#METABOLOMICS WORKBENCH amitch_20150902_9523331_mwtab.txt DATATRACK_ID:354 STUDY_ID:ST000243 ANALYSIS_ID:AN000379 PROJECT_ID:PR000196
VERSION             	1
CREATED_ON          	2016-09-17
#PROJECT
PR:PROJECT_TITLE                 	Metabolomic-based investigation on the effects of antifungal agents in Candida
PR:PROJECT_SUMMARY               	Our aim is to determine the metabolic effects of increasing doses of an
PR:PROJECT_SUMMARY               	agent on C. albicans metabolism (untargeted, steady state metabolomics). We
PR:PROJECT_SUMMARY               	culture in vitro Candida cells to the mid-logarithmic growth in liquid media
PR:PROJECT_SUMMARY               	at 37°C and then inoculate biological replicates (1ml) onto 22mm
PR:PROJECT_SUMMARY               	filters under vocuum filtration in sterile conditions. Subsequently, isolates
PR:PROJECT_SUMMARY               	be cultivated to midlogarithmic phase of growth on the same agar (RPMI-1640) to
PR:PROJECT_SUMMARY               	the antifungal agent has been added at a range of concentrations to achieve
PR:PROJECT_SUMMARY               	equivalent to 0 MIC (no drug), 0.0625 MIC, 0.125 MIC, 0.25 MIC, 0.5 MIC and 1.0
PR:PROJECT_SUMMARY               	at 37°C. At mid-logarithmic phase of growth (12h) replicates will be
PR:PROJECT_SUMMARY               	quenched by immersion into a solvent mixture of 40% acetonitrile: 40% methanol:
PR:PROJECT_SUMMARY               	water precooled at -40°C. The resulting quenched isolate/solvent mixtrue will
PR:PROJECT_SUMMARY               	mechanically lysed by bead-beating with 0.1mm Zirconia beads in a tissue
PR:PROJECT_SUMMARY               	and then centrifuged to seperate out cell wall components. Supernatants will be
PR:PROJECT_SUMMARY               	and stored at -80°C until they will be sent to SECIM facility.
PR:INSTITUTE                     	Weill Cornell Medical College
PR:DEPARTMENT                    	Medicine/Infectious Diseases
PR:LAST_NAME                     	Walsh
PR:FIRST_NAME                    	Thomas
PR:ADDRESS                       	-
PR:EMAIL                         	thw2003@med.cornell.edu
PR:PHONE                         	-
PR:FUNDING_SOURCE                	Southeastern Center for Integrated Metabolomics (SECIM) pilot and feasibility
PR:FUNDING_SOURCE                	NIH U24 DK097209
#STUDY
ST:STUDY_TITLE                   	Metabolomic-based investigation on the effects of antifungal agents in Candida
ST:STUDY_TYPE                    	in vitro study/drug dosage
ST:STUDY_SUMMARY                 	Our aim is to determine the metabolic effects of increasing doses of an
ST:STUDY_SUMMARY                 	agent on C. albicans metabolism (untargeted, steady state metabolomics). We
ST:STUDY_SUMMARY                 	culture in vitro Candida cells to the mid-logarithmic growth in liquid media
ST:STUDY_SUMMARY                 	at 37°C and then inoculate biological replicates (1ml) onto 22mm
ST:STUDY_SUMMARY                 	filters under vocuum filtration in sterile conditions. Subsequently, isolates
ST:STUDY_SUMMARY                 	be cultivated to midlogarithmic phase of growth on the same agar (RPMI-1640) to
ST:STUDY_SUMMARY                 	the antifungal agent has been added at a range of concentrations to achieve
ST:STUDY_SUMMARY                 	equivalent to 0 MIC (no drug), 0.0625 MIC, 0.125 MIC, 0.25 MIC, 0.5 MIC and 1.0
ST:STUDY_SUMMARY                 	at 37°C. At mid-logarithmic phase of growth (12h) replicates will be
ST:STUDY_SUMMARY                 	quenched by immersion into a solvent mixture of 40% acetonitrile: 40% methanol:
ST:STUDY_SUMMARY                 	water precooled at -40°C. The resulting quenched isolate/solvent mixtrue will
ST:STUDY_SUMMARY                 	mechanically lysed by bead-beating with 0.1mm Zirconia beads in a tissue
ST:STUDY_SUMMARY                 	and then centrifuged to seperate out cell wall components. Supernatants will be
ST:STUDY_SUMMARY                 	and stored at -80°C until they will be sent to SECIM facility.
