#METABOLOMICS WORKBENCH chiharu_20220518_214708_mwtab.txt DATATRACK_ID:3259 STUDY_ID:ST002170 ANALYSIS_ID:AN003556 PROJECT_ID:PR001381 VERSION 1 CREATED_ON May 19, 2022, 6:48 am #PROJECT PR:PROJECT_TITLE Cecal and serum metabolome of specific-pathogen-free, gnotobiotic (containing a PR:PROJECT_TITLE 14-member synthetic human gut microbiota), and germ-free mice fed with five PR:PROJECT_TITLE distinct rodent diets with varying fiber content and source. PR:PROJECT_SUMMARY In an effort to discern the effects of diverse fibers on host immunity, we PR:PROJECT_SUMMARY employed five distinct rodent diets with varying fiber content and source in PR:PROJECT_SUMMARY specific-pathogen-free, gnotobiotic (containing a 14-member synthetic human gut PR:PROJECT_SUMMARY microbiota), and germ-free mice. PR:INSTITUTE Luxembourg Institute of Health PR:DEPARTMENT Department of Infection and Immunity PR:LAST_NAME Desai PR:FIRST_NAME Mahesh S PR:ADDRESS 4354 Esch-sur-Alzette, Luxembourg PR:EMAIL mahesh.desai@lih.lu PR:PHONE +352 26970-389 #STUDY ST:STUDY_TITLE Cecal metabolome of specific-pathogen-free mice fed with five distinct rodent ST:STUDY_TITLE diets with varying fiber content and source. ST:STUDY_SUMMARY In an effort to discern the effects of diverse fibers on host immunity, we ST:STUDY_SUMMARY employed five distinct rodent diets with varying fiber content and source in ST:STUDY_SUMMARY specific-pathogen-free. ST:INSTITUTE Luxembourg Institute of Health ST:DEPARTMENT Department of Infection and Immunity ST:LAST_NAME Desai ST:FIRST_NAME Mahesh S ST:ADDRESS 4354 Esch-sur-Alzette, Luxembourg ST:EMAIL mahesh.desai@lih.lu ST:PHONE +352 26970-389 #SUBJECT SU:SUBJECT_TYPE Mammal SU:SUBJECT_SPECIES Mus musculus SU:TAXONOMY_ID 10090 SU:GENDER Male and female #FACTORS #SUBJECT_SAMPLE_FACTORS: SUBJECT(optional)[tab]SAMPLE[tab]FACTORS(NAME:VALUE pairs separated by |)[tab]Raw file names and additional sample data SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_LD_4 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:LabDiet RAW_FILE_NAME=1-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_LD_5 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:LabDiet RAW_FILE_NAME=2-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_LD_6 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:LabDiet RAW_FILE_NAME=3-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_LD_8 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:LabDiet RAW_FILE_NAME=4-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_FS_1 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-supplemented RAW_FILE_NAME=5-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_FS_2 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-supplemented RAW_FILE_NAME=6-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_FS_5 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-supplemented RAW_FILE_NAME=7-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_FS_7 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-supplemented RAW_FILE_NAME=8-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_560_FR1 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-rich RAW_FILE_NAME=9-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_561_FR2 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-rich RAW_FILE_NAME=10-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_562_FR3 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-rich RAW_FILE_NAME=11-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_563_FR4 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-rich RAW_FILE_NAME=12-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_In1 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Inulin-supplemented RAW_FILE_NAME=13-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_In3 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Inulin-supplemented RAW_FILE_NAME=14-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_In4 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Inulin-supplemented RAW_FILE_NAME=15-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_In6 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Inulin-supplemented RAW_FILE_NAME=16-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_566_FF1 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-free RAW_FILE_NAME=17-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_567_FF2 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-free RAW_FILE_NAME=18-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_568_FF3 