#METABOLOMICS WORKBENCH amitch_20160114_9041651_mwtab.txt DATATRACK_ID:483 kenanazam_20160121_101240 STUDY_ID:ST000335 ANALYSIS_ID:AN000541 PROJECT_ID:PR000267 VERSION 1 CREATED_ON January 21, 2016, 10:27 am #PROJECT PR:PROJECT_TITLE Metabolomics of bovine uterine fluid at the onset of conceptus elongation PR:PROJECT_TYPE Research PR:PROJECT_SUMMARY Research The objective is to investigate changes in metabolomics of uterine PR:PROJECT_SUMMARY lumen content of lactating dairy cows associated with the onset of conceptus PR:PROJECT_SUMMARY (embryo and associated membranes) elongation. Lactating dairy cows had estrous PR:PROJECT_SUMMARY cycles synchronized and were subjected to induced ovulation and timed artificial PR:PROJECT_SUMMARY insemination (AI). The day of AI was considered study d 0. On d 15, uteri were PR:PROJECT_SUMMARY flushed by transcervical catheterization and infusion of 20 mL of phosphate PR:PROJECT_SUMMARY buffered solution with 0.1% of polyvinyl acetate. Recovered conceptuses were PR:PROJECT_SUMMARY classified based on morphology/length as ovoid (OV; 1-4 mm), tubular (TUB; 5-19 PR:PROJECT_SUMMARY mm) and filamentous (FIL; 20-85 mm). The first 20 mL infused in the uterus were PR:PROJECT_SUMMARY recovered, placed in conical tubes and centrifuged at 2,000 × g at 4ᵒC. The PR:PROJECT_SUMMARY supernatant was collect, aliquoted and stored at -80ᵒC for later analyses of PR:PROJECT_SUMMARY fluid composition, including measurement of IFN-τ concentration. Cows with no PR:PROJECT_SUMMARY conceptus recovered and no detection of IFN-τ in uterine flushing were PR:PROJECT_SUMMARY considered as nonpregnant (NPREG). The experimental design was then considered a PR:PROJECT_SUMMARY prospective cohort study with 4 independent groups (NPREG, OV, TUB, and FIL). PR:PROJECT_SUMMARY The additional 5th group represents a specific physiological condition of cows PR:PROJECT_SUMMARY within the study and it will be compared to TUB and FIL groups combined, working PR:PROJECT_SUMMARY as a pilot study for future research. PR:INSTITUTE University of Florida PR:DEPARTMENT Department of Animal Sciences PR:LABORATORY Laboratory of Reproduction and Nutrition of Dairy Cows PR:LAST_NAME Santos PR:FIRST_NAME José Eduardo PR:ADDRESS 2250 Shealy Drive, Bldg. 499, Room 204, Gainesville, FL 32611-0910 PR:EMAIL jepsantos@ufl.edu PR:PHONE 3522227333 PR:FUNDING_SOURCE Internal #STUDY ST:STUDY_TITLE Metabolomics of bovine uterine fluid at the onset of conceptus elongation ST:STUDY_TYPE Prospective cohort study ST:STUDY_SUMMARY The objective is to investigate changes in metabolomics of uterine lumen content ST:STUDY_SUMMARY of lactating dairy cows associated with the onset of conceptus (embryo and ST:STUDY_SUMMARY associated membranes) elongation. Lactating dairy cows had estrous cycles ST:STUDY_SUMMARY synchronized and were subjected to induced ovulation and timed artificial ST:STUDY_SUMMARY insemination (AI). The day of AI was considered study d 0. On d 15, uteri were ST:STUDY_SUMMARY flushed by transcervical catheterization and infusion of 20 mL of phosphate ST:STUDY_SUMMARY buffered solution with 0.1% of polyvinyl acetate. Recovered conceptuses were ST:STUDY_SUMMARY classified based on morphology/length as ovoid (OV; 1-4 mm), tubular (TUB; 5-19 ST:STUDY_SUMMARY mm) and filamentous (FIL; 20-85 mm). The first 20 mL infused in the uterus were ST:STUDY_SUMMARY recovered, placed in conical tubes and centrifuged at 2,000 × g at 4ᵒC. The ST:STUDY_SUMMARY supernatant was collect, aliquoted and stored at -80ᵒC for later analyses of ST:STUDY_SUMMARY fluid composition, including measurement of IFN-τ concentration. Cows with no ST:STUDY_SUMMARY conceptus recovered and no detection of IFN-τ in uterine flushing were