ST:INSTITUTE                     	University of Florida
ST:DEPARTMENT                    	SECIM
ST:LAST_NAME                     	Katragkou
ST:FIRST_NAME                    	Aspasia
ST:ADDRESS                       	-
ST:EMAIL                         	ask2012@med.cornell.edu
ST:PHONE                         	-
ST:NUM_GROUPS                    	96
#SUBJECT
SU:SUBJECT_TYPE                  	Yeast cells
SU:SUBJECT_SPECIES               	Candida albicans
SU:TAXONOMY_ID                   	5476
SU:GENOTYPE_STRAIN               	SC5314
#SUBJECT_SAMPLE_FACTORS:         	SUBJECT(optional)[tab]SAMPLE[tab]FACTORS(NAME:VALUE pairs separated by |)[tab]Additional sample data
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SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0.25MIC_7	:0.25MIC | :2	
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SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0.5MIC_2	:0.5MIC | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0.5MIC_3	:0.5MIC | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0.5MIC_4	:0.5MIC | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0.5MIC_5	:0.5MIC | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0.5MIC_6	:0.5MIC | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0.5MIC_7	:0.5MIC | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0.5MIC_8	:0.5MIC | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0.5MIC_1	:0.5MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0.5MIC_2	:0.5MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0.5MIC_3	:0.5MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0.5MIC_4	:0.5MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0.5MIC_5	:0.5MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0.5MIC_6	:0.5MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0.5MIC_7	:0.5MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0.5MIC_8	:0.5MIC | :2	
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SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_1.0MIC_3	:1.0MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_1.0MIC_4	:1.0MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_1.0MIC_5	:1.0MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_1.0MIC_6	:1.0MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_1.0MIC_7	:1.0MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_1.0MIC_8	:1.0MIC | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0MIC_1	:no drug | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0MIC_2	:no drug | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0MIC_3	:no drug | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0MIC_4	:no drug | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0MIC_5	