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-free RAW_FILE_NAME=19-130.d SUBJECT_SAMPLE_FACTORS - CC_569_FF4 Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-free RAW_FILE_NAME=20-130.d #COLLECTION CO:COLLECTION_SUMMARY Cecal metabolome of specific-pathogen-free mice fed with five distinct rodent CO:COLLECTION_SUMMARY diets with varying fiber content and source. CO:SAMPLE_TYPE Cecum #TREATMENT TR:TREATMENT_SUMMARY Experiments were performed with 6-week old female BALB/c mice (Charles River TR:TREATMENT_SUMMARY Laboratories, France), housed in the specific-pathogen-free (SPF) facility of TR:TREATMENT_SUMMARY the Luxembourg Institute of Health. Mice were fed on their respective diets for TR:TREATMENT_SUMMARY 40 days and then sacrificed by cervical dislocation. #SAMPLEPREP SP:SAMPLEPREP_SUMMARY Cecal contents were lyophilized using a VD-800R lyophilizer (TAITEC) for 24 SP:SAMPLEPREP_SUMMARY hours. Freeze-dried samples were disrupted with 3.0-mm Zirconia Beads SP:SAMPLEPREP_SUMMARY (Biomedical Science) by vigorous shaking (1,500 rpm for 10 min) using Shake SP:SAMPLEPREP_SUMMARY Master (Biomedical Science). Cecal metabolites were extracted using the SP:SAMPLEPREP_SUMMARY methanol:chloroform:water extraction protocol. #CHROMATOGRAPHY CH:CHROMATOGRAPHY_TYPE Other CH:INSTRUMENT_NAME Agilent CE CH:COLUMN_NAME COSMO(+), i.d.50 μm(anion #ANALYSIS AN:ANALYSIS_TYPE MS #MS MS:INSTRUMENT_NAME Agilent CE-TOFMS MS:INSTRUMENT_TYPE Other MS:MS_TYPE ESI MS:ION_MODE NEGATIVE MS:MS_COMMENTS In-house software (MasterHands) was used for peak area integration and MS:MS_COMMENTS annotation. #MS_METABOLITE_DATA MS_METABOLITE_DATA:UNITS nmol/g MS_METABOLITE_DATA_START Samples CC_LD_4 CC_LD_5 CC_LD_6 CC_LD_8 CC_FS_1 CC_FS_2 CC_FS_5 CC_FS_7 CC_560_FR1 CC_561_FR2 CC_562_FR3 CC_563_FR4 CC_In1 CC_In3 CC_In4 CC_In6 CC_566_FF1 CC_567_FF2 CC_568_FF3 CC_569_FF4 Factors Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:LabDiet Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:LabDiet Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:LabDiet Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:LabDiet Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-supplemented Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-supplemented Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-supplemented Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-supplemented Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-rich Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-rich Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-rich Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-rich Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Inulin-supplemented Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Inulin-supplemented Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Inulin-supplemented Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Inulin-supplemented Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-free Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-free Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-free Organ:Cecum | Treatment:SPF | Diet:Fiber-free Acetyl CoA N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Adenosine 3',5'-diphosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Adenosine 5'-phosphosulfate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Adenylosuccinate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Adipate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. ADP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. ADP-glucose N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. ADP-ribose N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Allantoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. AMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 54 ATP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Azelate 155 98 67 90 47 36 39 30 194 167 252 212 25 21 15 26 44 51 44 22 Barbiturate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Benzoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Benzoylformate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Benzylsuccinate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Biotin N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Butyrate 56526 39881 47333 44507 21836 29365 29129 18922 50704 58415 31494 58664 30671 49929 34748 19159 20794 14415 24960 13578 cAMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Carbamoylaspartate 375 454 230 617 259 151 68 132 115 387 263 318 331 476 311 917 348 200 