ST:STUDY_SUMMARY considered as nonpregnant (NPREG). The experimental design was then considered a ST:STUDY_SUMMARY prospective cohort study with 4 independent groups (NPREG, OV, TUB, and FIL). ST:STUDY_SUMMARY The additional 5th group represents a specific physiological condition of cows ST:STUDY_SUMMARY within the study and it will be compared to TUB and FIL groups combined, working ST:STUDY_SUMMARY as a pilot study for future research. ST:INSTITUTE University of Florida ST:DEPARTMENT SECIM ST:LABORATORY Laboratory of Reproduction and Nutrition of Dairy Cows ST:LAST_NAME Ribeiro ST:FIRST_NAME Eduardo ST:ADDRESS 2250 Shealy Drive, Bldg. 499, Room 228, Gainesville, FL 32611-0910 ST:EMAIL ribeiro.es@ufl.edu ST:PHONE 3522227333 ST:NUM_GROUPS 5 ST:TOTAL_SUBJECTS 30 #SUBJECT SU:SUBJECT_TYPE Animal SU:SUBJECT_SPECIES Bos Taurus SU:TAXONOMY_ID 9913 #SUBJECT_SAMPLE_FACTORS: SUBJECT(optional)[tab]SAMPLE[tab]FACTORS(NAME:VALUE pairs separated by |)[tab]Additional sample data SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 26488 Main factor (1 to 5):- SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 27917 Main factor (1 to 5):1 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6820 Main factor (1 to 5):5 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6125 Main factor (1 to 5):2 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 21003 Main factor (1 to 5):3 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6314 Main factor (1 to 5):1 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6570 Main factor (1 to 5):- SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 5135 Main factor (1 to 5):5 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 26128 Main factor (1 to 5):3 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 27327 Main factor (1 to 5):2 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 1721 Main factor (1 to 5):- SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 21068 Main factor (1 to 5):1 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 11523 Main factor (1 to 5):5 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 11804 Main factor (1 to 5):2 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 26068 Main factor (1 to 5):3 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6299 Main factor (1 to 5):2 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 26416 Main factor (1 to 5):- SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 19830 Main factor (1 to 5):1 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 19825 Main factor (1 to 5):5 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6797 Main factor (1 to 5):3 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6754 Main factor (1 to 5):- SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 1415 Main factor (1 to 5):2 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 19994 Main factor (1 to 5):1 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 22732 Main factor (1 to 5):5 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 26289 Main factor (1 to 5):3 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 27905 Main factor (1 to 5):5 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6609 Main factor (1 to 5):- SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6154 Main factor (1 to 5):2 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 6165 Main factor (1 to 5):1 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - 9798 Main factor (1 to 5):3 #COLLECTION CO:COLLECTION_SUMMARY On day 15 after insemination, the uterine horn ipsilateral to the corpus luteum CO:COLLECTION_SUMMARY was flushed by transcervical catheterization and infusion of 20 mL of phosphate CO:COLLECTION_SUMMARY buffered solution with 0.1% of polyvinyl acetate. The