#METABOLOMICS WORKBENCH leaseep_20230614_064326 DATATRACK_ID:4088 STUDY_ID:ST002754 ANALYSIS_ID:AN004469 VERSION 1 CREATED_ON 02-08-2024 #PROJECT PR:PROJECT_TITLE Developmental programming of Kupffer cells by maternal obesity causes fatty PR:PROJECT_TITLE liver disease in the offspring PR:PROJECT_SUMMARY Kupffer cells (KCs) are tissue-resident macrophages which colonize the PR:PROJECT_SUMMARY developing liver early during embryogenesis. Throughout development and PR:PROJECT_SUMMARY adulthood, KCs have distinct core functions that are essential for liver and PR:PROJECT_SUMMARY organismal homeostasis, such as supporting fetal erythropoiesis as well as PR:PROJECT_SUMMARY postnatal erythrocyte recycling and liver metabolism. KCs acquire their PR:PROJECT_SUMMARY tissue-specific transcriptional signature immediately after colonizing the PR:PROJECT_SUMMARY liver, mature together with the tissue, and adapt to the tissue’s function. PR:PROJECT_SUMMARY However, whether perturbation of macrophage core functions during development PR:PROJECT_SUMMARY may contribute to or cause disease at postnatal stages is poorly understood. PR:PROJECT_SUMMARY Here, we utilize a maternal obesity model to disturb KC functions during PR:PROJECT_SUMMARY gestation. We show that offspring born to obese mothers develop fatty liver PR:PROJECT_SUMMARY disease that is accompanied by a local pro-inflammatory response, a phenotype PR:PROJECT_SUMMARY that is augmented if the offspring is kept on control diet after birth. Further, PR:PROJECT_SUMMARY transcriptional analyses reveal that KCs undergo developmental programming PR:PROJECT_SUMMARY through the maternal high-fat diet, which lasts until adulthood. The PR:PROJECT_SUMMARY offspring’s KC developmental programming is irreversible despite the switch to PR:PROJECT_SUMMARY control diet and leads to increased lipid uptake in hepatocytes mediated via PR:PROJECT_SUMMARY paracrine factors stemming from KCs. The transcriptional programming of KCs and PR:PROJECT_SUMMARY the fatty liver disease phenotype are rescued by genetic depletion of PR:PROJECT_SUMMARY hypoxia-inducible factor alpha (Hif-1alpha) in macrophages during gestation. PR:PROJECT_SUMMARY These results demonstrate that macrophages rely on an undisturbed development to PR:PROJECT_SUMMARY fulfil their core functions and support organ homeostasis during adulthood, and PR:PROJECT_SUMMARY establish developmental programming of KCs as a therapeutic strategy for PR:PROJECT_SUMMARY metabolic disorders, such as fatty liver disease. PR:INSTITUTE University of Bonn PR:DEPARTMENT LIMES PR:LABORATORY Mass Lab PR:LAST_NAME Mass PR:FIRST_NAME Elvira PR:ADDRESS Carl-Troll-Str. 31, 53115 Bonn, Germany PR:EMAIL elvira.mass@uni-bonn.de PR:PHONE +49 0228 / 73 6 28 48 PR:FUNDING_SOURCE DFG PR:PUBLICATIONS in preparation PR:DOI http://dx.doi.org/10.21228/M81D9R PR:CONTRIBUTORS Nora Balzer, Iva Splichalova, Hao Huang, Stephan Grein, Lea Seep #STUDY ST:STUDY_TITLE Metabolomics analysis of maternal obesity model ST:STUDY_SUMMARY 100μl serum of 11-12 weeks old male mice with a background from various diet ST:STUDY_SUMMARY groups were processed in Metabolon (https://www.metabolon.com) for