N.D. N.D. Carbamoylphosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. CDP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. CDP-choline N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. cGMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Cholate 2169 1789 1752 1578 6812 3305 13119 3605 2444 1973 2068 1845 2855 4487 7258 7057 9824 6462 15372 4314 cIMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. cis-Aconitate 4.3 7.8 4.7 6.4 N.D. 9.9 N.D. N.D. 8.6 N.D. 18 11 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Citraconate 7.2 3.6 4.7 6.2 N.D. N.D. 6.3 N.D. 3.7 4.9 N.D. 2.2 5.8 3.7 N.D. N.D. 6.2 6.2 N.D. N.D. Citramalate 87 92 72 141 N.D. N.D. 5.2 3.6 26 17 65 66 24 35 11 11 14 N.D. N.D. N.D. Citrate 214 274 239 380 26 241 11 6.0 272 86 457 378 32 26 24 60 25 10 N.D. 40 CMP N.D. N.D. N.D. N.D. 34 21 N.D. N.D. 7.4 N.D. N.D. N.D. 7.4 13 17 48 3.9 N.D. N.D. 14 CMP-N-acetylneuraminate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 13 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 24 CoA N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Crotonate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. CTP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Cysteate 72 58 47 69 26 32 101 63 33 43 41 42 23 19 24 36 36 43 34 24 Cysteine S-sulfate 117 146 142 56 746 594 4717 2934 279 205 159 158 264 185 433 641 481 1148 1122 177 Cysteine sulfinate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. dADP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. dAMP N.D. N.D. N.D. N.D. 5.6 5.5 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 7.5 N.D. N.D. N.D. N.D. dATP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. DCA 1366 805 554 664 3798 2492 4397 3841 578 835 851 546 569 1115 1913 1440 3253 3841 2138 2042 dCDP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. dCMP N.D. N.D. N.D. N.D. 39 32 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 22 18 N.D. 47 N.D. N.D. N.D. N.D. dCTP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Deamido-NAD+ N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Decanoate N.D. 28 15 9.9 66 37 15 10 14 15 N.D. N.D. 29 15 15 21 22 N.D. 30 54 dGTP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. DHAP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Digalacturonate 15 45 36 11 39 61 137 20 15 22 18 19 17 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Dihydroorotate 145 197 219 324 78 N.D. N.D. N.D. 84 90 165 233 286 276 134 270 142 119 N.D. N.D. dITP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Dodecanedioate 108 108 113 125 6.8 5.2 5.2 4.1 105 99 144 120 5.9 5.0 5.3 5.7 9.6 6.9 7.1 4.5 Dodecanoate 34 N.D. N.D. N.D. 208 66 102 115 56 86 N.D. N.D. 60 64 N.D. 71 106 138 205 182 dTDP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. dTMP N.D. N.D. N.D. N.D. 27 15 N.D. N.D. 11 N.D. N.D. N.D. 21 13 6.5 51 6.9 N.D. N.D. 14 dTTP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. dUDP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. dUMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. dUTP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. F1,6P N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. F6P 13 11 13 15 N.D. N.D. N.D. N.D. 14 16 17 27 35 N.D. N.D. 12 N.D. N.D. N.D. N.D. FAD N.D. 16 16 32 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 20 25 N.D. 18 N.D. N.D. 11 N.D. N.D. 19 Folate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Fumarate 627 606 290 371 206 327 79 263 400 342 342 272 547 353 559 715 292 83 94 18 G1P N.D. 19 17 23 4.6 N.D. N.D. N.D. 50 N.D. 38 73 42 25 N.D. 13 N.D. N.D. N.D. N.D. G3P N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. G6P N.D. 30 43 35 16 14 N.D. N.D. 40 N.D. 67 121 168 86 38 58 N.D. N.D. N.D. N.D. Galacturonate 1-phosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. GDP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. GDP-mannose N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Gluconate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 292 253 302 1698 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Glucosamine 6-phosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Glutarate 379 347 327 454 81 160 404 133 528 423 268 344 298 231 202 223 282 348 215 136 Glycerate 1028 1307 1002 1296 817 912 735 679 1627 2009 1918 1425 1473 1399 2043 1749 840 706 500 552 Glycerophosphate 30 55 44 72 115 26 N.D. N.D. 75 30 84 154 101 44 29 66 N.D. N.D. N.D. 65 Glycocholate N.D. N.D. N.D. N.D. 15 N.D. 26 N.D. N.D. 10 8.4 N.D. 13 18 42 59 35 18 36 N.D. Glycolate 1013 850 