Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001049)

(Analysis AN001864)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4
Trp-13C1	ME271160	0.45	1.58	1.25	0.73
Trp-13C10	ME271161	0.91	0.40	0.97	1.38
Thr-13C4	ME271157	1.06	2.54	0.69	0.51
Trp-13C11	ME271162	0.89	2.22	0.45	1.00
Trp-13C3	ME271164	0.85	0.87	1.17	0.97
Trp-13C4	ME271165	1.65	0.87	1.12	0.62
Trp-13C2	ME271163	1.31	1.21	0.67	1.07
Trp-13C5	ME271166	0.76	0.77	1.19	1.04
Thr-ALL	ME271158	1.27	1.38	0.89	0.79
lactate-13C0	ME271250	2.01	2.44	0.34	0.43
Tyr-13C5	ME271177	0.25	0.07	1.12	1.72
ascorbate-13C0	ME271214	1.14	0.30	0.64	1.64
Kynurenic_acid-13C9	ME271056	0.94	1.63	0.47	1.49
Val-ALL	ME271189	1.15	1.39	0.74	0.99
Kynurenic_acid-13C6	ME271053	1.44	1.49	0.29	1.25
Kynurenic_acid-13C5	ME271052	NA	0.89	0.91	1.15
GAB-13C0	ME270992	1.02	1.04	0.95	1.02
a-glycerol-3P_#2-13C2	ME271197	0.51	2.04	0.32	1.40
Succinate-13C0	ME271147	0.77	1.14	0.67	1.37
Kynurenic_acid-13C7	ME271054	0.24	0.80	0.66	1.82
fumarate-ALL	ME271249	NA	0.64	0.82	1.27
Orn-13C2	ME271117	1.55	1.14	0.69	0.97
Kynurenine-13C6	ME271065	0.89	1.06	0.35	1.67
Kynurenine-13C5	ME271064	NA	0.44	1.57	0.71
Malate-13C4	ME271090	0.08	0.18	0.80	2.07
Kynurenine-13C7	ME271066	0.49	NA	1.13	1.26
fumarate-13C1	ME271245	0.93	1.48	0.64	1.16
Pro-13C2	ME271136	0.72	0.85	0.79	1.42
Orn-13C0	ME271115	0.32	0.17	0.63	2.13
Itaconate-ALL	ME271045	1.59	0.41	NA	NA
Pro-13C1	ME271135	1.11	1.62	0.66	0.98
fumarate-13C3	ME271247	0.05	0.10	0.84	2.08
Met-13C4	ME271096	0.51	1.36	0.43	1.35
OHPro-13C2	ME271110	0.82	1.16	0.75	1.26
bOHbutyrate-13C0	ME271222	0.54	1.44	0.88	1.13
Thr-13C2	ME271155	1.44	0.81	0.84	1.04
bOHbutyrate-13C1	ME271223	1.03	1.18	0.71	1.18
Leu-13C6	ME271076	1.31	0.89	1.28	0.62
Leu-ALL	ME271077	1.15	1.30	0.76	1.02
Thr-13C3	ME271156	0.77	0.79	0.97	1.25
Itaconate-13C4	ME271044	1.52	0.35	1.69	0.38
Orn-13C1	ME271116	0.46	0.54	1.29	1.21
Arg-13C6	ME270973	1.59	0.95	0.93	0.80
OHPro-13C5	ME271113	1.07	0.03	0.68	1.77
Pro-13C3	ME271137	0.66	0.89	0.58	1.65
fumarate-13C2	ME271246	0.41	0.71	0.83	1.61
Val-13C1	ME271184	1.16	1.13	0.84	1.02
Isocitrate-13C6	ME271038	0.02	0.12	0.68	2.25
pyroGlu-ALL	ME271261	1.52	0.05	1.96	0.47
Val-13C2	ME271185	1.03	1.15	0.77	1.14
N-Ace-Asp-13C0	ME271099	0.96	0.49	1.28	NA
His-13C5	ME271021	1.88	0.65	0.53	1.20
pyroGlu-13C3	ME271258	0.84	0.99	1.10	0.98
Met-13C0	ME271092	0.32	1.82	0.52	1.41