metabolics ST:STUDY_SUMMARY analysis.Diet groups are CDm CDl CD, CDm CDl HFD, CDmHFDl HFD, HFDm CDl CD, HFDm ST:STUDY_SUMMARY CDl HFD, HFDm HFDl CD and HFDm CDl CD. (m: maternal diet, l: lactation) ST:INSTITUTE University of Bonn ST:DEPARTMENT LIMES ST:LABORATORY Mass Lab ST:LAST_NAME Mass ST:FIRST_NAME Elvira ST:ADDRESS LIMES-Institute, Carl-Troll-Str. 31, 53115 Bonn, Germany ST:EMAIL elvira.mass@uni-bonn.de ST:PHONE +49 02 28 / 73 6 28 48 ST:SUBMIT_DATE 2023-06-14 #SUBJECT SU:SUBJECT_TYPE Mammal SU:SUBJECT_SPECIES Mus musculus SU:TAXONOMY_ID 10090 SU:GENOTYPE_STRAIN C57BL/6JRcc SU:AGE_OR_AGE_RANGE 10-12 weeks SU:ANIMAL_HOUSING specific pathogen-free conditions SU:ANIMAL_LIGHT_CYCLE 12-h light/dark cycle #SUBJECT_SAMPLE_FACTORS: SUBJECT(optional)[tab]SAMPLE[tab]FACTORS(NAME:VALUE pairs separated by |)[tab]Additional sample data SUBJECT_SAMPLE_FACTORS FS28908000 UHBO-00909 MOTHER_DIET:CD_CD | OFFSPRING_DIET:CD GROUP_ID=CD_CD_CD; VOL_EXTRACTED=90; diet_condition=CDmaternalCDlactationCDsolid food; maternal_diet=lean mother; RNA_seq_available=yes; colour_of_serum=normal; day_of_experiment_DD_MM_YY=24_05_18 SUBJECT_SAMPLE_FACTORS FS28908002 UHBO-00910 MOTHER_DIET:CD_CD | OFFSPRING_DIET:CD GROUP_ID=CD_CD_CD; 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The sera CO:COLLECTION_SUMMARY were stored at -80°C until shipped to Metabolon. Further preparation was done CO:COLLECTION_SUMMARY there. CO:SAMPLE_TYPE Blood (serum) #TREATMENT TR:TREATMENT_SUMMARY Samples were taken from the developed Maternal Obesity model. This model was TR:TREATMENT_SUMMARY generated as described in the Material and Methods section. No additional TR:TREATMENT_SUMMARY treatment was done. #SAMPLEPREP SP:SAMPLEPREP_SUMMARY Sera were taken and sent to Metabolon. Further sample preparation was done on SP:SAMPLEPREP_SUMMARY Metabolon Site. In short, samples were prepared using the automated MicroLab SP:SAMPLEPREP_SUMMARY STAR® system from Hamilton Company. Several recovery standards were added prior SP:SAMPLEPREP_SUMMARY to the first step in the extraction process for QC purposes. To remove protein, SP:SAMPLEPREP_SUMMARY dissociate small molecules bound to protein or trapped in the precipitated SP:SAMPLEPREP_SUMMARY protein matrix, and to recover chemically diverse metabolites, proteins were SP:SAMPLEPREP_SUMMARY precipitated with methanol under vigorous shaking for 2 min (Glen Mills SP:SAMPLEPREP_SUMMARY GenoGrinder 2000) followed by centrifugation. The resulting extract was divided SP:SAMPLEPREP_SUMMARY into five fractions: two for analysis by two separate reverse phase SP:SAMPLEPREP_SUMMARY (RP)/UPLC-MS/MS methods with positive ion mode electrospray ionization (ESI), SP:SAMPLEPREP_SUMMARY one for analysis by RP/UPLC-MS/MS with negative ion mode ESI, one for analysis SP:SAMPLEPREP_SUMMARY by HILIC/UPLC-MS/MS with negative ion mode ESI, and one sample was reserved for SP:SAMPLEPREP_SUMMARY backup. Samples were placed briefly on a TurboVap® (Zymark) to remove the SP:SAMPLEPREP_SUMMARY organic solvent. The sample extracts were stored overnight under nitrogen before SP:SAMPLEPREP_SUMMARY preparation for analysis. #CHROMATOGRAPHY CH:CHROMATOGRAPHY_SUMMARY Low pH