Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST000885)

(Analysis AN001442)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12
5-hydroxytryptophan	ME227848	0.90	0.50	0.23	0.83	0.55	3.56	0.79	0.54	1.83	0.79	0.64	0.82
serotonin	ME227849	0.84	0.79	0.21	0.80	0.82	3.02	0.62	0.81	1.64	0.80	0.94	0.69
C8 carnitine	ME227925	1.64	0.84	1.48	1.05	0.65	1.03	0.93	0.73	1.06	0.79	0.78	1.03
ornithine	ME227871	1.26	0.86	1.42	1.21	0.68	0.78	1.16	0.63	1.06	1.18	0.66	1.14
C12 carnitine	ME227929	1.51	0.82	1.24	1.11	0.65	0.95	0.99	0.67	1.13	1.14	0.84	0.97
C3-DC carnitine	ME227916	1.24	0.91	1.25	1.21	0.81	1.10	1.04	0.79	1.12	1.00	0.79	0.78
C4-OH carnitine	ME227919	1.24	0.91	1.25	1.21	0.81	1.10	1.04	0.79	1.12	1.00	0.79	0.78
alanine	ME227857	0.87	1.16	0.90	0.90	1.18	0.82	0.91	1.13	0.98	0.98	1.14	1.03
histidine	ME227862	0.74	1.08	1.02	1.06	1.16	0.88	0.78	1.06	1.13	0.79	1.05	1.25
tyramine	ME227944	0.83	0.97	1.21	1.41	0.92	1.43	0.77	0.80	0.99	0.82	0.90	1.04
C2 carnitine	ME227914	1.02	1.06	1.35	0.82	0.92	1.08	0.78	0.91	1.17	0.79	0.96	1.12
C16 carnitine	ME227934	0.97	0.92	1.16	1.02	0.86	1.32	0.89	0.85	1.12	0.98	0.88	1.03
mevalonic acid	ME227906	1.08	0.97	0.99	0.97	0.89	1.12	1.08	1.01	0.95	0.93	0.96	1.04
C9 carnitine	ME227926	1.08	0.86	2.39	0.70	0.64	1.09	0.86	0.63	1.29	0.69	0.65	1.08
dimethylglycine	ME227875	0.78	0.76	2.01	0.85	0.83	1.26	0.88	0.87	1.09	0.88	0.74	1.02
5-HIAA	ME227874	0.87	0.80	1.93	0.99	0.84	0.89	0.88	0.83	1.10	0.87	0.88	1.12
NMMA	ME227880	0.90	0.98	1.85	0.78	0.83	1.06	0.78	0.79	1.19	0.79	0.75	1.26
C18:2 carnitine	ME227939	0.64	0.69	1.79	0.65	0.72	2.07	0.57	0.63	1.40	0.58	0.76	1.45
N-methyltryptamine	ME227952	0.77	0.54	1.35	1.12	0.52	1.83	0.72	0.72	1.70	0.92	0.75	1.08
betaine	ME227889	0.84	0.85	1.59	0.77	0.81	1.33	0.71	0.77	1.35	0.76	0.77	1.41
5-hydroxytryptophol	ME227946	0.82	0.83	1.47	0.82	0.84	1.09	0.86	0.83	1.40	0.82	0.81	1.37
5-methoxytryptophol	ME227954	0.79	0.84	1.48	0.99	0.71	1.25	0.79	0.81	1.38	0.96	0.72	1.30
phenylalanine-d8	ME227843	0.73	0.65	1.57	0.72	0.68	1.71	0.76	0.70	1.53	0.71	0.68	1.50
proline	ME227870	0.69	0.79	1.26	0.71	0.80	1.31	0.73	0.79	1.64	0.74	0.76	1.74
valine	ME227864	0.69	0.62	1.39	0.75	0.72	1.42	0.80	0.72	1.66	0.78	0.74	1.64
guanine	ME227853	1.68	1.12	0.00	1.83	1.22	0.00	1.80	1.07	0.01	2.12	1.27	0.00
phosphocholine	ME227891	1.82	1.04	0.06	1.86	1.14	0.06	1.89	1.15	0.06	1.77	1.23	0.08
spermidine	ME227894	2.05	1.25	0.01	1.80	1.13	0.01	1.86	1.02	0.01	1.87	1.13	0.01
carnosine	ME227885	1.57	1.31	0.06	2.00	1.44	0.05	1.64	1.17	0.06	1.57	1.24	0.06
