#METABOLOMICS WORKBENCH ofiehn_20130520_9415561_mwtab.txt DATATRACK_ID:47 STUDY_ID:ST000014 ANALYSIS_ID:AN000031 PROJECT_ID:PR000013 VERSION 1 CREATED_ON 2016-09-17 #PROJECT PR:PROJECT_TITLE Skeletal Muscle Treatment PR:PROJECT_TYPE MS analysis PR:PROJECT_SUMMARY - PR:INSTITUTE University of California, Davis PR:DEPARTMENT Davis Genome Center PR:LABORATORY Fiehn PR:LAST_NAME Fiehn PR:FIRST_NAME Oliver PR:ADDRESS 451 E. Health Sci. Drive, Davis, California 95616, USA PR:EMAIL ofiehn@ucdavis.edu PR:PHONE - #STUDY ST:STUDY_TITLE Skeletal Muscle Treatment (palmitate/palmitoyl carnitine) ST:STUDY_TYPE MS analysis ST:STUDY_SUMMARY Isolated skelelal muscle mitochondria incubated in the presence of fatty acid ST:STUDY_SUMMARY precursors, palmitic acid and palmitoyl carnitine ST:INSTITUTE University of California, Davis ST:DEPARTMENT Davis Genome Center ST:LABORATORY Fiehn ST:LAST_NAME Kind ST:FIRST_NAME Tobias ST:ADDRESS 451 E. Health Sci. Drive, Davis, California 95616, USA ST:EMAIL tkind@ucdavis.edu ST:PHONE - ST:NUM_GROUPS 12 ST:TOTAL_SUBJECTS 72 #SUBJECT SU:SUBJECT_TYPE Animal SU:SUBJECT_SPECIES Mus musculus SU:TAXONOMY_ID 10090 SU:AGE_OR_AGE_RANGE 0.25 years SU:GENDER male SU:ANIMAL_ANIMAL_SUPPLIER University of Ottawa, Canada Mary-Ellen Harper PhD, PI; SU:SPECIES_GROUP Mammal #SUBJECT_SAMPLE_FACTORS: SUBJECT(optional)[tab]SAMPLE[tab]FACTORS(NAME:VALUE pairs separated by |)[tab]Additional sample data SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 103879 Compartment:cytosol | Minutes:0 | Skeletal Muscle Treatment:palmitic acid 2.4 uM SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 103884 Compartment:cytosol | Minutes:0 | Skeletal Muscle Treatment:palmitic acid 2.4 uM SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 103889 Compartment:cytosol | Minutes:0 | Skeletal Muscle Treatment:palmitic acid 2.4 uM SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 103894 Compartment:cytosol | Minutes:0 | Skeletal Muscle Treatment:palmitic acid 2.4 uM SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 103899 Compartment:cytosol | Minutes:0 | Skeletal Muscle Treatment:palmitic acid 2.4 uM SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 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Pellets were resuspended in 100 ul of buffer SP:EXTRACTION_METHOD mM KCL, 20 HEPES, 5 K2HPO4, 1 EGTA, pH 7.4 at RT) SP:ORGAN skeletal muscle SP:ORGAN_SPECIFICATION total SP:CELL_TYPE myocyte SP:SUBCELLULAR_LOCATION extramitochondrial buffer #CHROMATOGRAPHY CH:CHROMATOGRAPHY_TYPE GC CH:INSTRUMENT_NAME Agilent 6890N CH:COLUMN_NAME - #ANALYSIS AN:ANALYSIS_TYPE MS #MS MS:MS_COMMENTS - MS:INSTRUMENT_NAME Leco Pegasus III GC TOF MS:INSTRUMENT_TYPE GC-TOF MS:MS_TYPE EI MS:ION_MODE POSITIVE #MS_METABOLITE_DATA MS_METABOLITE_DATA:UNITS Peak height MS_METABOLITE_DATA_START Samples 103879 103884 103889 103894 103899 103904 104003 104008 104013 104018 104023 104028 104127 104132 104137 104142 104147 104152 103941 103946 103951 103956 103961 103966 104065 104070 104075 104080 104085 104090 104189 104194 104199 104204 104209 104214 103910 103915 103920 103925 103930 103935 104034 104039 104044 104049 104054 104059 104158 104163 104168 104173 104178 104183 103972 103977 103982 103987 103992 103997 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2-hydroxyvaleric acid 1476.0000 4129.0000 2591.0000 2405.0000 2586.0000 948.0000 1318.0000 2837.0000 11140.0000 2389.0000 3325.0000 1982.0000 2539.0000 1955.0000 11229.0000 2975.0000 3284.0000 2800.0000 4195.0000 1626.0000 1598.0000 1627.0000 2056.0000 2916.0000 3193.0000 4129.0000 2932.0000 4571.0000 3124.0000 3004.0000 3016.0000 2420.0000 1820.0000 4265.0000 2249.0000 2421.0000 1530.0000 2881.0000 2411.0000 1729.0000 1944.0000 2190.0000 1063.0000 2369.0000 2746.0000 2741.0000 1313.0000 2515.0000 1864.0000 2828.0000 2195.0000 1554.0000 3971.0000 2190.0000 2278.0000 3923.0000 3423.0000 4177.0000 2119.0000 1457.0000 2432.0000 2448.0000 1799.0000 2218.0000 1999.0000 2168.0000 2152.0000 2-ketoisocaproic acid 453.0000 195.0000 512.0000 615.0000 607.0000 507.0000 307.0000 395.0000 472.0000 501.0000 592.0000 459.0000 467.0000 465.0000 606.0000 617.0000 632.0000 679.0000 555.0000 568.0000 510.0000 464.0000 499.0000 542.0000 816.0000 652.0000 773.0000 625.0000 1003.0000 537.0000 969.0000 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