902 1208 958 967 967 937 1138 1494 1222 1272 951 1117 880 1042 803 690 686 605 Glyoxylate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. GMP N.D. N.D. N.D. N.D. 7.1 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 15 N.D. N.D. N.D. N.D. GTP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Heptanoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 20 19 18 Hexanoate 55 53 48 65 135 62 66 50 54 67 41 70 85 84 73 62 75 73 69 102 Hippurate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Homovanillate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. IDP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. IMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Indolelactate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Isethionate 42 51 38 34 58 41 131 76 283 91 61 120 101 52 156 122 128 196 81 64 Isobutyryl CoA N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Isocitrate N.D. 9.5 9.2 11 N.D. 9.3 N.D. N.D. N.D. N.D. 22 7.3 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Itaconate 9.4 N.D. 10 13 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 17 N.D. N.D. N.D. 15 7.0 N.D. N.D. N.D. ITP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Lactate 637 2674 1385 4738 2018 3288 1818 1154 8838 3694 3532 20366 7508 1988 3027 1829 1505 1469 2837 3463 Malate 2747 2961 1350 2066 867 1266 182 562 1646 1341 2049 2062 2997 2875 2566 4221 709 152 94 43 Malonate 127 127 110 80 82 64 59 36 359 161 162 211 50 52 37 40 52 26 35 N.D. Malonyl CoA N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Methanesulfonate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Methyl sulfate N.D. N.D. 22 N.D. N.D. 9.8 N.D. N.D. N.D. N.D. 18 15 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 23 N.D. N.D. (Methylthio)acetate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. m-Hydroxybenzoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Mucate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N-Acetylaspartate 126 240 154 231 156 118 60 35 92 266 228 357 84 52 80 112 164 153 119 79 N-Acetyl-beta-alanine N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N-Acetylglucosamine 1-phosphate N.D. N.D. N.D. 8.1 N.D. N.D. N.D. N.D. 9.8 N.D. 16 20 14 N.D. N.D. 7.1 N.D. N.D. N.D. 110 N-Acetylglucosamine 6-phosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N-Acetylglutamate 241 248 155 278 152 113 128 103 144 279 301 236 175 188 210 223 238 123 121 122 N-Acetylleucine 25 20 8.4 18 3.7 4.9 7.7 5.8 5.4 12 11 9.4 11 5.9 14 11 7.5 N.D. 9.7 N.D. N-Acetylmethionine 51 61 50 73 17 36 21 21 32 44 48 71 49 23 34 84 23 23 28 5.9 N-Acetylmuramate 564 575 607 1266 80 105 62 62 308 275 701 650 966 741 407 365 197 121 70 9.5 N-Acetylneuraminate 195 609 282 433 439 385 891 720 2635 2068 969 1289 1728 225 949 1004 332 229 1496 115 N-Acetylphenylalanine 6.2 N.D. N.D. 4.2 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 6.3 9.3 6.4 N.D. N.D. 4.4 3.9 N.D. N.D. N.D. N.D. NAD+ N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. NADH N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. NADP+ N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. NADPH N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N-Carbamylglutamate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N-Formylaspartate 24 28 32 34 N.D. N.D. N.D. N.D. 13 36 38 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N-Formylmethionine 109 86 56 82 36 31 40 27 65 79 57 44 20 21 52 38 57 36 30 N.D. Nicotinate 1551 1365 1371 1703 612 557 459 413 1429 1439 1778 1760 1689 1632 1940 1730 809 655 507 169 o-Coumarate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Octanoate N.D. N.D. N.D. N.D. 21 N.D. N.D. 8.3 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 28 25 o-Hydroxybenzoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. o-Hydroxyhippurate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. O-Phosphoserine N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Orotate 326 302 355 535 166 89 N.D. 151 308 155 637 539 489 419 415 419 239 213 159 N.D. Orotidine 5'-monophosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. P1, P4-Di(adenosine-5') tetraphosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Pantothenate 452 380 362 560 195 175 146 146 281 366 534 407 368 345 435 382 273 196 157 15 p-Coumarate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Pelargonate 32 34 24 N.D. 62 47 45 40 46 51 24 N.D. 38 43 N.D. N.D. 68 88 106 65 Pentanoate 4001 2926 2422 4014 2193 3760 3298 2997 1392 2258 1201 1205 2179 2543 2669 2414 4632 3605 4328 