solution was infused using CO:COLLECTION_SUMMARY a 60 mL dosing plastic syringe connected in a 20 to 24 French silicone coated CO:COLLECTION_SUMMARY latex Foley catheter. The fluid infused was recovery into the same syringe used CO:COLLECTION_SUMMARY for infusion and then examined in a petri dish under stereoscope for location of CO:COLLECTION_SUMMARY conceptus tissue. The uterine fluid recovered was placed in conical tubes in ice CO:COLLECTION_SUMMARY and later centrifuged at 2,000 × g at 4ᵒC. The supernatant was collect, CO:COLLECTION_SUMMARY aliquoted and stored at -80ᵒC for later analyses of fluid composition. #TREATMENT TR:TREATMENT_SUMMARY No treatments were administered on the subjects. The factors of interest are TR:TREATMENT_SUMMARY pregnant status (pregnant vs. nonpregnant) and stage of conceptus development TR:TREATMENT_SUMMARY (ovoid vs. tubular vs. filamentous), which was evaluated base on the shape and TR:TREATMENT_SUMMARY length of the conceptus. Thus, cows were classified as nonpregnant (no conceptus TR:TREATMENT_SUMMARY recovered), pregnant with an ovoid conceptus (1-4 mm), pregnant with a tubular TR:TREATMENT_SUMMARY conceptus (5-19 mm), or pregnant with a filamentous conceptus (20-80 mm). The TR:TREATMENT_SUMMARY fifth group is part of a preliminary study comparing a different reproductive TR:TREATMENT_SUMMARY physiology condition prior enrollment. Cows in the fifth group are all pregnant TR:TREATMENT_SUMMARY with a filamentous conceptus. Interferon-tau, a type-I interferon secreted by TR:TREATMENT_SUMMARY exclusively by trophectoderm cells of ruminants conceptuses, was measured in all TR:TREATMENT_SUMMARY uterine flushing. Nonpregnant status was confirmed only for those that had no TR:TREATMENT_SUMMARY signal of interferon-tau in the uterine flushing. Samples were arranged in 6 TR:TREATMENT_SUMMARY blocks of 5 samples each. Within each block, all 5 groups are represented. For TR:TREATMENT_SUMMARY each group, samples were selected randomly from the population in the study. All TR:TREATMENT_SUMMARY investigators, except for the study administrator, and collaborators should be TR:TREATMENT_SUMMARY blind to factors of interest. #SAMPLEPREP SP:SAMPLEPREP_SUMMARY None SP:SAMPLEPREP_PROTOCOL_FILENAME Metabolomics_LCMSProtocol_plasma.pdf;Appendix A - Internal Standard Prep SP:SAMPLEPREP_PROTOCOL_FILENAME GLCMS.pdf #CHROMATOGRAPHY CH:CHROMATOGRAPHY_SUMMARY None CH:CHROMATOGRAPHY_TYPE Reversed phase CH:INSTRUMENT_NAME Thermo Scientific-Dionex Ultimate 3000 CH:COLUMN_NAME ACE Excel 2 C18-PFP (100 x 2.1mm, 2um) CH:METHODS_FILENAME Metabolomics_LCMSProtocol_plasma.pdf #ANALYSIS AN:ANALYSIS_TYPE MS #MS MS:MS_COMMENTS - MS:INSTRUMENT_NAME Thermo Q Exactive Orbitrap MS:INSTRUMENT_TYPE Orbitrap MS:MS_TYPE ESI MS:ION_MODE NEGATIVE #MS_METABOLITE_DATA MS_METABOLITE_DATA:UNITS peak area MS_METABOLITE_DATA_START Samples 11804 27327 11523 1721 21068 26068 6299 26488 27917 19994 26416 6797 6754 19830 19825 1415 6820 27905 6154 6165 9798 26289 22732 6609 6125 26128 21003 5135 6570 6314 Factors Main factor (1 to 5):2 Main factor (1 to 5):2 Main factor (1 to 5):5 Main factor (1 to 5):- Main factor (1 to 5):1 Main factor (1 to 5):3 Main factor (1 to 5):2 Main factor (1 to 5):- Main factor (1 to 5):1 Main factor (1 to 5):1 Main factor (1 to 5):- Main factor (1 to 5):3 Main factor (1 to 5):- Main factor (1 to 5):1 Main factor (1 to 5):5 Main factor (1 to 5):2 Main factor (1 to 5):5 Main factor (1 to 5):5 Main factor (1 to 5):2 Main factor (1 to 5):1 Main factor (1 to 5):3 Main factor (1 to 5):3 Main factor (1 to 5):5 Main factor (1 to 5):- Main factor (1 to 5):2 Main factor (1 to 5):3 Main factor (1 to 5):3 Main factor (1 to 5):5 Main factor (1 to 5):- Main factor (1 to 5):1 (�)-3-Hydroxynonanoic acid_1 1270000.0000 1220000.0000 1330000.0000 1190000.0000 1300000.0000 1210000.0000 1210000.0000 1150000.0000 1240000.0000 1310000.0000 1230000.0000 1210000.0000 1190000.0000 1260000.0000 1280000.0000 1260000.0000 1300000.0000 1310000.0000 1170000.0000 1170000.0000 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2100.0000 10100.0000 3140.0000 6800.0000 11500.0000 6270.0000 12300.0000 12600.0000 4510.0000 753.0000 3510.0000 2910.0000 376000.0000 2110.0000 3340.0000 7820.0000 5430.0000 4630.0000 6850.0000 10300.0000 3960.0000 6040.0000 5780.0000 2370.0000 4590.0000 3640.0000 4510.0000 (S)-Isowillardiine 250000.0000 606000.0000 173000.0000 249000.0000 256000.0000 295000.0000 9670.0000 291000.0000 32200.0000 185000.0000 247000.0000 454000.0000 276000.0000 159000.0000 66400.0000 569000.0000 56500.0000 188000.0000 235000.0000 246000.0000 145000.0000 63500.0000 264000.0000 444000.0000 70800.0000 198000.0000 116000.0000 516000.0000 214000.0000 329000.0000 (Z)-Resveratrol 3,4'-diglucoside 919000.0000 762.0000 1830.0000 787.0000 4230.0000 4160.0000 2250.0000 778.0000 1-(sn-Glycero-3-phospho)-1D-myo-inositol 270000.0000 427000.0000 199000.0000 348000.0000 93700.0000 444000.0000 47200.0000 428000.0000 119000.0000 232000.0000 250000.0000 257000.0000 211000.0000 214000.0000 303000.0000 546000.0000 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peroxydisulfate 1160000.0000 974000.0000 797000.0000 747000.0000 1010000.0000 821000.0000 2920000.0000 808000.0000 711000.0000 1100000.0000 1120000.0000 1310000.0000 1200000.0000 1310000.0000 1310000.0000 793000.0000 1850000.0000 511000.0000 779000.0000 1410000.0000 2680000.0000 1050000.0000 709000.0000 795000.0000 1730000.0000 1190000.0000 1710000.0000 1230000.0000 1120000.0000 785000.0000 Angelicin_1 909000.0000 1030000.0000 926000.0000 1250000.0000 974000.0000 980000.0000 958000.0000 1070000.0000 887000.0000 1300000.0000 1040000.0000 937000.0000 902000.0000 1020000.0000 1090000.0000 893000.0000 975000.0000 866000.0000 1010000.0000 974000.0000 959000.0000 973000.0000 1000000.0000 1010000.0000 995000.0000 956000.0000 1110000.0000 968000.0000 1160000.0000 926000.0000 Angelicin_2 646000.0000 839000.0000 201000.0000 508000.0000 390000.0000 1300000.0000 28800.0000 337000.0000 30700.0000 164000.0000 224000.0000 258000.0000 197000.0000 88600.0000 455000.0000 1140000.0000 183000.0000 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241000.0000 570000.0000 163000.0000 333000.0000 242000.0000 487000.0000 171000.0000 326000.0000 153000.0000 341000.0000 300000.0000 322000.0000 316000.0000 351000.0000 334000.0000 441000.0000 222000.0000 351000.0000 371000.0000 253000.0000 209000.0000 111000.0000 220000.0000 621000.0000 157000.0000 208000.0000 323000.0000 500000.0000 453000.0000 189000.0000 Benzoic acid 2220000.0000 1940000.0000 1320000.0000 1770000.0000 1890000.0000 1910000.0000 1930000.0000 2050000.0000 2260000.0000 2090000.0000 1690000.0000 1920000.0000 2310000.0000 1190000.0000 1660000.0000 3160000.0000 2580000.0000 1880000.0000 1780000.0000 1760000.0000 1220000.0000 1200000.0000 1680000.0000 1190000.0000 1400000.0000 2150000.0000 2260000.0000 1500000.0000 988000.0000 2150000.0000 Bergaptol 303000.0000 5720000.0000 525000.0000 705000.0000 486000.0000 662000.0000 326000.0000 216000.0000 138000.0000 222000.0000 541000.0000 50400.0000 666000.0000 676000.0000 15100000.0000 882000.0000 4050.0000 287000.0000 845000.0000 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Imiquimod 584000.0000 660000.0000 620000.0000 624000.0000 675000.0000 584000.0000 599000.0000 667000.0000 604000.0000 561000.0000 600000.0000 604000.0000 560000.0000 533000.0000 560000.0000 617000.0000 605000.0000 563000.0000 623000.0000 633000.0000 