pyroGlu-13C4	ME271259	0.57	0.65	1.27	1.12
Pro-ALL	ME271140	1.14	1.70	0.58	1.00
pyroGlu-13C5	ME271260	0.21	0.16	0.89	1.93
Tyr-13C6	ME271178	0.57	0.87	1.02	1.26
ascorbate-13C5	ME271219	1.14	0.72	1.17	0.90
Val-13C0	ME271183	1.22	1.24	0.79	0.98
Tyr-13C8	ME271180	2.47	1.13	0.35	0.85
Tyr-13C9	ME271181	1.04	0.61	1.05	1.12
GAB-13C4	ME270996	1.20	1.00	1.11	0.79
Norleu-ALL	ME271107	0.98	1.03	0.96	1.03
Cys-13C1	ME270988	1.36	0.87	0.64	1.24
a-glycerol-3P_#1-13C2	ME271192	0.99	1.75	0.33	1.30
N-Ace-Asp-13C1	ME271100	2.02	NA	0.99	0.01
Asp-13C3	ME270984	0.21	0.33	0.92	1.81
Phe-13C7	ME271130	1.40	NA	0.71	1.09
Phe-13C9	ME271132	0.80	NA	1.07	1.13
PO4-ALL	ME271122	1.02	1.06	0.93	1.03
Leu-13C1	ME271071	1.15	1.31	0.80	0.97
Pro-13C0	ME271134	1.13	1.55	0.62	1.04
Val-13C3	ME271186	1.49	1.01	0.91	0.84
Arg-13C1	ME270968	0.99	1.84	0.71	0.87
a-glycerol-3P_#1-13C1	ME271191	1.13	2.59	0.27	0.87
Kynurenine-13C2	ME271061	1.15	0.65	1.87	0.33
Kynurenine-13C1	ME271059	0.33	2.34	1.23	0.55
citrate-13C5	ME271241	0.04	0.02	0.60	2.37
N-Ace-Asp-13C4	ME271103	1.20	0.51	1.70	0.45
N-Ace-Asp-13C6	ME271105	0.77	0.57	1.45	0.76
aOHglutarate-13C2	ME271209	0.51	0.95	0.81	1.46
lactate-13C3	ME271253	0.11	0.10	1.18	1.72
Isocitrate-13C3	ME271035	0.30	0.50	0.86	1.73
Trp-13C0	ME271159	1.16	0.72	0.81	1.25
Phe-13C6	ME271129	0.64	1.58	0.24	1.65
Leu-13C0	ME271070	1.16	1.28	0.76	1.02
Cys-13C3	ME270990	1.03	2.63	0.52	0.65
lactate-ALL	ME271254	2.00	2.44	0.35	0.43
Isocitrate-13C4	ME271036	0.06	0.19	0.82	2.05
N-Ace-Asp-13C5	ME271104	1.19	0.55	1.72	0.41
fumarate-13C0	ME271244	1.08	1.67	0.60	1.03
Phe-13C5	ME271128	0.30	1.82	0.95	0.99
Gln-13C4	ME271002	0.87	1.10	0.47	1.55
Lys-13C2	ME271080	1.46	1.42	0.69	0.71
Arg-13C3	ME270970	1.25	1.41	1.01	0.66
Succinate-ALL	ME271152	0.07	1.79	0.08	1.99
Gln-13C0	ME270998	0.85	1.25	0.54	1.41
Itaconate-13C0	ME271040	4.09	0.15	0.80	0.09
Trp-13C7	ME271168	0.96	0.61	1.53	0.68
Asp-13C4	ME270985	0.12	0.22	0.91	1.92
Glu-13C2	ME271007	0.83	0.64	1.12	1.14
Asp-13C1	ME270982	0.98	1.99	0.61	0.90
Thr-13C1	ME271154	1.24	1.59	0.64	0.94
ascorbate-13C1	ME271215	1.52	0.76	0.61	1.25
ascorbate-13C6	ME271220	1.57	0.83	0.77	1.03
Ser-13C2	ME271144	3.48	1.02	0.24	0.51
Gln-13C5	ME271003	0.67	0.57	0.68	1.70
His-13C6	ME271022	0.84	0.92	0.95	1.17
Kynurenine-13C3	ME271062	0.83	1.31	1.70	0.58
Succinate-13C4	ME271151	0.34	0.38	1.26	1.38
ascorbate-13C4	ME271218	0.71	0.73	0.77	1.51