:no drug | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0MIC_6	:no drug | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0MIC_7	:no drug | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_1_0MIC_8	:no drug | :1	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0MIC_1	:no drug | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0MIC_2	:no drug | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0MIC_3	:no drug | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0MIC_4	:no drug | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0MIC_5	:no drug | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0MIC_6	:no drug | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0MIC_7	:no drug | :2	
SUBJECT_SAMPLE_FACTORS           	-	EXP_2_0MIC_8	:no drug | :2	
#COLLECTION
CO:COLLECTION_SUMMARY            	Culture supernatants (appx. 1 ml from each replicate) will be removed and
CO:COLLECTION_SUMMARY            	at -80C
CO:SAMPLE_TYPE                   	Cells
CO:VOLUMEORAMOUNT_COLLECTED      	1 mL
CO:STORAGE_CONDITIONS            	-80C
#TREATMENT
TR:TREATMENT_SUMMARY             	Candida cells grown to the mid-logarithmic phase will be exposed in biological
TR:TREATMENT_SUMMARY             	(X8) to the antifungal agent (micafungin) to a range of concentrations
TR:TREATMENT_SUMMARY             	of the strain's MIC, Minimal Inhibitory Concentration) 0.0625MIC 0.125MIC
TR:TREATMENT_SUMMARY             	0.5MIC 1.0MIC. No drug exposed Candida cells will serve as controls
#SAMPLEPREP
SP:SAMPLEPREP_SUMMARY            	-
SP:SAMPLEPREP_PROTOCOL_FILENAME  	Sample_Preparation_of_Cell_Lysates.pdf
#CHROMATOGRAPHY
CH:CHROMATOGRAPHY_TYPE           	Reversed phase
MS:INSTRUMENT_NAME               	Thermo Q Exactive Orbitrap
CH:COLUMN_NAME                   	ACE Excel 2 C18-PFP (100 x 2.1mm, 2um)
CH:METHODS_FILENAME              	Metabolomics_LCMSProtocol.pdf;Appendix_A_-_Internal_Standard_Prep_GLCMS.pdf
CH:INTERNAL_STANDARD             	Appendix A - Internal Standard Prep GLCMS.pdf
#ANALYSIS
AN:ANALYSIS_TYPE                 	MS
AN:LABORATORY_NAME               	Garrett Lab
AN:DETECTOR_TYPE                 	Orbitrap
#MS
MS:MS_COMMENTS                   	-
MS:INSTRUMENT_NAME               	Thermo Q Exactive Orbitrap
MS:INSTRUMENT_TYPE               	Orbitrap
MS:MS_TYPE                       	ESI
MS:ION_MODE                      	POSITIVE
#MS_METABOLITE_DATA