573000.0000 587000.0000 660000.0000 580000.0000 646000.0000 654000.0000 561000.0000 671000.0000 599000.0000 592000.0000 Indolelactic acid 23000.0000 236000.0000 80400.0000 37000.0000 64300.0000 63500.0000 10600.0000 64400.0000 8290.0000 28800.0000 27400.0000 41700.0000 35800.0000 27500.0000 2290000.0000 26400.0000 2090.0000 41100.0000 21400.0000 98400.0000 38700.0000 1320.0000 536000.0000 177000.0000 4820.0000 39100.0000 26600.0000 75800.0000 93800.0000 119000.0000 Indoxyl sulfate 71200.0000 330000.0000 131000.0000 49500.0000 120000.0000 111000.0000 6950.0000 145000.0000 7560.0000 168000.0000 12800.0000 194000.0000 62300.0000 52900.0000 3160000.0000 61600.0000 4480.0000 61400.0000 120000.0000 132000.0000 49500.0000 2340.0000 761000.0000 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2-(acetylamino)-1,5-anhydro-2-deoxy-3-O-b-D-galactopyranosyl-D-arabino-Hex-1-enitol 6.51 364.1275 22833592 2,3-Diaminosalicylic acid 2.01 167.0463 53481637 2,4-Dihydroxyacetophenone 5-sulfate 8.13 230.9968 2',5'-Dihydroxychalcone_1 12.74 239.0673 5851813 2',5'-Dihydroxychalcone_2 11.73 239.0673 5851813 2-Amino-5,6-dichloro-3,4,-dihydroquinazoline 1.83 213.9899 2-Aminomuconic acid 14.94 156.0316 5459864 2-Chloromaleylacetate 1.33 190.9731 9543161 2-Furoylglycine 9.70 168.0303 21863 2-Hydroxyadipic acid 1.01 161.0456 193530 2-Hydroxyethanesulfonate 0.97 124.9916 3955599 2-Indolecarboxylic acid 3.50 160.0438 72899 2-Ketobutyric acid 1.01 101.0242 58 2-Methoxystypandrone 1.56 259.0570 158739 2-Methyl-3-ketovaleric acid_1 7.47 129.0559 189028 2-Methyl-3-ketovaleric acid_2 7.09 129.0559 189028 2-Methylbutyrylglycine_1 6.89 158.0823 193872 2-Methylbutyrylglycine_2 6.85 158.0823 193872 2-Methylbutyrylglycine_3 6.89 158.0823 193872 2-Methylcitric acid 3.01 205.0355 515 2-Oxo-3-hydroxy-4-phosphobutanoic acid 8.13 212.9792 21145142 3-(3-Hydroxyphenyl)propanoic acid 9.84 165.0560 91 3,4,5-Trimethoxyphenyl acetate 7.90 225.0771 276280 3-[[5-Methyl-2-(1-methylethyl)cyclohexyl]oxy]-1,2-propanediol 11.50 229.1809 3a,7a,12b-Trihydroxy-5b-cholanoic acid 9.94 407.2798 5283869 3-Dechloroethylifosfamide_1 10.78 197.0205 114861 3-Dechloroethylifosfamide_2 0.96 197.0222 114861 3-Dechloroethylifosfamide_3 10.18 197.0203 114861 3-Dehydroquinate 2.90 189.0406 439351 3-Ethylpyridine 17.37 106.0698 10823 3-Fumarylpyruvate 2.69 185.0067 5280525 3-Hydroxy-2-methyl-[R-(R,S)]-butanoic acid 6.44 117.0558 11815846 3-Hydroxy-2-methylpyridine-4,5-dicarboxylate 9.53 196.0251 54683777 3-Hydroxy-6,8-dimethoxy-7(11)-eremophilen-12,8-olide_1 11.38 309.1744 3-Hydroxy-6,8-dimethoxy-7(11)-eremophilen-12,8-olide_2 10.87 309.1707 3-Hydroxy-6,8-dimethoxy-7(11)-eremophilen-12,8-olide_3 10.96 309.1709 3-Hydroxyanthranilic acid 10.29 152.0354 86 3-Hydroxycapric acid_1 9.96 187.1341 26612 3-Hydroxycapric acid_2 10.20 187.1340 26612 3-Hydroxycapric acid_3 9.82 187.1341 26612 3-Hydroxydodecanoic acid 11.14 215.1654 94216 3-Hydroxyisoheptanoic acid_1 8.78 145.0871 193804 3-Hydroxyisoheptanoic acid_2 7.91 145.0871 193804 3-Hydroxynonyl acetate_1 10.45 201.1496 234237 3-Hydroxynonyl acetate_2 10.56 201.1496 234237 3-keto-Digoxigenin 12.30 387.2152 3-Mercaptolactate-cysteine disulfide 7.53 239.9973 193536 3-Methoxybenzenepropanoic acid_1 10.14 179.0713 66336 3-Methoxybenzenepropanoic acid_2 9.62 179.0713 66336 3-Methoxybenzenepropanoic acid_3 10.39 179.0713 66336 3-Methylcrotonylglycine 6.83 156.0666 169485 3-Methyluric acid 2.34 181.0369 11804 4',5-Dihydroxy-7-methoxy-6-methylflavone_1 6.58 297.0734 4',5-Dihydroxy-7-methoxy-6-methylflavone_2 7.30 297.0739 4-[2,2'-Bithiophen-5-yl]-3-butyn-1-ol 7.75 233.0068 4-Chloro-3,5-dimethoxybenzaldehyde 0.96 199.0194 12398450 4-Hydroxy-2-oxoglutaric acid 2.48 161.0093 599 4-Hydroxybenzoic acid_1 7.64 137.0246 