Lipophilic CH:INSTRUMENT_NAME Waters Acquity CH:COLUMN_NAME Waters ACQUITY UPLC BEH C18 (100 x 2.1mm,1.7um) CH:COLUMN_TEMPERATURE - CH:FLOW_GRADIENT - CH:FLOW_RATE - CH:SOLVENT_A - CH:SOLVENT_B - CH:CHROMATOGRAPHY_TYPE Reversed phase #ANALYSIS AN:LABORATORY_NAME Metabolon AN:ANALYSIS_TYPE MS #MS MS:INSTRUMENT_NAME Thermo Q Exactive Orbitrap MS:INSTRUMENT_TYPE Orbitrap MS:MS_TYPE ESI MS:MS_COMMENTS Proprietary analytical software for integration and peak picking MS:ION_MODE POSITIVE #MS_METABOLITE_DATA MS_METABOLITE_DATA:UNITS Peak Area MS_METABOLITE_DATA_START Samples UHBO-00909 UHBO-00910 UHBO-00911 UHBO-00912 UHBO-00930 UHBO-00931 UHBO-00932 UHBO-00913 UHBO-00914 UHBO-00915 UHBO-00933 UHBO-00934 UHBO-00935 UHBO-00936 UHBO-00916 UHBO-00917 UHBO-00918 UHBO-00919 UHBO-00937 UHBO-00938 UHBO-00939 UHBO-00920 UHBO-00921 UHBO-00922 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1-stearoyl-2-oleoyl-GPE (18:0/18:1) 9546742 #N/A 1-stearoyl-2-oleoyl-GPI (18:0/18:1)* #N/A 1-stearoyl-GPC (18:0) 497300 #N/A 1-stearoyl-GPE (18:0) 9547068 #N/A 1-stearyl-GPC (O-18:0)* 2733532 C04317 1-tricosanoyl-GPC (23:0)* #N/A 2-aminooctanoate 69522 #N/A 2-myristoyl-GPC (14:0)* 460604 #N/A 3-hydroxydecanoylcarnitine 121454166 #N/A 3-hydroxyoleoylcarnitine 129637446 #N/A 3-hydroxypalmitoylcarnitine 126456228 #N/A 4-cholesten-3-one 91477 C00599 5-dodecenoylcarnitine (C12:1) 91825571 #N/A alpha-tocopherol 86472 C02477 arachidonoylcarnitine (C20:4) 136212424 #N/A arachidonoylcholine 122198216 #N/A arachidoylcarnitine (C20)* 53477833 #N/A behenoylcarnitine (C22)* 71464577 #N/A behenoyl dihydrosphingomyelin (d18:0/22:0)* 44260132 #N/A behenoyl sphingomyelin (d18:1/22:0)* 44260125 #N/A bilirubin (E,E)* 129320511 #N/A bilirubin (Z,Z) 5280352 C00486 biliverdin 5280353 C00500 campesterol 173183 C01789 ceramide (d16:1/24:1, d18:1/22:1)* #N/A ceramide (d18:1/20:0, d16:1/22:0, d20:1/18:0)* #N/A ceramide (d18:2/24:1, d18:1/24:2)* #N/A cholesterol C00187 cis-3,4-methyleneheptanoylcarnitine #N/A cis-4-decenoylcarnitine (C10:1) 57357170 #N/A decanoylcarnitine (C10) 10245190 #N/A dihomo-linolenoylcarnitine (C20:3n3 or 6)* #N/A dihomo-linoleoylcarnitine (C20:2)* #N/A docosahexaenoylcholine #N/A eicosenoylcarnitine (C20:1)* #N/A glycosyl ceramide (d18:1/20:0, d16:1/22:0)* #N/A glycosyl ceramide (d18:1/23:1, d17:1/24:1)* #N/A glycosyl ceramide (d18:2/24:1, d18:1/24:2)* #N/A glycosyl-N-behenoyl-sphingadienine (d18:2/22:0)* #N/A glycosyl-N-palmitoyl-sphingosine (d18:1/16:0) #N/A glycosyl-N-stearoyl-sphingosine (d18:1/18:0) #N/A heme 26945 C00032 heptadecenamide (17:1)* 71343948 #N/A hexadecasphingosine (d16:1)* 14767871 #N/A hydroxypalmitoyl sphingomyelin (d18:1/16:0(OH))** #N/A lactosyl-N-palmitoyl-sphingosine (d18:1/16:0) 53477895 #N/A laurylcarnitine (C12) 168381 #N/A lignoceroylcarnitine (C24)* #N/A lignoceroyl sphingomyelin (d18:1/24:0) #N/A linolenoylcarnitine (C18:3)* #N/A linoleoyl-arachidonoyl-glycerol (18:2/20:4) [1]* 9543796 #N/A linoleoyl-arachidonoyl-glycerol (18:2/20:4) [2]* 9543796 #N/A linoleoylcarnitine (C18:2)* 6450015 #N/A linoleoylcholine* 53481656 #N/A linoleoyl-docosahexaenoyl-glycerol (18:2/22:6) [1]* 9543899 #N/A linoleoyl-linoleoyl-glycerol (18:2/18:2) [1]* 