Kynurenic_acid-13C4	ME271051	1.35	0.95	1.54	0.31
OHPro-13C1	ME271109	1.03	1.32	0.86	0.97
Cys-13C2	ME270989	1.18	1.41	0.91	0.80
Malate-13C3	ME271089	0.17	0.27	0.84	1.94
Malate-13C2	ME271088	0.62	0.89	0.80	1.45
Met-13C3	ME271095	0.29	NA	1.07	1.57
Itaconate-13C2	ME271042	3.29	0.37	0.92	0.25
Malate-13C1	ME271087	1.03	1.76	0.61	0.99
OHPro-13C4	ME271112	0.33	0.31	1.68	1.34
Cys-13C0	ME270987	2.00	0.13	1.08	0.86
Gln-13C1	ME270999	0.81	1.29	0.54	1.41
Thr-13C0	ME271153	1.27	1.38	0.89	0.79
Orn-13C5	ME271120	1.34	1.56	0.78	0.77
Succinate-13C1	ME271148	0.76	0.78	0.81	1.42
GAB-ALL	ME270997	1.02	1.04	0.95	1.02
ascorbate-13C3	ME271217	2.26	0.91	0.35	1.06
OHPro-13C0	ME271108	1.18	1.67	0.61	0.96
Succinate-13C2	ME271149	0.34	0.60	0.79	1.74
Succinate-13C3	ME271150	0.09	0.93	0.82	1.67
Gln-13C2	ME271000	0.87	1.24	0.50	1.44
Itaconate-13C3	ME271043	1.47	NA	1.65	0.11
Glu-13C3	ME271008	0.65	0.71	0.69	1.62
ascorbate-13C2	ME271216	0.56	0.31	1.17	1.40
aOHglutarate-13C5	ME271212	0.15	0.23	0.83	1.98
Tyr-13C2	ME271174	1.28	1.73	1.00	0.49
Isocitrate-13C2	ME271034	0.41	0.88	0.86	1.50
Val-13C5	ME271188	0.60	0.19	1.04	1.57
Ile-13C6	ME271030	1.05	1.63	1.17	0.49
Ile-13C1	ME271025	0.98	1.25	0.81	1.08
Glu-13C4	ME271009	0.24	0.10	0.96	1.87
Trp-13C8	ME271169	1.07	0.62	0.90	1.26
GAB-13C1	ME270993	1.00	1.00	0.97	1.03
bOHbutyrate-13C3	ME271225	1.47	0.58	0.93	1.05
Asp-13C2	ME270983	0.55	1.09	0.88	1.30
a-glycerol-3P_#1-ALL	ME271194	1.82	0.81	0.63	1.11
Arg-13C5	ME270972	0.49	1.33	0.28	1.81
Ser-13C1	ME271143	0.94	2.34	0.51	0.85
Ala-13C2	ME270964	0.27	0.49	1.27	1.35
a-ketoglutarate-13C4	ME271204	0.15	0.47	0.79	1.90
His-13C0	ME271016	0.09	2.18	0.22	1.65
Gly-13C0	ME271012	1.10	0.01	1.25	1.20
Gly-ALL	ME271015	1.60	0.00	1.37	0.83
Leu-13C3	ME271073	0.73	1.13	1.15	0.92
His-13C4	ME271020	1.75	1.91	0.54	0.27
a-ketoglutarate-13C5	ME271205	0.10	0.25	0.98	1.85
a-ketoglutarate-13C2	ME271202	0.41	0.88	0.80	1.56
a-ketoglutarate-13C1	ME271201	1.43	0.56	0.86	1.14
a-glycerol-3P_#2-13C0	ME271195	0.85	2.57	0.19	1.10
a-ketoglutarate-13C3	ME271203	0.44	0.57	0.79	1.71
His-13C2	ME271018	0.77	0.64	0.38	1.92
Gly-13C1	ME271013	0.90	1.26	1.01	0.91
Pro-13C5	ME271139	0.08	0.20	0.72	2.14
Arg-13C2	ME270969	0.78	1.68	0.62	1.15
Orn-13C3	ME271118	0.36	1.50	1.25	0.82
a-ketoglutarate-13C0	ME271200	0.98	2.20	0.21	1.20
OHPro-13C3	ME271111	1.17	1.75	0.65	0.88