135 4-Hydroxybenzoic acid_2 9.29 137.0245 135 4-Hydroxydiphenylamine 1.08 184.0746 31208 4-Hydroxyphenylpyruvic acid 7.25 179.0350 979 4-Hydroxyproline 2.39 130.0511 825 4-Methoxycinnamic acid 9.08 177.0559 699414 4-Nitrophenol 9.59 138.0197 980 5,6-Epoxy-8,11,14-eicosatrienoic acid 12.30 319.2278 5353351 5-Acetylamino-6-amino-3-methyluracil 1.00 197.0665 88299 5-Acetylamino-6-formylamino-3-methyluracil 0.97 225.0618 108214 5-Chloro-6-methoxy-2(3H)-benzoxazolone 10.18 197.9920 5-Ethynyl-5'-(1-propynyl)-2,2'-bithiophene 1.21 226.9965 5-Methylthioribose 1-phosphate_1 2.22 259.0072 53477720 5-Methylthioribose 1-phosphate_2 5.92 259.0088 53477720 5-Sulfoxymethylfurfural 6.92 204.9813 6-Keto-prostaglandin F1a 8.97 369.2282 5280888 7-Hydroxyoctanoic acid_1 9.04 159.1027 167627 7-Hydroxyoctanoic acid_2 8.87 159.1027 167627 7-Hydroxyoctanoic acid_3 9.46 159.1027 167627 7-Hydroxyticlopidine 1.82 278.0426 8-iso-15-keto-PGE2 12.17 349.2049 16061134 9,12,13-TriHOME_1 10.43 329.2335 9858729 9,12,13-TriHOME_2 9.92 329.2335 9858729 9,12,13-TriHOME_3 9.52 329.2336 9858729 Allantoin 1.04 157.0368 204 Alpha-CEHC 11.97 277.1445 9943542 alpha-Fluoro-beta-alanine 17.38 106.0292 13351 Alpha-ketoisovaleric acid 3.80 115.0400 49 Aminoparathion 7.95 260.0542 220 Ammonium lactate 15.25 106.0531 62358 Ammonium peroxydisulfate 0.81 226.9663 62648 Angelicin_1 7.69 185.0277 10658 Angelicin_2 1.00 185.0224 10658 Aprobarbital 8.93 209.0949 6464 Arabinonic acid 15.32 165.0410 122045 Arachidonic acid 14.15 303.2327 444899 Arecoline 1.82 154.0876 2230 Arginyl-Histidine 9.53 310.1639 Ascorbic acid_1 3.15 175.0248 54670067 Ascorbic acid_2 1.45 175.0249 54670067 Azelaic acid 8.60 187.0977 2266 Bentoquatam 1.55 178.9204 517273 Benzoic acid 8.25 121.0296 243 Bergaptol 8.62 201.0228 5280371 Beta-Citryl-L-glutamic acid 3.66 320.0624 189741 Bretylium 7.00 241.0471 2431 Bromazepam 1.83 313.9971 2441 Bromobenzene-2,3-dihydrodiol 10.25 188.9517 134067 Bromomethane 0.91 92.9373 6323 Brompheniramine 11.29 317.0693 6834 Cadmium 0.92 112.8959 23973 Calcium Gluceptate 1.84 489.0804 62859 Canrenone 12.37 339.2001 13789 Capric acid 11.29 171.1392 2969 Carbenicillin 1.01 377.0854 20824 Chloral hydrate 0.88 162.9122 2707 Cholesterol sulfate 15.31 465.3046 65076 Chorismate 8.39 225.0402 12039 cis-2-Methylaconitate 0.85 187.0213 3080625 cis-3-Chloroallyl aldehyde 5.12 88.9784 9543055 cis-Aconitic acid 1.22 173.0093 643757 Citramalic acid 1.89 147.0299 1081 Citric acid 2.22 191.0197 311 Citrulline 1.00 174.0884 9750 Clavulanate 9.71 198.0410 5280980 clofarabind-5'-monophosphate 7.68 382.0140 Creatine 1.15 130.0624 586 Creatine-D3 1.14 133.0812 Curcumin II 11.14 365.1406 5469424 Cyanidin-3-galactoside 1.82 483.0702 10299753 cyclic GMP-AMP 14.86 673.0966 71563406 Cytidine 1.90 242.0784 6175 Cytokinin B 11.69 224.0930 62389 Dacarbazine_1 9.62 181.0872 5353562 Dacarbazine_2 9.43 181.0872 5353562 dADP 3.66 410.0314 188966 Daucic acid_1 2.34 203.0186 21578281 Daucic acid_2 0.93 203.0204 21578281 Decanoylcarnitine 12.01 314.2338 10245190 Decitabine 1.00 227.0774 451668 Deoxycholic acid glycine conjugate 10.15 448.3071 3035026 Deoxypyridinoline 9.49 411.1931 105071 Deoxyribose 5-phosphate 10.18 213.0153 635 Desacetyl-nitazoxanide 9.53 264.0128 394397 D-Glucose 0.99 179.0561 5793 D-Glyceraldehyde 3-phosphate 8.13 168.9895 24794350 Dibenzyl disulfide 0.97 245.0431 9012 Diclofenac 1.81 294.0128 3033 Diethylcarbamazine N-oxide 1.83 214.1547 161840 Diethylphosphate 2.87 153.0314 5166299 Diethylthiophosphate 5.90 169.0141 3683036 Diflunisal 8.67 249.0322 3059 Dihydrolipoate 1.02 207.0510 421 Dillapional 8.78 235.0610 5458880 Dimethyl tetrasulfide 0.94 156.9254 79828 Diphenyl disulfide 8.59 217.0176 13436 Dipropyl trisulfide 7.39 181.0143 22383 