3722 PEP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Phenaceturate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Phenyl phosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Phenylpyruvate 188 204 123 465 116 71 54 66 126 200 386 268 320 134 189 159 162 89 131 N.D. Phosphonoacetate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Phthalate 4.0 3.7 3.8 3.9 2.1 3.0 2.0 N.D. 17 13 14 13 2.4 N.D. 3.2 2.4 13 2.8 N.D. N.D. p-Hydroxybenzoate 113 87 N.D. N.D. 44 51 88 39 160 176 63 98 84 50 45 65 74 107 51 N.D. p-Hydroxyphenylacetate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 572 Pimelate 16 8.7 N.D. 15 N.D. N.D. N.D. N.D. 27 15 N.D. 29 17 N.D. N.D. N.D. 13 N.D. N.D. N.D. Porphobilinogen N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Propionate 28917 24539 17884 26735 12169 22700 14260 13070 23360 23405 16796 14542 40443 36738 30704 31150 14950 9953 13243 8773 Prostaglandin E2 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Prostaglandin F2alpha N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. PRPP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Pyrrole-2-carboxylate 7.4 16 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 16 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Pyruvate 1085 1126 433 1873 518 N.D. 660 783 615 1244 1491 911 1856 459 842 1002 N.D. N.D. 1087 N.D. Quinate N.D. 26 20 N.D. 88 55 147 46 60 39 31 39 46 59 62 43 99 60 57 30 R5P N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Ribulose 1,5-diphosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Ru5P N.D. N.D. N.D. N.D. 25 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 31 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. S7P N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Saccharate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Sebacate 33 22 23 30 5.9 6.9 4.4 3.4 52 42 67 52 4.9 4.5 3.4 4.6 12 7.2 6.1 4.5 Serine O-sulfate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Shikimate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Sinapate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Sorbitol 6-phosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Succinate 1241 1020 635 2745 1016 840 1675 1204 3172 1149 1594 1480 6373 2012 2747 839 1522 573 1462 447 Succinyl CoA N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Syringate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 237 N.D. N.D. 106 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Tartrate N.D. N.D. N.D. N.D. 39 29 15 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 16 20 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Taurocholate 83 52 85 78 92 42 166 35 74 76 48 59 35 48 78 106 102 72 482 637 TDP-glucose N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Terephthalate N.D. N.D. N.D. N.D. 6.0 16 7.4 7.1 15 11 12 N.D. N.D. 14 N.D. 12 N.D. 7.6 7.2 N.D. Threonate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Tiglate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. trans-4-Hydroxy-3-methoxycinnamate 1626 2081 1810 1419 173 136 295 145 5064 2131 4148 3950 236 190 215 186 172 161 142 N.D. trans-Aconitate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. trans-Cinnamate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Trehalose 6-phosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. UDP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. UDP-glucose N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. UDP-glucuronate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. UDP-N-acetylglucosamine N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 31 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. UMP N.D. 16 N.D. N.D. 29 13 N.D. N.D. N.D. 13 N.D. 21 17 23 19 41 10 N.D. N.D. 52 Undecanoate N.D. 8.6 N.D. N.D. N.D. 13 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 6.7 10 12 16 N.D. 8.0 5.4 11 Urate 403 759 156 116 316 724 395 274 327 1048 366 224 312 229 470 892 189 210 155 47 UTP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Xanthurenate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 13 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 8.5 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. XMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. XTP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 1-Aminoethylphosphonate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2',3'-cCMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2,3-DPG N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2,3-Pyridinedicarboxylate 27 17 21 29 