0.002
TLCA	Bile Acids	0.001
TMCA	Bile Acids	0.002
beta-Ala	Biogenic Amines	38
Dopamine	Biogenic Amines	0.322
GABA	Biogenic Amines	11.1
Histamine	Biogenic Amines	0.513
PEA	Biogenic Amines	0.139
Putrescine	Biogenic Amines	0.07
Serotonin	Biogenic Amines	0.077
Spermidine	Biogenic Amines	0.847
Spermine	Biogenic Amines	0.519
AconAcid	Carboxylic Acids	0.143
DiCA(12:0)	Carboxylic Acids	0.238
DiCA(14:0)	Carboxylic Acids	0.173
HipAcid	Carboxylic Acids	1.18
Lac	Carboxylic Acids	2664
OH-GlutAcid	Carboxylic Acids	0.575
Suc	Carboxylic Acids	13.3
p-Cresol-SO4	Cresols	0.01
AbsAcid	Hormones	0.087
Cortisol	Hormones	0.122
Cortisone	Hormones	0.204
DHEAS	Hormones	0.04
3-IAA	Indoles Derivatives	0.336
3-IPA	Indoles Derivatives	0.081
Ind-SO4	Indoles Derivatives	0.014
Indole	Indoles Derivatives	353
Hypoxanthine	Nucleobases Related	5.36
Xanthine	Nucleobases Related	2.64
H1	Sugars	529
Choline	Vitamins & Cofactors	10.3