Dodecanedioic acid_1 9.87 229.1444 12736 Dodecanedioic acid_2 11.50 229.1444 12736 Dopamine 1.83 152.0719 681 Droxidopa 1.79 212.0568 92974 Ecabet_1 11.63 379.1565 65781 Ecabet_2 11.62 379.1564 65781 Ellagic acid 8.29 300.9994 5281855 Emtricitabine 7.67 246.0385 60877 Epicatechin_1 3.12 289.0678 72276 Epicatechin_2 10.28 289.0693 72276 Epicatechin_3 2.36 289.0679 72276 Ergothioneine 1.16 228.0811 5351619 Ethylphosphate 1.05 125.0010 74190 Fexofenadine 11.37 500.2790 3348 Flusilazole 6.95 314.0883 73675 Fospropofol_1 6.58 331.0677 3038498 Fospropofol_2 2.26 331.0677 3038498 Fumaric acid_1 2.48 115.0036 444972 Fumaric acid_2 1.34 115.0037 444972 Galactitol 0.98 181.0720 11850 Galactonic acid 0.99 195.0511 128869 Gallium nitrate 1.02 253.8790 61635 Garcinone B 6.51 393.1308 5495928 Genipinic acid 7.30 241.0716 Gentisic acid_1 7.23 153.0195 3469 Gentisic acid_2 7.87 153.0194 3469 Gingerol_1 11.34 293.1760 442793 Gingerol_2 10.81 293.1760 442793 Gingerol_3 11.97 293.1797 442793 Gingerol_4 11.66 293.1765 442793 Glutaconic acid_1 6.50 129.0196 5280498 Glutaconic acid_2 2.77 129.0195 5280498 Glutaconic acid_3 1.58 129.0184 5280498 Glutaconic acid_4 1.66 129.0193 5280498 Glutaconic acid_5 1.18 129.0195 5280498 Glyceric acid 1.08 105.0192 752 Glycocholic acid 9.39 464.3022 10140 Gravelliferone 11.11 297.1531 14133589 Hamamelitannin_1 7.31 483.0775 16211077 Hamamelitannin_2 7.14 483.0775 16211077 Hippuric acid 7.67 178.0511 464 Homogentisic acid 7.85 167.0351 780 Homolanthionine_1 7.21 267.0622 Homolanthionine_2 5.25 267.0623 Homovanillic acid 8.59 181.0508 1738 Homoveratric acid_1 8.31 195.0654 7139 Homoveratric acid_2 7.91 195.0661 7139 Humulinic acid A 11.07 265.1478 101306745 Hypoxanthine_1 2.33 135.0304 790 Hypoxanthine_2 1.01 135.0301 790 I(-) 1.02 126.9051 30165 Imidazole acetol-phosphate_1 2.79 219.0136 792 Imidazole acetol-phosphate_2 1.22 219.0146 792 Iminoaspartic acid_1 6.33 130.0146 796 Iminoaspartic acid_2 6.33 130.0146 796 Imiquimod 11.25 239.1288 57469 Indolelactic acid 8.73 204.0665 92904 Indoxyl sulfate 7.63 212.0023 10258 Iodotyrosine 1.81 305.9653 439744 Isoacitretin_1 12.14 325.1842 6437841 Isoacitretin_2 11.91 325.1842 6437841 Isoplumbagin 0.96 187.0381 Isosakuranin 10.07 447.1336 42607950 Isosyringinoside 14.31 533.1823 57399043 Isovitexin 2''-O-glucoside 1.10 593.1566 185995 KB 2 9.50 453.1579 Kinetin 1.84 214.0721 3830 Laccarin 9.44 193.0998 10774183 Lamivudine-monophosphate 7.68 308.0092 L-Cystine 2.59 239.0148 67678 L-Dopa 1.84 196.0615 6047 L-Glutamic acid 0.98 146.0460 33032 L-Glutamine 0.94 145.0621 5961 Lipoyllysine 11.07 333.1355 Liqcoumarin 0.95 217.0485 11378967 Liquiritin 8.60 417.1189 503737 L-Kynurenine 6.73 207.0774 161166 L-Lactic acid 1.55 89.0240 107689 L-Malic acid 1.34 133.0144 222656 Lomustine 6.40 232.0827 3950 L-Tyrosine 3.81 180.0668 6057 Lubiprostone 9.47 389.2104 157920 Lucidenic acid G 9.95 475.2681 LysoPC(15:0) 12.85 480.3101 24779458 LysoPE(0:0/22:5(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)) 11.79 526.2940 Melibiose 6.53 341.1117 11458 Metaxalone 9.44 220.0980 15459 Methimazole 0.85 113.0173 1349907 Methoxsalen 0.95 215.0330 4114 Methyl (9Z)-10'-oxo-6,10'-diapo-6-carotenoate 11.63 311.1689 Methyl 1-(1-propenylthio)propyl disulfide_1 2.76 193.0176 Methyl 1-(1-propenylthio)propyl disulfide_2 1.03 193.0137 Methylmalonic acid 2.69 117.0193 487 Metyrosine 11.79 194.0821 441350 Mevalonic acid-5P 10.84 227.0313 439400 MG(0:0/15:0/0:0)_1 11.47 315.2539 MG(0:0/15:0/0:0)_2 11.46 315.2539 MG(0:0/24:6(6Z,9Z,12Z,15Z,18Z,21Z)/0:0)_1 13.29 429.3041 MG(0:0/24:6(6Z,9Z,12Z,15Z,18Z,21Z)/0:0)_2 13.50 429.3041 Midazolam 7.03 324.0727 4192 Miglitol 7.30 206.1014 441314 Monoisobutyl phthalic acid 10.28 221.0818 92272 N-(p-Hydroxyphenethyl)actinidine 