13 8.4 31 13 34 34 40 35 22 14 20 22 37 23 9.0 8.9 2,4-Dihydroxypyrimidine-5-carboxylate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2,5-Dihydroxybenzoate 59 67 93 68 N.D. N.D. N.D. N.D. 36 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Amino-3-phosphonopropionate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Aminoethylphosphonate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Deoxyglucose 6-phosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Deoxyribose 1-phosphate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Furoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Hydroxy-4-methylpentanoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Hydroxybutyrate 19 55 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 63 N.D. 44 78 68 35 N.D. 37 20 N.D. 35 N.D. 2-Hydroxyglutarate 476 200 166 469 54 43 89 69 83 218 256 246 702 430 347 184 116 72 52 62 2-Hydroxyisobutyrate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Hydroxyoctanoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Hydroxypentanoate 21 18 21 19 12 12 10 8.7 32 25 35 27 16 36 11 14 20 15 17 16 2-Hydroxyphenylacetate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Isopropylmalate 3.7 4.1 3.7 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 6.5 5.3 4.5 7.9 9.3 5.8 3.2 1.7 N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Oxoadipate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Oxobutyrate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Oxoglutarate 1434 1524 791 3507 1276 655 656 764 762 1894 3898 1693 2267 1098 1417 1053 1473 703 877 N.D. 2-Oxoisopentanoate 817 1017 369 1674 609 377 395 517 409 1162 1601 986 963 417 666 605 532 265 363 N.D. 2-Oxooctanoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2PG N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Quinolinecarboxylate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 2-Thiopheneacetate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 3-(2-Hydroxyphenyl)propionate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 3-(4-Hydroxyphenyl)propionate 1475 1722 2135 1934 48 147 130 60 1358 1126 1116 1566 259 72 111 108 258 223 146 48 3',5'-Cyclic dAMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 3'-AMP N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 3-Hydroxy-3-methylglutarate 46 50 53 42 N.D. 8.5 6.7 N.D. 302 84 85 209 26 N.D. N.D. 6.1 13 N.D. N.D. N.D. 3-Hydroxybutyrate 538 540 1029 429 99 120 99 87 911 394 583 624 104 103 108 132 105 131 N.D. N.D. 3-Hydroxypropionate 167 222 143 316 N.D. N.D. 89 106 130 151 177 208 N.D. N.D. N.D. 107 130 N.D. N.D. N.D. 3-Indolebutyrate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 3-Indoxyl sulfate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 3-Methylbutanoate 1680 1295 775 1866 736 850 1087 1229 617 1143 791 550 555 894 799 1000 1923 1223 1374 1287 3PG N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 3-Phenyllactate N.D. N.D. 22 119 N.D. N.D. N.D. N.D. 65 54 72 204 136 51 63 33 N.D. N.D. N.D. 6.8 3-Phenylpropionate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 3-Ureidopropionate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 4-Acetylbutyrate 15 N.D. 23 22 13 21 N.D. N.D. 11 23 16 23 19 N.D. 23 14 18 30 36 N.D. 4-Hydroxy-3-methoxymandelate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 4-Hydroxymandelate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 4-Methyl-2-oxopentanoate 4286 4769 2031 9084 2916 1714 1788 2289 2069 5244 7996 5031 4757 2007 3211 2959 2749 1506 2062 52 4-Methylthio-2-oxobutyrate 515 575 320 1040 311 208 N.D. 179 356 601 950 580 799 363 534 348 368 223 317 N.D. 4-Oxohexanoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 4-Oxopentanoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 4-Pyridoxate N.D. N.D. N.D. N.D. 3.5 5.7 12 5.8 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 12 15 6.2 4.1 6-Hydroxyhexanoate N.D. N.D. N.D. N.D. 27 28 30 N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 38 N.D. 12 57 54 38 35 6-Phosphogluconate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. 