#METABOLOMICS WORKBENCH sjleigh_20240319_040753 DATATRACK_ID:4727 STUDY_ID:ST003132 ANALYSIS_ID:AN005139 VERSION 1 CREATED_ON 03-22-2024 #PROJECT PR:PROJECT_TITLE The microbiota drives diurnal rhythms in tryptophan metabolism in the stressed PR:PROJECT_TITLE gut PR:PROJECT_TYPE Untargeted metabolomics by Metabolon PR:PROJECT_SUMMARY Adult male C57Bl/6 conventional, germ-free and colonized germ-free mice PR:PROJECT_SUMMARY underwent a 15-minute restraint stress exposure. Caecal contents and colonic PR:PROJECT_SUMMARY mucosal scrapings were collected from naïve mice and stressed mice, either PR:PROJECT_SUMMARY immediately or 45 minutes following stress. Caecal contents and colonic mucosal PR:PROJECT_SUMMARY scrapings underwent untargeted metabolomics analysis. PR:INSTITUTE University College Cork PR:DEPARTMENT Psychiatry PR:LABORATORY Microbiota-Gut-Brain Axis Group PR:LAST_NAME Clarke PR:FIRST_NAME Gerard PR:ADDRESS Gaol Walk, Cork PR:EMAIL G.Clarke@ucc.ie PR:PHONE +353-21-4901408 PR:FUNDING_SOURCE The research was conducted in the APC Microbiome Ireland which is funded by PR:FUNDING_SOURCE Science Foundation Ireland (SFI/12/RC/2273). This project in part is a PR:FUNDING_SOURCE collaborative agreement (FA9550-17-1-0016) funded by European Office of PR:FUNDING_SOURCE Aerospace Research and Development, Air Force Office of Scientific Research and PR:FUNDING_SOURCE 711 Human Performance Wing, Air Force Research Laboratory. PR:DOI http://dx.doi.org/10.21228/M89M7J #STUDY ST:STUDY_TITLE Untargeted Metabolomics on Mouse colonic mucosa ST:STUDY_TYPE Mouse ST:STUDY_SUMMARY While there is strong evidence for interactions between the microbiota-gut-brain ST:STUDY_SUMMARY axis and host physiology in the context of chronic stress, limited research has ST:STUDY_SUMMARY investigated the role of the microbiome in host response to acute stress. ST:STUDY_SUMMARY Determining the underlying mechanisms by which stress-induced microbiota changes ST:STUDY_SUMMARY may provoke functional changes in the gut and brain is critical for developing ST:STUDY_SUMMARY future therapeutics to alleviate the adverse consequences of traumatic stress. ST:STUDY_SUMMARY Here, we aimed to identify a biological signature of gut metabolites that are ST:STUDY_SUMMARY significantly altered following exposure to acute restraint stress. Adult male ST:STUDY_SUMMARY C57Bl/6 conventional, germ-free and colonized germ-free mice underwent a ST:STUDY_SUMMARY 15-minute restraint stress exposure. Caecal contents were collected from naïve ST:STUDY_SUMMARY mice and stressed mice, either immediately or 45 minutes following stress. ST:STUDY_SUMMARY Colonic mucosa underwent untargeted metabolomics analysis. ST:INSTITUTE University College Cork ST:DEPARTMENT Psychiatry ST:LABORATORY Microbiota-Gut-Brain Axis Group ST:LAST_NAME Clarke ST:FIRST_NAME Gerard ST:ADDRESS Gaol Walk, Cork ST:EMAIL G.Clarke@ucc.ie ST:PHONE +353-21-4901408 ST:SUBMIT_DATE 2024-03-19 #SUBJECT SU:SUBJECT_TYPE Mammal SU:SUBJECT_SPECIES Mus musculus SU:TAXONOMY_ID 10090 SU:GENOTYPE_STRAIN C57Bl/6J SU:AGE_OR_AGE_RANGE 8-10 weeks SU:WEIGHT_OR_WEIGHT_RANGE 20-29g SU:GENDER Male SU:ANIMAL_ANIMAL_SUPPLIER Taconic SU:ANIMAL_HOUSING Gnotobiotic isolators/conventional housing SU:ANIMAL_LIGHT_CYCLE 12/12 SU:ANIMAL_FEED RM1A (P) and RM3A (P) from Special Diet Services #SUBJECT_SAMPLE_FACTORS: SUBJECT(optional)[tab]SAMPLE[tab]FACTORS(NAME:VALUE pairs separated by |)[tab]Additional sample data SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF8.1 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF8.2 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF8.3 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF8.4 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF8.5 