fumarate-13C4	ME271248	0.05	0.05	0.75	2.20
Leu-13C2	ME271072	1.20	1.36	0.80	0.92
Kynurenic_acid-13C1	ME271047	0.21	0.27	1.98	0.78
Kynurenic_acid-13C10	ME271048	1.35	2.09	0.61	0.67
a-glycerol-3P_#2-13C1	ME271196	0.29	1.72	0.39	1.60
Kynurenic_acid-13C2	ME271049	0.49	0.38	1.62	0.95
Lys-13C1	ME271079	3.01	NA	0.34	0.65
Pro-13C4	ME271138	0.66	0.48	0.71	1.72
Kynurenic_acid-13C8	ME271055	0.77	0.97	1.17	0.96
Lys-13C0	ME271078	1.26	0.10	1.01	1.31
Ala-13C0	ME270962	1.16	2.09	0.55	0.82
Kynurenic_acid-ALL	ME271057	NA	NA	1.57	0.43
Kynurenic_acid-13C0	ME271046	0.15	0.09	2.26	0.62
Ser-13C0	ME271142	0.86	2.34	0.50	0.90
Isocitrate-13C5	ME271037	0.06	0.05	0.82	2.12
His-13C1	ME271017	0.04	2.26	0.82	1.03
Ile-13C0	ME271024	1.11	1.27	0.73	1.08
His-13C3	ME271019	NA	0.98	1.01	NA
Gly-13C2	ME271014	0.73	1.27	1.08	0.92
Isocitrate-ALL	ME271039	NA	2.29	NA	0.35
Phe-13C8	ME271131	0.38	NA	NA	1.31
Ala-13C1	ME270963	1.34	2.05	0.39	0.91
pyroGlu-13C2	ME271257	0.72	0.35	0.86	1.60
Met-13C2	ME271094	0.86	0.39	1.47	0.90
Kynurenine-13C0	ME271058	0.38	0.25	1.26	1.42
citrate-13C6	ME271242	0.01	0.04	0.61	2.37
Isocitrate-13C1	ME271033	1.40	2.85	0.35	0.52
citrate-13C3	ME271239	0.27	0.65	0.76	1.78
citrate-13C1	ME271237	1.35	3.07	0.24	0.55
Ile-13C5	ME271029	1.11	0.44	0.77	1.46
Asn-13C4	ME270979	1.75	1.54	0.70	0.66
Itaconate-13C1	ME271041	2.84	0.13	0.82	0.69
Tyr-13C1	ME271173	0.44	1.00	1.37	0.91
pyroGlu-13C0	ME271255	1.14	2.06	0.52	0.88
Orn-13C4	ME271119	0.72	1.31	0.69	1.30
Leu-13C4	ME271074	1.87	0.35	1.20	0.69
Tyr-13C4	ME271176	0.56	0.82	0.82	1.50
Asn-13C0	ME270975	0.97	1.36	1.14	0.70
Trp-13C6	ME271167	0.73	0.80	1.73	0.51
Kynurenine-13C8	ME271067	NA	0.97	0.55	1.47
Kynurenine-13C9	ME271068	0.74	0.98	1.25	1.02
Met-13C1	ME271093	0.94	1.53	0.50	1.26
N-Ace-Asp-13C3	ME271102	1.52	NA	1.22	0.04
lactate-13C1	ME271251	1.88	2.24	0.41	0.53
lactate-13C2	ME271252	1.35	1.45	0.61	0.99
Tyr-13C7	ME271179	1.95	0.34	0.76	1.10
a-glycerol-3P_#1-13C0	ME271190	1.14	2.41	0.35	0.88
bOHbutyrate-13C4	ME271226	1.52	0.76	0.97	0.89
Trp-13C9	ME271170	1.46	1.21	0.70	0.97
Tyr-13C3	ME271175	0.74	1.91	0.97	0.70
bOHbutyrate-ALL	ME271227	0.64	1.41	0.85	1.12
Tyr-13C0	ME271172	0.60	1.37	0.37	1.65
c-aconitate-13C0	ME271228	1.28	3.02	0.32	0.53
Ala-13C3	ME270965	0.21	0.24	0.99	1.79
Ala-ALL	ME270966	1.22	1.89	0.61	0.84
Lys-13C3	ME271081	0.77	0.53	0.85	1.50
Phe-13C1	ME271124	0.45	1.29	1.22	0.91