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4-ACETAMIDOBUTANOATE	126000.0000	325000.0000	199000.0000	299000.0000	345000.0000	263000.0000	482000.0000	207000.0000	323000.0000	234000.0000	250000.0000	140000.0000	287000.0000	82000.0000	262000.0000	290000.0000	230000.0000	317000.0000	557000.0000	421000.0000	467000.0000	446000.0000	202000.0000	236000.0000	166000.0000	285000.0000	174000.0000	157000.0000	96100.0000	311000.0000	95800.0000	142000.0000	581000.0000	640000.0000	362000.0000	325000.0000	239000.0000	385000.0000	319000.0000	491000.0000	196000.0000	232000.0000	194000.0000	411000.0000	297000.0000	173000.0000	157000.0000	284000.0000	673000.0000	580000.0000	713000.0000	367000.0000	991000.0000	696000.0000	786000.0000	655000.0000	212000.0000	150000.0000	202000.0000	217000.0000	365000.0000	214000.0000	270000.0000	330000.0000	619000.0000	595000.0000	520000.0000	10900.0000	595000.0000	677000.0000	637000.0000	738000.0000	298000.0000	308000.0000	255000.0000	143000.0000	170000.0000	269000.0000	165000.0000	260000.0000	354000.0000	139000.0000	108000.0000	338000.0000	106000.0000	342000.0000	288000.0000	234000.0000	184000.0000	190000.0000	32300.0000	191000.0000	74700.0000	139000.0000	176000.0000	184000.0000
4-AMINOBUTANOATE	27800000.0000	28800000.0000	38800000.0000	43200000.0000	54000000.0000	45000000.0000	76200000.0000	48400000.0000	59600000.0000	42900000.0000	42600000.0000	41500000.0000	52200000.0000	28200000.0000	64800000.0000	58500000.0000	37100000.0000	39700000.0000	78100000.0000	54100000.0000	77300000.0000	62100000.0000	29900000.0000	37500000.0000	43100000.0000	82200000.0000	53800000.0000	62200000.0000	54400000.0000	71700000.0000	49900000.0000	48000000.0000	58000000.0000	80500000.0000	46100000.0000	33400000.0000	37700000.0000	68300000.0000	48100000.0000	55500000.0000	58700000.0000	83600000.0000	76300000.0000	100000000.0000	82700000.0000	68600000.0000	59300000.0000	92700000.0000	111000000.0000	87000000.0000	93200000.0000	64600000.0000	105000000.0000	82500000.0000	97500000.0000	96000000.0000	74700000.0000	66800000.0000	85800000.0000	66900000.0000	106000000.0000	97800000.0000	75800000.0000	74800000.0000	72400000.0000	80500000.0000	90800000.0000	479000.0000	88800000.0000	80100000.0000	72000000.0000	108000000.0000	100000000.0000	76800000.0000	99200000.0000	59700000.0000	49100000.0000	64700000.0000	61500000.0000	73200000.0000	54300000.0000	30800000.0000	30600000.0000	52600000.0000	30500000.0000	56100000.0000	40800000.0000	32900000.0000	111000000.0000	46600000.0000	23200000.0000	66800000.0000	47000000.0000	77000000.0000	77900000.0000	86800000.0000