10-Hydroxydecanoate N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. Glucuronate 748 830 944 909 269 102 553 297 1745 915 1305 1771 261 121 261 287 123 114 236 35 MS_METABOLITE_DATA_END #METABOLITES METABOLITES_START metabolite_name KEGG ID quantified m/z Formula Acetyl CoA C00024 403.5596 C23H38N7O17P3S Adenosine 3',5'-diphosphate C00054 426.0257 C10H15N5O10P2 Adenosine 5'-phosphosulfate C00224 426.0159 C10H14N5O10PS Adenylosuccinate C03794 462.0703 C14H18N5O11P Adipate C06104 145.0520 C6H10O4 ADP C00008 426.0256 C10H15N5O10P2 ADP-glucose C00498 588.0783 C16H25N5O15P2 ADP-ribose C00301 558.0678 C15H23N5O14P2 Allantoate C00499 175.0493 C4H8N4O4 AMP C00020 346.0591 C10H14N5O7P ATP C00002 505.9922 C10H16N5O13P3 Azelate C08261 187.0998 C9H16O4 Barbiturate C00813 127.0164 C4H4N2O3 Benzoate C00180 121.0312 C7H6O2 Benzoylformate C02137 149.0258 C8H6O3 Benzylsuccinate C09816 207.0692 C11H12O4 Biotin C00120 243.0835 C10H16N2O3S Butyrate C00246 87.0468 C4H8O2 cAMP C00575 328.0482 C10H12N5O6P Carbamoylaspartate C00438 175.0378 C5H8N2O5 Carbamoylphosphate C00169 139.9769 CH4NO5P CDP C00112 402.0143 C9H15N3O11P2 CDP-choline C00307 547.1238 C14H26N4O11P2 cGMP C00942 344.0435 C10H12N5O7P Cholate C00695 407.2850 C24H40O5 cIMP C00943 329.0320 C10H11N4O7P cis-Aconitate C00417 173.0108 C6H6O6 Citraconate C02226 129.0213 C5H6O4 Citramalate C02614 147.0314 C5H8O5 Citrate C00158 191.0208 C6H8O7 CMP C00055 322.0479 C9H14N3O8P CMP-N-acetylneuraminate C00128 613.1431 C20H31N4O16P CoA C00010 382.5545 C21H36N7O16P3S Crotonate C01771 85.0314 C4H6O2 CTP C00063 481.9809 C9H16N3O14P3 Cysteate C00506 167.9988 C3H7NO5S Cysteine S-sulfate C05824 199.9715 C3H7NO5S2 Cysteine sulfinate C00606 152.0034 C3H7NO4S dADP C00206 410.0305 C10H15N5O9P2 dAMP C00360 330.0635 C10H14N5O6P dATP C00131 489.9966 C10H16N5O12P3 DCA C04483 391.2891 C24H40O4 dCDP C00705 386.0193 C9H15N3O10P2 dCMP C00239 306.0523 C9H14N3O7P dCTP C00458 465.9862 C9H16N3O13P3 Deamido-NAD+ C00857 663.0892 C21H26N6O15P2 Decanoate C01571 171.1409 C10H20O2 dGTP C00286 505.9920 C10H16N5O13P3 DHAP C00111 168.9936 C3H7O6P Digalacturonate C02273 369.0712 C12H18O13 Dihydroorotate C00337 157.0273 C5H6N2O4 dITP C01345 490.9807 C10H15N4O13P3 Dodecanedioate C02678 229.1473 C12H22O4 Dodecanoate C02679 199.1723 C12H24O2 dTDP C00363 401.0189 C10H16N2O11P2 dTMP C00364 321.0524 C10H15N2O8P dTTP C00459 480.9859 C10H17N2O14P3 dUDP C01346 387.0037 C9H14N2O11P2 dUMP C00365 307.0367 C9H13N2O8P dUTP C00460 466.9697 C9H15N2O14P3 F1,6P C00354 338.9921 C6H14O12P2 F6P C00085 259.0243 C6H13O9P FAD C00016 784.1541 C27H33N9O15P2 Folate C00504 440.1354 C19H19N7O6 Fumarate C00122 115.0055 C4H4O4 G1P C00103 259.0248 C6H13O9P G3P C00661 168.9929 C3H7O6P G6P C00092 259.0248 C6H13O9P Galacturonate 1-phosphate C04037 273.0051 C6H11O10P GDP C00035 442.0207 C10H15N5O11P2 GDP-mannose C00096 604.0733 C16H25N5O16P2 Gluconate C00257 195.0535 C6H12O7 Glucosamine 6-phosphate C00352 258.0412 C6H14NO8P Glutarate C00489 131.0368 C5H8O4 Glycerate C00258 105.0209 C3H6O4 Glycerophosphate C00093 171.0078 C3H9O6P Glycocholate C01921 464.3029 C26H43NO6 Glycolate C00160 75.0101 C2H4O3 Glyoxylate C00048 72.9943 C2H2O3 GMP C00144 362.0531 C10H14N5O8P GTP C00044 521.9867 C10H16N5O14P3 Heptanoate C17714 129.0926 C7H14O2 Hexanoate C01585 115.0775 C6H12O2 Hippurate C01586 178.0529 C9H9NO3 Homovanillate C05582 181.0521 C9H10O4 IDP C00104 427.0098 C10H14N4O11P2 IMP C00130 347.0432 C10H13N4O8P Indolelactate C02043 204.0689 C11H11NO3 Isethionate C05123 124.9929 C2H6O4S Isobutyryl CoA C00630 417.5753 C25H42N7O17P3S Isocitrate C00311 191.0215 C6H8O7 Itaconate C00490 129.0208 C5H6O4 ITP C00081 506.9760 C10H15N4O14P3 Lactate C00186 89.0264 C3H6O3 Malate C00711 133.0157 C4H6O5 Malonate C00383 103.0053 C3H4O4 Malonyl CoA C00083 425.5549 C24H38N7O19P3S Methanesulfonate C11145 94.9829 CH4O3S Methyl sulfate C02704 110.9776 CH4O4S (Methylthio)acetate C03173 105.0038 C3H6O2S m-Hydroxybenzoate C00587 137.0264 C7H6O3 Mucate C00879 209.0328 C6H10O8 N-Acetylaspartate C01042 174.0430 C6H9NO5 N-Acetyl-beta-alanine C01073 130.0528 C5H9NO3 N-Acetylglucosamine 1-phosphate C04501 300.0525 C8H16NO9P N-Acetylglucosamine 6-phosphate C00357 300.0522 C8H16NO9P N-Acetylglutamate C00624 188.0584 C7H11NO5 N-Acetylleucine C02710 172.0994 C8H15NO3 N-Acetylmethionine C02712 190.0570 C7H13NO3S N-Acetylmuramate C02713 292.1066 C11H19NO8 N-Acetylneuraminate C00270 308.1019 C11H19NO9 N-Acetylphenylalanine C03519 206.0832 C11H13NO3 NAD+ C00003 662.1051 C21H27N7O14P2 NADH C00004 664.1206 C21H29N7O14P2 NADP+ C00006 742.0722 C21H28N7O17P3 NADPH C00005 371.5425 C21H30N7O17P3 N-Carbamylglutamate C05829 189.0542 C6H10N2O5 N-Formylaspartate C01044 160.0271 C5H7NO5 N-Formylmethionine C03145 176.0395 C6H11NO3S Nicotinate C00253 122.0268 C6H5NO2 o-Coumarate C01772 163.0422 C9H8O3 Octanoate C06423 143.1088 C8H16O2 o-Hydroxybenzoate C00805 137.0263 C7H6O3 o-Hydroxyhippurate C07588 194.0485 C9H9NO4 O-Phosphoserine C01005 184.0043 C3H8NO6P Orotate C00295 