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF8.6 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF8.7 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF9.1 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF9.2 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF9.3 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF9.4 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF9.5 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF9.6 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF9.7 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF7.1 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF7.2 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF7.3 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF7.4 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF7.5 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF7.6 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - ColGF7.7 Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv5.1 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv5.2 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv5.3 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv5.4 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv5.5 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv5.6 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv5.7 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv6.1 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv6.2 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv6.3 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv6.4 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv6.5 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv6.6 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv6.7 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv4.1 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv4.2 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv4.3 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv4.4 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv4.5 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv4.6 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - Conv4.7 Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF2.1 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF2.2 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF2.3 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF2.4 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF2.5 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF2.6 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF2.7 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF3.1 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF3.2 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF3.3 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF3.4 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF3.5 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF3.6 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF3.7 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF1.1 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF1.2 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF1.3 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF1.4 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF1.5 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF1.6 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - GF1.7 Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre #COLLECTION CO:COLLECTION_SUMMARY Upon entering the cull room, mice were immediately decapitated, trunk blood CO:COLLECTION_SUMMARY collected, and tissues harvested. Caecal contents and intestinal samples were CO:COLLECTION_SUMMARY manually dissected and stored in PCR-grade microfuge tubes at -80°C until CO:COLLECTION_SUMMARY analyses. CO:SAMPLE_TYPE Colon CO:STORAGE_CONDITIONS -80? #TREATMENT TR:TREATMENT_SUMMARY All animal work carried was approved by the Animal Experimentation Ethics TR:TREATMENT_SUMMARY Committee of University College Cork and Health Products Regulatory Authority TR:TREATMENT_SUMMARY (HPRA) before beginning this study. All experimentation was carried out in TR:TREATMENT_SUMMARY accordance with European Directive 2010/63/EU and was approved by both the TR:TREATMENT_SUMMARY Animal Experimentation Ethics Committee of University College Cork (Project TR:TREATMENT_SUMMARY Authorization AE19130/P160) and United States Air Force Surgeon General's Office TR:TREATMENT_SUMMARY of Research Oversight and Compliance. C57/BL6 mice breeding pairs were acquired TR:TREATMENT_SUMMARY from Taconic Biosciences, and F1-generation male and female offspring were used TR:TREATMENT_SUMMARY in all experiments. Germ-free, ex-germ-free, and conventional mice were housed TR:TREATMENT_SUMMARY 2-4 mice/cage under a 12-hour light/dark cycle and maintained on ad libitum TR:TREATMENT_SUMMARY autoclaved water and autoclaved, pelleted diet (Special Diet Services). Housing TR:TREATMENT_SUMMARY conditions for germ-free, conventional, and colonized germ-free adhered to the TR:TREATMENT_SUMMARY same environmental conditions of temperature (21 ± 1°C) and humidity TR:TREATMENT_SUMMARY (55%-60%). Germ-free mice were housed in gnotobiotic flexible-film isolators. TR:TREATMENT_SUMMARY Colonized germ-free mice were born and maintained as germ-free mice in TR:TREATMENT_SUMMARY gnotobiotic flexible-film isolators until postnatal day 21 when they were TR:TREATMENT_SUMMARY removed from the isolators and, for the remaining duration of this study, TR:TREATMENT_SUMMARY re-located to the standard animal facility and housed in wire-top cages that TR:TREATMENT_SUMMARY contained used-bedding from age- and sex-matched conventional mice. The acute TR:TREATMENT_SUMMARY restraint stress procedure was performed using a clean perforated polypropylene TR:TREATMENT_SUMMARY screw-cap 50 mL conical tubes. Cages were randomly assigned to either non-stress TR:TREATMENT_SUMMARY or stress groups. Each mouse that underwent stress was placed into the 50 mL TR:TREATMENT_SUMMARY tube and restrained for 15 minutes. #SAMPLEPREP SP:SAMPLEPREP_SUMMARY Samples were prepared using the automated MicroLab STAR® system from Hamilton SP:SAMPLEPREP_SUMMARY Company. Several recovery standards were added prior to the first step in the SP:SAMPLEPREP_SUMMARY extraction process for QC purposes. To remove protein, dissociate small SP:SAMPLEPREP_SUMMARY molecules bound to protein or trapped in the precipitated protein matrix, and to SP:SAMPLEPREP_SUMMARY recover chemically diverse metabolites, proteins were precipitated with methanol SP:SAMPLEPREP_SUMMARY under vigorous shaking for 2 min (Glen Mills GenoGrinder 2000) followed by SP:SAMPLEPREP_SUMMARY centrifugation. The resulting extract was divided into five fractions: two for SP:SAMPLEPREP_SUMMARY analysis by two separate reverse phase (RP)/UPLC-MS/MS methods with positive ion SP:SAMPLEPREP_SUMMARY mode electrospray ionization (ESI), one for analysis by RP/UPLC-MS/MS with SP:SAMPLEPREP_SUMMARY negative ion mode ESI, one for analysis by HILIC/UPLC-MS/MS with negative ion SP:SAMPLEPREP_SUMMARY mode ESI, and one sample was reserved for backup. Samples were placed briefly on SP:SAMPLEPREP_SUMMARY a TurboVap® (Zymark) to remove the organic solvent. The sample extracts were SP:SAMPLEPREP_SUMMARY stored overnight under nitrogen before preparation for analysis. #CHROMATOGRAPHY CH:CHROMATOGRAPHY_SUMMARY Low pH polar (LC/MS Pos