c-aconitate-13C2	ME271230	0.53	0.78	0.63	1.71
Gln-ALL	ME271004	0.90	2.79	0.44	0.44
Glu-13C0	ME271005	0.96	0.99	1.12	0.90
Asp-13C0	ME270981	1.08	2.18	0.59	0.78
Phe-13C2	ME271125	0.27	2.08	0.75	1.07
c-aconitate-13C3	ME271231	0.34	0.52	0.64	1.93
c-aconitate-13C4	ME271232	0.24	0.25	0.70	2.05
Glu-13C5	ME271010	0.59	0.60	0.87	1.53
Phe-13C4	ME271127	1.66	1.12	0.70	0.91
citrate-13C4	ME271240	0.07	0.20	0.76	2.11
aOHglutarate-13C0	ME271207	1.01	1.99	0.54	0.96
GAB-13C3	ME270995	1.16	1.14	0.91	0.94
c-aconitate-13C5	ME271233	0.08	0.15	0.56	2.32
Phe-13C3	ME271126	0.47	0.59	1.43	1.04
aOHglutarate-13C3	ME271210	0.24	0.68	0.78	1.76
Asn-13C1	ME270976	0.60	1.21	1.86	0.23
Glu-13C1	ME271006	0.86	0.88	1.22	0.91
Phe-13C0	ME271123	1.01	1.56	0.62	1.09
pyroGlu-13C1	ME271256	1.07	1.76	0.60	0.99
citrate-13C2	ME271238	0.44	1.10	0.65	1.58
Met-13C5	ME271097	0.47	2.09	0.59	1.13
aOHglutarate-13C4	ME271211	0.04	0.17	0.78	2.11
Ile-13C3	ME271027	1.09	0.48	1.17	1.04
Kynurenic_acid-13C3	ME271050	0.95	0.62	1.66	0.56
Ile-13C2	ME271026	1.22	1.21	0.71	1.07
Leu-13C5	ME271075	1.39	0.27	1.29	0.88
Lys-13C4	ME271082	1.34	0.44	1.57	0.54
N-Ace-Asp-13C2	ME271101	1.40	0.04	1.28	NA
Ser-ALL	ME271146	1.07	2.01	0.66	0.80
a-glycerol-3P_#2-ALL	ME271199	1.70	0.49	0.58	1.32
Gln-13C3	ME271001	1.13	1.56	0.49	1.17
Kynurenine-13C4	ME271063	0.88	0.28	1.03	1.79
Arg-13C4	ME270971	2.32	1.40	0.31	0.83
Asn-13C3	ME270978	0.29	1.49	0.72	1.39
a-glycerol-3P_#2-13C3	ME271198	0.17	0.42	0.73	1.98
Val-13C4	ME271187	2.06	0.47	1.04	0.69
Lys-13C5	ME271083	0.18	0.30	0.84	2.84
Lys-13C6	ME271084	1.06	0.41	1.10	1.16
Ile-13C4	ME271028	1.13	0.68	1.48	0.61
Malate-13C0	ME271086	1.13	1.95	0.56	0.90
Kynurenine-13C10	ME271060	NA	0.48	1.49	0.53
Ile-ALL	ME271031	1.11	1.27	0.73	1.08
aOHglutarate-13C1	ME271208	0.99	1.69	0.57	1.09
citrate-13C0	ME271236	1.78	2.95	0.20	0.44
a-glycerol-3P_#1-13C3	ME271193	0.34	0.64	0.55	1.96
c-aconitate-13C6	ME271234	0.08	0.19	0.72	2.14
GAB-13C2	ME270994	1.10	1.02	0.94	0.99
c-aconitate-13C1	ME271229	1.33	2.34	0.40	0.77
bOHbutyrate-13C2	ME271224	1.25	0.95	0.99	0.91
Isocitrate-13C0	ME271032	1.47	2.96	0.30	0.49
Arg-13C0	ME270967	0.85	1.81	0.53	1.14
Asn-13C2	ME270977	0.68	1.97	1.06	0.61
Ser-13C3	ME271145	1.11	1.12	1.21	0.68

Factors:

F1	protocol.id:12CGlc_shCTL
F2	protocol.id:12CGlc_shP4HA1
F3	protocol.id:13CGlc_shCTL
F4	protocol.id:13CGlc_shP4HA1

Data matrix