155.0121 C5H4N2O4 Orotidine 5'-monophosphate C01103 367.0219 C10H13N2O11P P1, P4-Di(adenosine-5') tetraphosphate C01260 417.0211 C20H28N10O19P4 Pantothenate C00864 218.1057 C9H17NO5 p-Coumarate C00811 163.0423 C9H8O3 Pelargonate C01601 157.1229 C9H18O2 Pentanoate C00803 101.0626 C5H10O2 PEP C00074 166.9776 C3H5O6P Phenaceturate C05598 192.0685 C10H11NO3 Phenyl phosphate C02734 173.0032 C6H7O4P Phenylpyruvate C00166 163.0421 C9H8O3 Phosphonoacetate C05682 138.9816 C2H5O5P Phthalate C01606 165.0218 C8H6O4 p-Hydroxybenzoate C00156 137.0264 C7H6O3 p-Hydroxyphenylacetate C00642 151.0419 C8H8O3 Pimelate C02656 159.0679 C7H12O4 Porphobilinogen C00931 225.0907 C10H14N2O4 Propionate C00163 73.0309 C3H6O2 Prostaglandin E2 C00584 351.2180 C20H32O5 Prostaglandin F2alpha C00639 353.2370 C20H34O5 PRPP C00119 388.9481 C5H13O14P3 Pyrrole-2-carboxylate C05942 110.0260 C5H5NO2 Pyruvate C00022 87.0102 C3H4O3 Quinate C00296 191.0582 C7H12O6 R5P C00117 229.0145 C5H11O8P Ribulose 1,5-diphosphate C01182 308.9813 C5H12O11P2 Ru5P C00199 229.0140 C5H11O8P S7P C05382 289.0363 C7H15O10P Saccharate C00818 209.0329 C6H10O8 Sebacate C08277 201.1155 C10H18O4 Serine O-sulfate C02703 183.9939 C3H7NO6S Shikimate C00493 173.0519 C7H10O5 Sinapate C00482 223.0640 C11H12O5 Sorbitol 6-phosphate C01096 261.0407 C6H15O9P Succinate C00042 117.0210 C4H6O4 Succinyl CoA C00091 432.5622 C25H40N7O19P3S Syringate C10833 197.0474 C9H10O5 Tartrate C00898 149.0112 C4H6O6 Taurocholate C05122 514.2878 C26H45NO7S TDP-glucose C00842 563.0722 C16H26N2O16P2 Terephthalate C06337 165.0219 C8H6O4 Threonate C01620 135.0315 C4H8O5 Tiglate C08279 99.0461 C5H8O2 trans-4-Hydroxy-3-methoxycinnamate C01494 193.0511 C10H10O4 trans-Aconitate C02341 173.0113 C6H6O6 trans-Cinnamate C00423 147.0471 C9H8O2 Trehalose 6-phosphate C00689 421.0801 C12H23O14P UDP C00015 402.9984 C9H14N2O12P2 UDP-glucose C00029 565.0513 C15H24N2O17P2 UDP-glucuronate C00167 579.0304 C15H22N2O18P2 UDP-N-acetylglucosamine C00043 606.0777 C17H27N3O17P2 UMP C00105 323.0304 C9H13N2O9P Undecanoate C17715 185.1567 C11H22O2 Urate C00366 167.0237 C5H4N4O3 UTP C00075 482.9648 C9H15N2O15P3 Xanthurenate C02470 204.0321 C10H7NO4 XMP C00655 363.0382 C10H13N4O9P XTP C00700 522.9712 C10H15N4O15P3 1-Aminoethylphosphonate C03782 124.0185 C2H8NO3P 2',3'-cCMP C02354 304.0372 C9H12N3O7P 2,3-DPG C01159 264.9547 C3H8O10P2 2,3-Pyridinedicarboxylate C03722 166.0172 C7H5NO4 2,4-Dihydroxypyrimidine-5-carboxylate C03030 155.0115 C5H4N2O4 2,5-Dihydroxybenzoate C00628 153.0211 C7H6O4 2-Amino-3-phosphonopropionate C05672 168.0087 C3H8NO5P 2-Aminoethylphosphonate C03557 124.0184 C2H8NO3P 2-Deoxyglucose 6-phosphate C06369 243.0302 C6H13O8P 2-Deoxyribose 1-phosphate C00672 213.0195 C5H11O7P 2-Furoate C01546 111.0105 C5H4O3 2-Hydroxy-4-methylpentanoate C03264 131.0733 C6H12O3 2-Hydroxybutyrate C05984 103.0415 C4H8O3 2-Hydroxyglutarate C02630 147.0312 C5H8O5 2-Hydroxyisobutyrate - 103.0420 C4H8O3 2-Hydroxyoctanoate - 159.1045 C8H16O3 2-Hydroxypentanoate - 117.0569 C5H10O3 2-Hydroxyphenylacetate C05852 151.0418 C8H8O3 2-Isopropylmalate C02504 175.0629 C7H12O5 2-Oxoadipate C00322 159.0321 C6H8O5 2-Oxobutyrate C00109 101.0254 C4H6O3 2-Oxoglutarate C00026 145.0158 C5H6O5 2-Oxoisopentanoate C00141 115.0419 C5H8O3 2-Oxooctanoate - 157.0886 C8H14O3 2PG C00631 184.9882 C3H7O7P 2-Quinolinecarboxylate C06325 172.0426 C10H7NO2 2-Thiopheneacetate C02595 141.0039 C6H6O2S 3-(2-Hydroxyphenyl)propionate C01198 165.0579 C9H10O3 3-(4-Hydroxyphenyl)propionate C01744 165.0579 C9H10O3 3',5'-Cyclic dAMP C00968 312.0534 C10H12N5O5P 3'-AMP C01367 346.0589 C10H14N5O7P 3-Hydroxy-3-methylglutarate C03761 161.0476 C6H10O5 3-Hydroxybutyrate C01089 103.0413 C4H8O3 3-Hydroxypropionate C01013 89.0261 C3H6O3 3-Indolebutyrate C11284 202.0899 C12H13NO2 3-Indoxyl sulfate - 212.0051 C8H7NO4S 3-Methylbutanoate C08262 101.0625 C5H10O2 3PG C00197 184.9882 C3H7O7P 3-Phenyllactate C05607 165.0561 C9H10O3 3-Phenylpropionate C05629 149.0628 C9H10O2 3-Ureidopropionate C02642 131.0474 C4H8N2O3 4-Acetylbutyrate C02129 129.0574 C6H10O3 4-Hydroxy-3-methoxymandelate C05584 197.0476 C9H10O5 4-Hydroxymandelate C11527 167.0376 C8H8O4 4-Methyl-2-oxopentanoate C00233 129.0575 C6H10O3 4-Methylthio-2-oxobutyrate C01180 147.0135 C5H8O3S 4-Oxohexanoate - 129.0574 C6H10O3 4-Oxopentanoate - 115.0419 C5H8O3 4-Pyridoxate C00847 182.0473 C8H9NO4 6-Hydroxyhexanoate C06103 131.0725 C6H12O3 6-Phosphogluconate C00345 275.0206 C6H13O10P 10-Hydroxydecanoate C02774 187.1364 C10H20O3 Glucuronate C00191 193.0366 C6H10O7 METABOLITES_END #END