12.39 267.1604 442550 N2-Succinyl-L-glutamic acid 5-semialdehyde 1.53 230.0669 440848 N-Acetylcystathionine 9.42 263.0746 152314 N-Acetyl-L-aspartic acid 1.79 174.0409 65065 N-Acetylvanilalanine 8.01 252.0852 12681285 Nalidixic Acid 8.33 231.0778 4421 N-Decanoylglycine 9.15 228.1605 1712391 N-Glycolylneuraminic acid 0.99 324.0932 440001 N-Heptanoylglycine 7.81 186.1136 10932172 Norepinephrine_1 1.81 168.0667 439260 Norepinephrine_2 6.61 168.0667 439260 Norfuraneol 0.98 113.0244 4564493 N-Undecanoylglycine_1 9.53 242.1763 454092 N-Undecanoylglycine_2 14.88 242.1763 454092 O-Demethylfonsecin 0.98 275.0539 Oleic acid 15.08 281.2486 445639 Oltipraz 0.82 224.9628 47318 O-methoxycatechol-O-sulphate 7.94 203.0022 O-Phospho-4-hydroxy-L-threonine 10.18 214.0127 440901 Ophthalmic acid 2.26 288.1202 7018721 Oxalosuccinic acid 8.03 189.0030 972 Oxoglutaric acid 1.55 145.0144 51 Palmitic acid 15.02 255.2329 985 PC-M6 11.17 420.2509 p-Cresol sulfate 8.02 187.0072 4615423 P-Dichlorobenzene 10.25 144.9619 4685 Perfluorooctanoic acid_1 10.94 412.9665 9554 Perfluorooctanoic acid_2 10.93 412.9665 9554 Phenol sulphate 7.07 172.9915 Phenylacetylglycine 7.95 192.0668 68144 Phosphoramide mustard 1.55 218.9822 96356 Phosphoric acid 0.94 96.9693 1004 Phthalic acid 7.74 165.0193 1017 p-Hydroxyphenylacetic acid_1 9.22 151.0402 127 p-Hydroxyphenylacetic acid_2 8.56 151.0402 127 Potassium 2-(1'-ethoxy) ethoxypropanoate 0.96 199.0380 Propyl 1-(propylsulfinyl)propyl disulfide 13.95 239.0601 Prostaglandin F2a_1 10.05 353.2334 5280363 Prostaglandin F2a_2 9.49 353.2334 5280363 Pseudoecgonine 8.01 184.0980 443845 Pyridoxal 1.87 166.0510 1050 Pyrocatechol sulfate 6.80 188.9864 Pyroglutamic acid_1 2.19 128.0355 7405 Pyroglutamic acid_2 6.77 128.0355 7405 Quinolinic acid 1.21 166.0180 1066 Remoxipride 11.29 369.0842 54477 Ribitol 1.00 151.0613 6912 Ribothymidine_1 11.79 257.0781 445408 Ribothymidine_2 3.62 257.0781 445408 Riluzole 2.59 232.9979 5070 Rishitin 12.39 221.1547 108064 Salicyluric acid 7.18 194.0460 10253 Salsoline-1-carboxylate 7.60 236.0932 6999660 Sarmentosin 7.30 274.0892 5281123 Sebacic acid 9.06 201.1134 5192 Secoisolariciresinol_1 11.34 361.1633 65373 Secoisolariciresinol_2 10.81 361.1635 65373 Sertraline_1 1.78 304.0677 68617 Sertraline_2 4.07 304.0676 68617 Sinalbin B 7.68 263.0289 10515775 Stearic acid 16.42 283.2644 5281 Succinic anhydride 1.21 99.0086 7922 Sulfamethoxazole_1 1.84 252.0460 5329 Sulfamethoxazole_2 6.40 252.0491 5329 Sulfamethoxazole_3 1.80 252.0468 5329 Sulfanilamide 2.59 171.0275 5333 Sulfaphenazole 14.62 313.0786 5335 Sulfapyridine 3.81 248.0541 5336 Sulfurous acid 0.94 80.9666 1100 Taurine 0.94 124.0075 1123 Taurocholic acid 8.87 514.2843 6675 Tauroursodeoxycholic acid 9.41 498.2899 9848818 Tenofovir 10.63 286.0683 464205 Tetraphyllin B_1 6.65 286.0925 115164 Tetraphyllin B_2 1.98 286.0936 115164 Thorium_1 9.05 231.0334 23960 Thorium_2 8.49 231.0336 23960 Tolcapone 1.01 272.0542 4659569 Topaquinone_1 9.75 210.0410 123871 Topaquinone_2 6.41 210.0409 123871 Topaquinone_3 1.82 210.0412 123871 Topiramate 7.27 338.0882 5284627 Torasemide 8.53 347.1134 41781 Traumatic acid 10.13 227.1289 5283028 Undecanedioic acid 9.47 215.1288 15816 Uracil 1.71 111.0200 1174 Uric acid 2.09 167.0211 1175 Uridine_1 3.12 243.0623 6029 Uridine_2 1.74 243.0623 6029 Urolithin B 11.22 211.0361 5380406 Ustiloxin C 9.50 557.1968 157841 Valerenic acid 12.62 233.1549 6440940 Vanillactic acid 7.25 211.0612 160637 Vanillylmandelic acid_1 7.48 197.0431 1245 Vanillylmandelic acid_2 7.09 197.0431 1245 Vanillylmandelic acid_3 7.93 197.0456 1245 Xanthine 2.79 151.0263 1188 Zafirlukast metabolite M5 1.16 590.1935 Zeranol 11.31 321.1743 2999413 Zymonic acid 1.55 157.0119 71436380 METABOLITES_END #END