guanidinoacetic acid	ME227948	1.91	1.43	0.08	2.12	1.34	0.07	1.37	1.06	0.07	1.48	1.19	0.07
argininosuccinate	ME227877	0.92	1.45	0.01	0.98	1.20	0.00	0.96	1.10	NA	1.05	1.00	0.01
hypoxanthine	ME227854	1.26	1.18	0.02	1.32	1.19	0.01	1.30	1.18	0.04	1.26	1.17	0.02
C20:4 carnitine	ME227855	1.56	1.68	0.22	1.47	1.38	0.19	1.37	1.32	0.17	1.35	1.20	0.15
thymidine	ME227902	1.39	1.49	0.24	1.23	1.37	0.25	1.44	1.38	0.23	1.31	1.36	0.34
beta-alanine	ME227912	1.26	1.34	0.33	1.32	1.30	0.33	1.44	1.40	0.31	1.37	1.32	0.32
valine-d8	ME227844	1.34	1.27	0.42	1.31	1.26	0.38	1.33	1.32	0.41	1.31	1.31	0.39
alpha-glycerophosphocholine	ME227893	1.46	1.31	0.21	1.47	1.32	0.19	1.52	1.31	0.19	1.47	1.39	0.24
glycine	ME227856	1.41	1.39	0.47	1.43	1.40	0.15	1.33	1.32	0.22	1.36	1.38	0.21
niacinamide	ME227888	1.59	1.44	0.07	1.68	1.19	0.04	1.53	1.61	0.04	1.46	1.42	0.04
aspartate	ME227860	1.56	1.38	0.00	1.68	1.45	0.00	1.56	1.36	0.00	1.68	1.43	0.00
GABA	ME227845	1.51	1.40	0.00	1.60	1.43	0.00	1.64	1.52	0.00	1.58	1.42	0.00
picolinic acid	ME227953	1.55	1.47	0.04	1.55	1.46	0.03	1.49	1.44	0.02	1.54	1.46	0.02
adenosine	ME227900	1.50	1.56	0.00	1.44	1.54	0.00	1.45	1.54	0.00	1.49	1.55	0.00
glutamate	ME227846	1.48	1.58	0.02	1.44	1.56	0.02	1.37	1.51	0.01	1.44	1.62	0.02
methylthioadenosine	ME227945	1.33	1.66	0.00	1.33	1.60	0.00	1.55	1.67	0.00	1.34	1.56	0.00
phosphoethanolamine	ME227892	1.30	1.64	0.01	1.37	1.66	0.01	1.37	1.64	0.01	1.44	1.62	0.01
asparagine	ME227861	1.23	1.51	0.16	1.28	1.57	0.19	1.26	1.53	0.23	1.28	1.55	0.27
pipecolic acid	ME227907	1.37	1.49	0.12	1.42	1.52	0.12	1.40	1.51	0.14	1.37	1.47	0.12
butyrobetaine	ME227908	0.94	1.63	0.71	0.91	1.65	0.31	0.87	1.58	0.38	1.07	1.58	0.34
N-acetylserotonin	ME227950	0.99	1.78	0.14	1.16	1.89	0.34	1.02	1.75	0.21	1.19	1.42	0.15
serine	ME227858	0.97	1.58	0.23	1.14	1.78	0.21	1.06	1.68	0.25	1.16	1.69	0.27
taurine	ME227873	1.04	1.69	0.33	1.00	1.64	0.34	0.96	1.63	0.31	1.16	1.60	0.31
adenine	ME227955	0.81	1.47	0.21	1.19	1.52	0.81	1.31	1.49	0.58	1.10	1.43	0.11
1-methylhistamine	ME227883	1.19	1.14	0.46	1.43	1.53	0.75	1.01	1.22	0.54	1.05	1.23	0.53
cytosine	ME227901	0.91	1.39	0.59	0.95	1.41	0.62	1.01	1.40	0.63	1.15	1.34	0.59
C5-DC carnitine	ME227922	0.77	0.72	0.45	1.60	1.40	0.49	1.38	1.45	0.55	1.37	1.48	0.45
C22:6 carnitine	ME227941	1.58	1.57	0.92	1.12	1.11	0.33	1.27	1.10	0.29	1.27	1.13	0.32
spermine	ME227943	1.57	1.03	0.50	1.41	1.11	0.33	1.52	1.20	0.43	1.54	1.09	0.35
C18 carnitine	ME227936	1.46	1.05	0.41	1.74	1.03	0.59	1.52	1.03	0.48	1.43	0.86	0.50
C18:1 carnitine	ME227937	1.51	1.06	0.59	1.44	1.03	0.67	1.30	0.99	0.59	1.35	0.98	0.55