early) CH:INSTRUMENT_NAME Waters Acquity CH:COLUMN_NAME Waters Acquity BEH C18 (100 x 2.1mm, 1.7um) CH:COLUMN_TEMPERATURE 40-50 CH:FLOW_GRADIENT Linear gradient from 5% B to 80% B over 3.35 minutes CH:FLOW_RATE 0.35 mL/min CH:SOLVENT_A 100% water; 0.1% formic acid; 0.05% PFPA, pH ~2.5 CH:SOLVENT_B 100% methanol; 0.1% formic acid; 0.05% PFPA, pH ~2.5 CH:CHROMATOGRAPHY_TYPE Reversed phase #ANALYSIS AN:ANALYSIS_TYPE MS #MS MS:INSTRUMENT_NAME Thermo Q Exactive Orbitrap MS:INSTRUMENT_TYPE Orbitrap MS:MS_TYPE Other MS:MS_COMMENTS Metabolon (LC/MS Pos early) MS:ION_MODE POSITIVE #MS_METABOLITE_DATA MS_METABOLITE_DATA:UNITS Raw Peak Area MS_METABOLITE_DATA_START Samples ColGF8.1 ColGF8.2 ColGF8.3 ColGF8.4 ColGF8.5 ColGF8.6 ColGF8.7 ColGF9.1 ColGF9.2 ColGF9.3 ColGF9.4 ColGF9.5 ColGF9.6 ColGF9.7 ColGF7.1 ColGF7.2 ColGF7.3 ColGF7.4 ColGF7.5 ColGF7.6 ColGF7.7 Conv5.1 Conv5.2 Conv5.3 Conv5.4 Conv5.5 Conv5.6 Conv5.7 Conv6.1 Conv6.2 Conv6.3 Conv6.4 Conv6.5 Conv6.6 Conv6.7 Conv4.1 Conv4.2 Conv4.3 Conv4.4 Conv4.5 Conv4.6 Conv4.7 GF2.1 GF2.2 GF2.3 GF2.4 GF2.5 GF2.6 GF2.7 GF3.1 GF3.2 GF3.3 GF3.4 GF3.5 GF3.6 GF3.7 GF1.1 GF1.2 GF1.3 GF1.4 GF1.5 GF1.6 GF1.7 Factors Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:ColGF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:Conv_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_0min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_45min Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre Sample source:Colonic mucosa | Factor:GF_Pre 1-methyl-4-imidazoleacetate 2401732.0000 9125003.0000 4638723.0000 3171411.0000 3415559.0000 2103467.0000 2977983.0000 3035566.0000 2304431.0000 2366537.0000 4497236.0000 3228944.0000 3293508.0000 3910507.0000 1250477.0000 2617113.0000 1185972.0000 2146600.0000 2971087.0000 3209032.0000 1994964.0000 3881040.0000 3097043.0000 3277911.0000 3129782.0000 2865051.0000 2866805.0000 3013020.0000 2705517.0000 3776290.0000 2748608.0000 3449469.0000 4740104.0000 3087619.0000 4875943.0000 3341221.0000 1733733.0000 2577930.0000 2665346.0000 2837185.0000 1592538.0000 2127925.0000 2088967.0000 2090129.0000 1895387.0000 2831439.0000 2045075.0000 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3092 phenylalanine 6140 C00079 2878 phenylalanylalanine 5488196 2909 phenylalanylglycine 98207 2898 phosphate 1061 C00009 576 picolinate 1018 C10164 910 pipecolate 849 C00408 2200 pro-hydroxy-pro 11673055 2128 proline 145742 C00148 1603 prolylglycine 6426709 2136 propionylcarnitine (C3) 107738 C03017 2590 putrescine 1045 C00134 3027 pyridoxal 1050 C00250 2343 pyridoxamine 1052 C00534 2975 pyridoxamine phosphate 1053 C00647 1932 pyroglutamine* 134508 1900 quinolinate 1066 C03722 845 (R)-3-hydroxybutyrylcarnitine 53481617 2400 riboflavin (Vitamin B2) 493570 C00255 2292 S-1-pyrroline-5-carboxylate 1196 C04322 1528 (S)-3-hydroxybutyrylcarnitine 2340 S-adenosylmethionine (SAM) 34756 C00019 3002 sarcosine 1088 C00213 1280 serine 5951 C00065 1239 serotonin 5202 C00780 2550 S-methylcysteine 24417 1955 spermidine 1102 C00315 3355 spermine 1103 C00750 3350 stachydrine 115244 C10172 1440 succinylcarnitine (C4-DC) 71464481 2291 thiamin monophosphate 3382778 C01081 2378 thiamin (Vitamin B1) 1130 C00378 3050 thioproline 93176 1250 threonine 6288 C00188 1514 tiglylcarnitine (C5:1-DC) 22833596 2962 trans-4-hydroxyproline 5810 C01157 1064 trans-urocanate 736715 C00785 2285 trigonelline (N'-methylnicotinate) 5570 C01004 1388 trimethylamine N-oxide 1145 C01104 2100 tryptamine 1150 C00398 3062 tryptophan 6305 C00078 2986 tryptophylglycine 263471 2930 tyrosine 6057 C00082 2430 urea 1176 C00086 700 valylglutamine 5253209 2295 valylleucine 352039 3138 xanthine 1188 C00385 1032 xanthurenate 5699 C02470 2236 METABOLITES_END #END