9543729 #N/A linoleoyl-linoleoyl-glycerol (18:2/18:2) [2]* 9543729 #N/A margaroylcarnitine (C17)* 53477803 #N/A myristoleoylcarnitine (C14:1)* 129691961 #N/A myristoylcarnitine (C14) 6426854 #N/A myristoyl dihydrosphingomyelin (d18:0/14:0)* 44260138 #N/A nervonoylcarnitine (C24:1)* #N/A nonadecenamide (19:1)* #N/A N-palmitoyl-phytosphingosine (t18:0/16:0) 10506988 #N/A N-palmitoyl-sphinganine (d18:0/16:0) 5283572 #N/A N-palmitoyl-sphingosine (d18:1/16:0) 5283564 #N/A N-stearoyl-sphingosine (d18:1/18:0)* 5283565 #N/A octadecanedioylcarnitine (C18-DC)* #N/A octadecenedioylcarnitine (C18:1-DC)* #N/A octanoylcarnitine (C8) C02838 oleoyl-arachidonoyl-glycerol (18:1/20:4) [1]* 9543786 #N/A oleoyl-arachidonoyl-glycerol (18:1/20:4) [2]* 9543786 #N/A oleoylcarnitine (C18:1) 6441392 #N/A oleoylcholine 59040790 #N/A oleoyl-linoleoyl-glycerol (18:1/18:2) [1] 14275396 #N/A oleoyl-linoleoyl-glycerol (18:1/18:2) [2] 71433693 #N/A palmitoleamide (16:1)* #N/A palmitoleoylcarnitine (C16:1)* 71464547 #N/A palmitoylcarnitine (C16) 461 C02990 palmitoylcholine 151731 #N/A palmitoyl dihydrosphingomyelin (d18:0/16:0)* 9939965 #N/A palmitoyl-linoleoyl-glycerol (16:0/18:2) [2]* 131801744 #N/A palmitoyl sphingomyelin (d18:1/16:0) 9939941 #N/A palmitoyl-sphingosine-phosphoethanolamine (d18:1/16:0) #N/A pentadecanoylcarnitine (C15)* 123132011 #N/A phosphatidylcholine (18:0/20:2, 20:0/18:2)* #N/A retinal 638015 C00376 retinol (vitamin A) 445354 C00473 sphingadienine 6449795 #N/A sphinganine 3126 C00836 sphinganine-1-phosphate 520 #N/A sphingomyelin (d17:1/14:0, d16:1/15:0)* #N/A sphingomyelin (d17:1/16:0, d18:1/15:0, d16:1/17:0)* #N/A sphingomyelin (d17:2/16:0, d18:2/15:0)* #N/A sphingomyelin (d18:0/18:0, d19:0/17:0)* 44260130 #N/A sphingomyelin (d18:0/20:0, d16:0/22:0)* #N/A sphingomyelin (d18:1/14:0, d16:1/16:0)* 11433862 #N/A sphingomyelin (d18:1/17:0, d17:1/18:0, d19:1/16:0) 46891763 #N/A sphingomyelin (d18:1/18:1, d18:2/18:0) 6443882 #N/A sphingomyelin (d18:1/19:0, d19:1/18:0)* #N/A sphingomyelin (d18:1/20:0, d16:1/22:0)* 44260124 #N/A sphingomyelin (d18:1/20:1, d18:2/20:0)* #N/A sphingomyelin (d18:1/21:0, d17:1/22:0, d16:1/23:0)* #N/A sphingomyelin (d18:1/22:1, d18:2/22:0, d16:1/24:1)* #N/A sphingomyelin (d18:1/22:2, d18:2/22:1, d16:1/24:2)* #N/A sphingomyelin (d18:1/24:1, d18:2/24:0)* 44260126 #N/A sphingomyelin (d18:1/25:0, d19:0/24:1, d20:1/23:0, d19:1/24:0)* #N/A sphingomyelin (d18:2/14:0, d18:1/14:1)* #N/A sphingomyelin (d18:2/16:0, d18:1/16:1)* #N/A sphingomyelin (d18:2/18:1)* 52931155 #N/A sphingomyelin (d18:2/21:0, d16:2/23:0)* #N/A sphingomyelin (d18:2/23:0, d18:1/23:1, d17:1/24:1)* 134757653 #N/A sphingomyelin (d18:2/23:1)* #N/A sphingomyelin (d18:2/24:1, d18:1/24:2)* 85336023 #N/A sphingomyelin (d18:2/24:2)* #N/A sphingosine 5280335 C00319 sphingosine 1-phosphate 5283560 C06124 stearoyl-arachidonoyl-glycerol (18:0/20:4) [1]* 6438587 C00165 stearoyl-arachidonoyl-glycerol (18:0/20:4) [2]* 6438587 #N/A stearoylcarnitine (C18) 3006797 #N/A stearoylcholine* 90111 #N/A stearoyl ethanolamide 27902 #N/A stearoyl sphingomyelin (d18:1/18:0) 6453725 C00550 tricosanoyl sphingomyelin (d18:1/23:0)* #N/A undecenoylcarnitine (C11:1) #N/A METABOLITES_END #END