C16-OH carnitine	ME227935	1.74	1.36	0.46	1.54	1.02	0.39	1.34	1.02	0.45	1.33	1.07	0.39
C18:1-OH carnitine	ME227938	1.64	1.27	0.52	1.58	1.01	0.47	1.33	1.02	0.54	1.32	0.93	0.47
C7 carnitine	ME227924	1.37	1.03	0.96	1.36	0.99	0.35	1.44	1.11	0.49	1.37	1.20	0.39
sarcosine	ME227911	1.43	1.19	0.46	1.45	1.23	0.41	1.29	1.21	0.37	1.39	1.25	0.38
C3-DC-CH3 carnitine	ME227917	1.44	1.17	0.56	1.34	1.16	0.41	1.34	1.16	0.49	1.41	1.13	0.46
citrulline	ME227872	1.48	1.26	0.56	1.37	1.14	0.33	1.27	1.11	0.52	1.38	1.17	0.46
C14 carnitine	ME227931	1.40	1.22	0.72	1.24	1.08	0.52	1.09	1.10	0.62	1.35	1.17	0.53
choline	ME227890	1.25	1.21	0.48	1.28	1.19	0.51	1.35	1.23	0.52	1.36	1.19	0.48
creatine	ME227895	1.31	1.24	0.58	1.27	1.22	0.53	1.23	1.20	0.50	1.24	1.22	0.51
epinephrine	ME227942	1.36	1.21	0.47	1.27	1.23	0.59	1.13	1.15	0.62	1.26	1.20	0.56
putrescine	ME227909	1.47	1.30	0.55	1.27	1.10	0.50	1.21	1.13	0.54	1.26	1.18	0.54
C5:1 carnitine	ME227921	1.22	1.34	0.63	1.04	1.28	0.48	1.14	1.34	0.54	1.21	1.31	0.47
C5 carnitine	ME227920	1.48	1.44	0.69	1.05	1.18	0.36	1.20	1.32	0.43	1.23	1.28	0.35
hydroxyproline	ME227947	1.39	1.69	0.88	1.03	1.12	0.59	0.79	1.00	0.69	0.97	1.11	0.76
lysine	ME227863	1.02	0.98	0.44	1.23	1.17	0.54	1.26	1.17	0.83	1.30	1.20	0.89
C20 carnitine	ME227940	1.27	1.01	0.58	1.30	0.97	0.95	1.22	1.02	0.89	1.15	0.87	0.82
carnitine	ME227913	1.26	1.20	1.04	1.12	1.04	0.55	1.14	1.09	0.70	1.15	1.02	0.71
thiamine	ME227887	1.31	1.16	1.02	1.12	0.98	0.74	1.15	0.99	0.84	1.10	0.93	0.69
triiodothyronine	ME227897	1.06	1.06	0.84	1.41	1.01	0.89	1.01	0.89	1.02	1.15	0.99	0.75
cAMP	ME227852	1.12	1.08	0.96	1.18	1.10	0.76	1.04	0.98	0.86	1.07	1.08	0.81
SDMA	ME227879	1.11	1.12	0.84	1.10	1.10	0.86	1.00	0.99	0.90	1.05	1.03	0.92
dopamine	ME227851	0.37	1.84	0.22	2.38	2.08	0.23	0.39	1.59	0.27	0.83	1.84	0.20
xanthosine	ME227903	0.95	1.74	0.02	2.01	1.90	0.07	1.04	1.78	0.05	1.05	1.53	0.02
5-adenosylhomocysteine	ME227884	0.84	2.02	0.00	0.95	2.15	0.01	0.96	2.22	0.00	1.03	1.82	0.00
acetylcholine	ME227847	0.65	1.69	0.00	0.60	1.44	0.00	0.61	1.51	0.00	0.80	1.47	0.00
trimethylamine-N-oxide	ME227899	0.79	0.79	4.74	0.56	0.53	0.46	0.62	0.63	1.30	0.55	0.54	0.43
3-indoleacetic acid	ME227949	0.10	0.08	3.91	0.07	0.09	0.28	0.12	0.09	3.11	0.10	0.08	3.82
C3 carnitine	ME227915	0.38	0.23	4.45	0.23	0.19	1.68	0.20	0.20	2.09	0.19	0.20	1.83
creatinine	ME227896	0.57	0.65	2.90	0.46	0.57	1.64	0.49	0.62	1.45	0.56	0.60	1.40
C4 carnitine	ME227918	0.81	0.44	3.65	0.55	0.35	1.28	0.51	0.42	1.72	0.50	0.42	1.28
C6 carnitine	ME227923	0.77	0.29	3.32	0.57	0.22	1.50	0.52	0.24	1.90	0.49	0.31	1.81