4-GUANIDINOBUTANOATE	1170000.0000	2000000.0000	1920000.0000	1930000.0000	2150000.0000	2270000.0000	2890000.0000	2500000.0000	4460000.0000	3770000.0000	3840000.0000	2830000.0000	2840000.0000	2210000.0000	4120000.0000	4100000.0000	2210000.0000	1400000.0000	2380000.0000	2160000.0000	2500000.0000	2110000.0000	1420000.0000	1300000.0000	3050000.0000	3720000.0000	3340000.0000	2960000.0000	2510000.0000	3820000.0000	2600000.0000	3360000.0000	2050000.0000	2580000.0000	2140000.0000	1270000.0000	1400000.0000	2200000.0000	1940000.0000	2200000.0000	3180000.0000	3360000.0000	3520000.0000	4290000.0000	4250000.0000	3880000.0000	3310000.0000	4180000.0000	3240000.0000	2960000.0000	3660000.0000	2120000.0000	3630000.0000	3070000.0000	3230000.0000	3550000.0000	3670000.0000	3200000.0000	3590000.0000	5120000.0000	5160000.0000	4160000.0000	3340000.0000	4670000.0000	2880000.0000	3190000.0000	2950000.0000	7200.0000	2390000.0000	2530000.0000	2980000.0000	3390000.0000	3530000.0000	3200000.0000	3280000.0000	2190000.0000	2580000.0000	3370000.0000	1970000.0000	3370000.0000	2000000.0000	1860000.0000	1700000.0000	2240000.0000	1640000.0000	2000000.0000	2240000.0000	1480000.0000	2760000.0000	2590000.0000	841000.0000	2250000.0000	1970000.0000	3150000.0000	2070000.0000	2320000.0000
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MS_METABOLITE_DATA_END
#METABOLITES
METABOLITES_START
metabolite_name	moverz_quant	ri	ri_type	pubchem_id	inchi_key	kegg_id	other_id	other_id_type
1-AMINOCYCLOPROPANE-1-CARBOXYLATE		0.82	UFLORIDA_MS_RI	535				UFLORIDA_FEATURE
2-AMINOPHENOL		1.87	UFLORIDA_MS_RI	491				UFLORIDA_FEATURE
3-AMINO-5-HYDROXYBENZOIC ACID	154.048	1.96	UFLORIDA_MS_RI	127115				UFLORIDA_FEATURE
3-AMINOISOBUTANOATE	104.0712	1.12	UFLORIDA_MS_RI	64956				UFLORIDA_FEATURE
3'-CMP	324.0591	1.76	UFLORIDA_MS_RI	6131				UFLORIDA_FEATURE
3-HYDROXY-3-METHYLGLUTARATE		3.01	UFLORIDA_MS_RI	1662				UFLORIDA_FEATURE
3-METHYLADENINE	150.0773	2.05	UFLORIDA_MS_RI	1673				UFLORIDA_FEATURE
3-UREIDOPROPIONATE		1.35	UFLORIDA_MS_RI	111				UFLORIDA_FEATURE
4-ACETAMIDOBUTANOATE	168.0633	3.48	UFLORIDA_MS_RI	18189				UFLORIDA_FEATURE
4-AMINOBUTANOATE		0.86	UFLORIDA_MS_RI	119				UFLORIDA_FEATURE
4-GUANIDINOBUTANOATE		1.66	UFLORIDA_MS_RI	500				UFLORIDA_FEATURE
4-IMIDAZOLEACETIC ACID	127.0504	1.11	UFLORIDA_MS_RI	96215				UFLORIDA_FEATURE
5-AMINOLEVULINIC ACID		0.81	UFLORIDA_MS_RI	137				UFLORIDA_FEATURE
5-OXO-L-PROLINE		1.9	UFLORIDA_MS_RI	7405				UFLORIDA_FEATURE
ADENINE		1.57	UFLORIDA_MS_RI	190				UFLORIDA_FEATURE
Adenosine	268.1042	5.7	UFLORIDA_MS_RI	60961		C00212		UFLORIDA_FEATURE
ADENOSINE 5'-MONOPHOSPHATE	348.0702	1.67	UFLORIDA_MS_RI	6083				UFLORIDA_FEATURE
ADP	428.0368	1.09	UFLORIDA_MS_RI	6022		C00008		UFLORIDA_FEATURE
ALLANTOIN		0.80	UFLORIDA_MS_RI	204				UFLORIDA_FEATURE
ALPHA-AMINOADIPATE		0.97	UFLORIDA_MS_RI	92136				UFLORIDA_FEATURE
arginine	175.119							UFLORIDA_FEATURE
Aspartic acid_R1	134.0451	0.96	UFLORIDA_MS_RI	5960		C16433		UFLORIDA_FEATURE
Aspartic acid_R2	134.0452	0.73	UFLORIDA_MS_RI	5960		C16433		UFLORIDA_FEATURE