N-carbamoyl-beta-alanine	ME227886	0.29	0.36	1.58	0.33	0.41	2.59	0.32	0.44	2.90	0.29	0.47	1.92
tyrosine	ME227868	0.58	0.49	1.68	0.63	0.57	1.65	0.64	0.57	2.02	0.63	0.53	1.94
DOPA	ME227850	0.48	0.64	1.87	0.54	0.69	1.92	0.52	0.62	1.81	0.44	0.66	1.73
anthranilic acid	ME227881	0.58	0.51	2.05	0.57	0.52	1.93	0.57	0.44	1.96	0.58	0.47	1.75
homocysteine	ME227876	0.58	0.64	2.06	0.44	0.59	1.73	0.54	0.58	1.79	0.49	0.55	1.90
ADMA	ME227878	0.49	0.57	1.99	0.50	0.56	1.75	0.49	0.55	1.96	0.50	0.56	2.00
methionine	ME227859	0.53	0.59	2.02	0.52	0.58	1.85	0.48	0.54	1.85	0.51	0.53	1.92
leucine	ME227865	0.39	0.30	2.20	0.42	0.36	2.24	0.37	0.32	2.07	0.38	0.36	2.48
C14:1 carnitine	ME227932	0.60	0.29	2.46	0.45	0.24	2.15	0.39	0.24	2.26	0.46	0.29	2.07
cotinine	ME227905	0.54	0.42	2.11	0.64	0.38	2.02	0.52	0.41	2.06	0.59	0.27	1.98
thymine	ME227957	0.45	0.51	2.24	0.36	0.49	2.10	0.41	0.44	2.09	0.43	0.49	1.89
kynurenine	ME227956	0.06	0.06	3.46	0.06	0.05	3.30	0.04	0.04	2.07	0.05	0.03	2.30
methionine sulfoxide	ME227910	0.40	0.27	2.99	0.44	0.26	1.84	0.45	0.26	2.14	0.39	0.24	2.23
C10:2 carnitine	ME227928	0.09	0.04	2.67	0.59	0.35	1.92	0.54	0.36	2.29	0.53	0.41	2.14
C12:1 carnitine	ME227930	0.31	0.13	2.87	0.58	0.22	2.16	0.41	0.17	2.43	0.42	0.24	1.98
kynurenic acid	ME227882	0.00	0.00	3.26	0.01	0.70	2.35	0.01	0.00	2.85	0.01	0.00	2.65
isoleucine	ME227866	0.28	0.26	2.22	0.29	0.28	2.42	0.30	0.27	2.48	0.28	0.28	2.52
2-deoxycytidine	ME227904	0.15	0.32	2.40	0.16	0.35	2.44	0.19	0.33	2.61	0.20	0.31	2.39
phenylalanine	ME227867	0.23	0.24	2.54	0.23	0.24	2.37	0.24	0.25	2.59	0.22	0.23	2.47
thyroxine	ME227898	0.09	0.07	3.08	0.06	0.05	2.76	0.08	0.05	3.14	0.07	0.04	2.35
tryptophan	ME227869	0.16	0.11	3.12	0.18	0.14	2.75	0.17	0.13	2.55	0.16	0.13	2.26
C10 carnitine	ME227927	0.30	0.18	2.82	0.22	0.13	2.49	0.21	0.13	2.70	0.21	0.16	2.34
C14:2 carnitine	ME227933	0.20	0.11	2.88	0.20	0.12	2.47	0.18	0.11	2.73	0.19	0.14	2.53

Factors:

F1	Diet:Chow \| Treatment:none \| Tissue:hypothalamus
F2	Diet:Chow \| Treatment:none \| Tissue:nucleus accumbens
F3	Diet:Chow \| Treatment:none \| Tissue:plasma
F4	Diet:HFD \| Treatment:metronidazole \| Tissue:hypothalamus
F5	Diet:HFD \| Treatment:metronidazole \| Tissue:nucleus accumbens
F6	Diet:HFD \| Treatment:metronidazole \| Tissue:plasma
F7	Diet:HFD \| Treatment:none \| Tissue:hypothalamus
F8	Diet:HFD \| Treatment:none \| Tissue:nucleus accumbens
F9	Diet:HFD \| Treatment:none \| Tissue:plasma
F10	Diet:HFD \| Treatment:vancomycin \| Tissue:hypothalamus
F11	Diet:HFD \| Treatment:vancomycin \| Tissue:nucleus accumbens
F12	Diet:HFD \| Treatment:vancomycin \| Tissue:plasma

Data matrix