BETA-ALANINE		0.79	UFLORIDA_MS_RI	239				UFLORIDA_FEATURE
BETAINE	118.0867	0.86	UFLORIDA_MS_RI	247				UFLORIDA_FEATURE
Caffeine-D3		6.74	UFLORIDA_MS_RI	13001298				UFLORIDA_FEATURE
CITRATE		1.92	UFLORIDA_MS_RI	311				UFLORIDA_FEATURE
CITRULLINE		0.84	UFLORIDA_MS_RI	9750				UFLORIDA_FEATURE
CMP		1.11	UFLORIDA_MS_RI	6131				UFLORIDA_FEATURE
Creatine-D3		0.95	UFLORIDA_MS_RI					UFLORIDA_FEATURE
CYTIDINE		1.68	UFLORIDA_MS_RI	6175				UFLORIDA_FEATURE
CYTIDINE 2',3'-CYCLIC MONO-PHOS-PHATE	306.0483	1.1	UFLORIDA_MS_RI	53481030				UFLORIDA_FEATURE
CYTOSINE		0.81	UFLORIDA_MS_RI	597				UFLORIDA_FEATURE
D-(-)-ARABINOSE	173.0426	0.81	UFLORIDA_MS_RI	66308				UFLORIDA_FEATURE
D-(+)-GLUCOSAMINE	180.0869	0.76	UFLORIDA_MS_RI	439213				UFLORIDA_FEATURE
D-GLUCOSE-6-PHOSPHATE		0.82	UFLORIDA_MS_RI	5958				UFLORIDA_FEATURE
DIETHANOLAMINE	106.0868	0.78	UFLORIDA_MS_RI	8113				UFLORIDA_FEATURE
Glutamine		0.79	UFLORIDA_MS_RI	5961				UFLORIDA_FEATURE
GLYCEROL		0.85	UFLORIDA_MS_RI	753				UFLORIDA_FEATURE
GLYCINE		0.78	UFLORIDA_MS_RI	750				UFLORIDA_FEATURE
guanine	174.0386							UFLORIDA_FEATURE
GUANOSINE	284.0989	6.01	UFLORIDA_MS_RI	6802				UFLORIDA_FEATURE
HISTAMINE	112.0874	0.75	UFLORIDA_MS_RI	774				UFLORIDA_FEATURE
Histidine	156.0773	0.7	UFLORIDA_MS_RI	6274		C00135		UFLORIDA_FEATURE
HYPOTAURINE_R1	110.0277	0.84	UFLORIDA_MS_RI	107812				UFLORIDA_FEATURE
HYPOTAURINE_R2	110.0277	0.71	UFLORIDA_MS_RI	107812				UFLORIDA_FEATURE
HYPOXANTHINE		2.05	UFLORIDA_MS_RI	790				UFLORIDA_FEATURE
ISOCITRIC ACID	215.0161	1.12	UFLORIDA_MS_RI	1198				UFLORIDA_FEATURE
L-ALLOTHREONINE		0.78	UFLORIDA_MS_RI	99289				UFLORIDA_FEATURE
L-ASPARAGINE		0.79	UFLORIDA_MS_RI	6267				UFLORIDA_FEATURE
L-CARNITINE		1.03	UFLORIDA_MS_RI	10917				UFLORIDA_FEATURE
L-CYSTATHIONINE		0.78	UFLORIDA_MS_RI	439258				UFLORIDA_FEATURE
L-CYSTEINE	122.0276	0.76	UFLORIDA_MS_RI	5862				UFLORIDA_FEATURE
Leucine-D10	142.1649	2.47	UFLORIDA_MS_RI					UFLORIDA_FEATURE
L-HISTIDINOL	142.0979	0.69	UFLORIDA_MS_RI	165271				UFLORIDA_FEATURE
L-Isoleucine		2.45	UFLORIDA_MS_RI	6306				UFLORIDA_FEATURE
L-Leucine	132.1022	2.5	UFLORIDA_MS_RI	6106		C16439		UFLORIDA_FEATURE
L-METHIONINE		1.51	UFLORIDA_MS_RI	6137				UFLORIDA_FEATURE
L-SERINE		0.79	UFLORIDA_MS_RI	5951				UFLORIDA_FEATURE
MANNOSE		0.77	UFLORIDA_MS_RI	18950				UFLORIDA_FEATURE
N-ACETYL-DL-GLUTAMIC ACID		2.24	UFLORIDA_MS_RI	185				UFLORIDA_FEATURE
N-ACETYL-L-ALANINE		2.25	UFLORIDA_MS_RI	88064				UFLORIDA_FEATURE
N-ACETYL-L-LEUCINE	174.1127	7.61	UFLORIDA_MS_RI	70912				UFLORIDA_FEATURE
N-ACETYLNEURAMINATE		0.9	UFLORIDA_MS_RI	439197				UFLORIDA_FEATURE
N-ACETYLPUTRESCINE	131.1181	1.12	UFLORIDA_MS_RI	122356				UFLORIDA_FEATURE
NAD	664.1172	3.44	UFLORIDA_MS_RI	5893				UFLORIDA_FEATURE
NALPHA-ACETYL-L-LYSINE_R1	189.1235	1.19	UFLORIDA_MS_RI	92907				UFLORIDA_FEATURE
NALPHA-ACETYL-L-LYSINE_R2	189.1236	1.13	UFLORIDA_MS_RI	92907				UFLORIDA_FEATURE
NEPSILON,NEPSILON,NEPSILON-TRIMETHYLLYSINE		0.79	UFLORIDA_MS_RI	440120				UFLORIDA_FEATURE
NICOTINAMIDE		1.75	UFLORIDA_MS_RI	936				UFLORIDA_FEATURE
NICOTINAMIDE MONONUCLEOTIDE	335.0633	1.11	UFLORIDA_MS_RI	14180				UFLORIDA_FEATURE
NICOTINATE		1.57	UFLORIDA_MS_RI	938				UFLORIDA_FEATURE
N-METHYL-D-ASPARTIC ACID		0.84	UFLORIDA_MS_RI	22880				UFLORIDA_FEATURE
N(PAI)-METHYL-L-HISTIDINE		0.79	UFLORIDA_MS_RI	64969				UFLORIDA_FEATURE
O-PHOSPHO-DL-SERINE		0.83	UFLORIDA_MS_RI	106				UFLORIDA_FEATURE
Phenylalanine		5.57	UFLORIDA_MS_RI	6140				UFLORIDA_FEATURE
Phenylalanine-HCOOH		5.57	UFLORIDA_MS_RI					UFLORIDA_FEATURE
PHOSPHOCHOLINE		0.8	UFLORIDA_MS_RI	1014				UFLORIDA_FEATURE
PIPECOLATE		1.36	UFLORIDA_MS_RI	439227				UFLORIDA_FEATURE
Proline		0.92	UFLORIDA_MS_RI	614				UFLORIDA_FEATURE
PYRIDOXINE		2.81	UFLORIDA_MS_RI	1054				UFLORIDA_FEATURE
(R)-MALATE		1.13	UFLORIDA_MS_RI	92824				UFLORIDA_FEATURE
S-(5'-ADENOSYL)-L-METHIONINE	399.1448	0.85	UFLORIDA_MS_RI	34755				UFLORIDA_FEATURE
SARCOSINE	112.0379	0.71	UFLORIDA_MS_RI	1088				UFLORIDA_FEATURE
(S)-DIHYDROOROTATE	159.0402	1.12	UFLORIDA_MS_RI	439216				UFLORIDA_FEATURE
SN-GLYCEROL 3-PHOSPHATE		0.74	UFLORIDA_MS_RI	439162				UFLORIDA_FEATURE
SUCCINATE		2.29	UFLORIDA_MS_RI	1110				UFLORIDA_FEATURE
SUCROSE	365.1055	0.92	UFLORIDA_MS_RI	5988				UFLORIDA_FEATURE
TAURINE_R1	126.0225	0.81	UFLORIDA_MS_RI	1123				UFLORIDA_FEATURE
TAURINE_R2	126.0226	0.73	UFLORIDA_MS_RI	1123				UFLORIDA_FEATURE
Threonine	120.066	0.8	UFLORIDA_MS_RI	6288		C00188		UFLORIDA_FEATURE
THYMINE	127.0505	3.3	UFLORIDA_MS_RI	1135				UFLORIDA_FEATURE
TRANS-CINNAMATE	149.0599	9.78	UFLORIDA_MS_RI	444539				UFLORIDA_FEATURE
Tryptophan		6.45	UFLORIDA_MS_RI	6305				UFLORIDA_FEATURE
Tryptophan-2,3,3-D3		6.44	UFLORIDA_MS_RI					UFLORIDA_FEATURE
Tryptophan-2,3,3-D3-NH3		6.44	UFLORIDA_MS_RI					UFLORIDA_FEATURE
Tryptophan-NH3		6.45	UFLORIDA_MS_RI					UFLORIDA_FEATURE
Tyrosine		3.24	UFLORIDA_MS_RI	6057				UFLORIDA_FEATURE
UDP		0.81	UFLORIDA_MS_RI	6031		C00015		UFLORIDA_FEATURE
UMP	325.0433	1.18	UFLORIDA_MS_RI	6030		C00105		UFLORIDA_FEATURE
URACIL		1.48	UFLORIDA_MS_RI	1174				UFLORIDA_FEATURE
URATE		1.86	UFLORIDA_MS_RI	1175				UFLORIDA_FEATURE
URIDINE	267.0589	2.86	UFLORIDA_MS_RI	6029				UFLORIDA_FEATURE
UROCANATE	139.0504	2.03	UFLORIDA_MS_RI	736715				UFLORIDA_FEATURE
Valine	118.0866	1.17	UFLORIDA_MS_RI	6287		C16436		UFLORIDA_FEATURE
XYLITOL	151.0610	0.81	UFLORIDA_MS_RI	6912				UFLORIDA_FEATURE
3-CMP	324.0591	1.76	6131				
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