Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001992)

(Analysis AN003249)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15	F16	F17	F18	F19	F20	F21	F22	F23	F24	F25	F26	F27	F28	F29	F30	F31	F32	F33	F34	F35	F36
HDCA	ME460972	13.07	0.07	0.06	0.04	0.21	0.04	0.53	0.14	0.42	0.10	0.22	0.03	0.37	0.30	0.14	0.11	0.09	0.83	0.01	0.42	0.17	0.23	0.28	0.57	0.38	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02
TDCA	ME460974	0.05	1.04	0.37	0.53	0.04	0.03	0.25	0.35	0.25	0.08	0.23	0.05	1.09	0.58	9.79	0.22	3.92	0.15	0.04	0.39	0.42	10.50	0.08	0.47	0.07	0.05	0.09	0.05	0.04	0.05	0.07	0.10	0.05	0.09	0.05	0.02
TLCA	ME460978	0.38	0.53	0.87	0.97	0.33	0.26	0.66	0.52	0.88	0.45	0.93	0.26	0.96	0.45	11.74	0.67	1.92	0.43	0.26	1.16	0.83	2.11	0.45	0.91	0.42	0.36	0.26	0.77	0.26	0.26	0.53	0.37	0.26	0.37	0.26	0.26
TCA	ME460982	0.30	0.42	3.50	1.93	0.19	0.15	0.47	0.66	0.13	0.13	0.08	0.11	0.25	0.13	2.05	0.77	0.62	0.05	0.07	0.06	0.54	1.27	0.03	0.61	0.04	0.71	1.00	0.06	0.09	0.05	0.48	10.87	0.44	1.07	0.04	0.04
TCDCA	ME460986	0.19	0.35	3.25	3.27	0.32	0.08	0.25	0.43	0.14	0.12	0.12	0.09	0.26	0.13	1.77	0.49	0.52	0.12	0.05	0.11	0.13	0.76	0.11	0.54	0.08	0.16	0.28	0.14	0.97	0.11	0.58	12.56	1.01	1.55	0.13	0.08
DHCA	ME460966	1.46	0.41	0.85	0.31	0.47	1.50	1.80	0.34	0.44	1.86	0.84	0.25	0.33	0.23	0.27	1.48	0.49	0.31	0.33	0.19	0.37	2.19	0.13	0.28	0.05	1.54	9.20	0.36	3.25	0.58	0.22	0.14	0.59	1.46	0.08	4.55
TDHCA	ME460975	0.74	0.45	0.79	0.21	0.12	0.58	0.70	0.38	0.48	0.90	0.65	0.30	0.29	0.50	0.19	0.97	0.28	0.12	5.69	0.46	0.41	0.87	1.55	0.21	0.12	3.66	1.40	7.37	4.49	1.08	0.77	1.03	0.56	1.22	0.29	0.00
bMCA	ME460964	0.59	0.46	0.52	0.50	0.38	0.47	0.50	0.32	0.85	0.31	3.64	0.12	0.63	0.12	0.19	0.36	0.56	0.11	0.26	0.17	0.30	9.08	0.04	0.24	0.02	1.65	2.05	0.44	0.43	2.34	1.05	0.51	0.84	1.27	0.27	2.20
wMCA	ME460981	1.05	0.76	1.30	0.83	0.73	1.11	0.82	0.30	0.52	0.38	6.60	0.23	0.46	0.09	0.43	0.74	1.33	0.13	0.00	0.27	0.48	7.97	0.07	0.40	0.05	0.81	0.04	0.19	0.35	2.16	0.40	0.43	0.63	1.63	0.01	0.15
TaMCA	ME460973	0.63	0.93	0.76	1.01	0.93	0.36	0.61	0.58	0.23	0.48	0.44	0.11	1.51	0.29	1.06	0.65	0.28	0.03	0.14	0.20	0.60	0.70	0.07	0.42	0.01	0.83	2.29	0.67	1.89	0.15	1.85	3.36	1.23	8.46	0.60	0.00
THCA	ME460976	0.20	0.47	2.29	2.38	1.63	0.12	0.54	0.26	0.14	0.06	0.07	0.12	0.11	0.07	0.91	1.02	0.26	0.03	0.13	0.04	0.13	0.29	0.03	0.69	0.02	0.65	2.35	0.27	7.53	0.04	2.29	5.34	1.18	6.35	0.85	0.04
GCDCA	ME460990	0.56	0.64	0.57	9.70	1.30	0.18	0.96	1.75	0.38	0.53	0.15	0.15	1.59	0.24	1.30	0.73	4.72	0.44	0.15	0.22	0.72	5.43	0.82	0.68	0.08	0.24	0.12	0.14	0.69	0.15	0.25	0.32	0.27	0.31	0.08	0.07
GDCA	ME460991	0.56	0.63	0.60	9.82	1.28	0.19	0.85	1.70	0.37	0.48	0.17	0.15	1.47	0.24	1.34	0.73	4.42	0.39	0.15	0.21	0.73	5.97	0.70	0.69	0.11	0.24	0.11	0.16	0.68	0.13	0.24	0.35	0.27	0.32	0.09	0.06
GCA	ME460984	0.41	0.52	0.94	3.97	0.36	0.19	0.78	2.74	0.18	0.48	0.15	0.14	2.32	0.17	1.87	0.32	4.03	0.15	0.14	0.16	0.64	4.41	0.50	0.33	0.10	0.27	0.27	0.12	0.13	0.09	0.22	3.39	0.19	0.33	0.09	0.11
GHDCA	ME460969	0.52	1.10	1.42	5.59	0.30	0.26	1.44	2.63	0.32	0.28	0.13	0.18	2.93	0.27	1.99	0.72	2.69	0.66	0.01	0.25	0.87	3.59	0.59	0.58	0.07	0.10	0.15	0.05	0.11	0.02	0.18	0.38	0.11	0.09	0.02	0.00
GUDCA	ME460971	0.52	1.07	1.39	5.21	0.30	0.27	1.41	2.54	0.32	0.28	0.14	0.18	2.81	0.29	2.63	0.88	2.56	0.64	0.01	0.27	1.02	3.46	0.57	0.56	0.08	0.10	0.15	0.05	0.11	0.02	0.22	0.39	0.11	0.08	0.02	0.01
GLCA	ME460970	0.29	0.57	0.23	1.65	0.14	0.23	2.69	0.89	0.40	0.32	1.36	0.67	1.49	1.40	3.10	0.84	3.15	0.89	0.08	2.41	0.89	1.64	3.27	2.72	3.42	0.15	0.24	0.16	0.14	0.65	0.18	0.15	0.17	0.15	0.13	0.17
LCA	ME460962	0.19	0.58	0.13	0.51	0.01	0.03	1.19	1.79	0.90	0.53	1.78	0.34	2.06	2.50	1.85	0.75	1.58	1.39	0.00	3.16	1.33	2.04	2.45	4.07	2.76	0.01	0.06	0.01	0.01	1.45	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00
THDCA	ME460977	1.02	1.52	5.92	2.92	0.17	0.51	1.50	1.87	0.41	0.16	0.10	0.16	0.90	0.12	3.48	1.21	0.62	0.07	0.04	0.08	0.34	1.38	0.04	2.14	0.02	0.06	0.07	0.05	0.11	0.01	0.19	0.70	0.21	0.40	0.03	0.01
TUDCA	ME460979	0.97	1.50	6.24	2.66	0.15	0.50	1.45	1.79	0.41	0.16	0.10	0.16	0.87	0.11	3.86	1.17	0.60	0.07	0.02	0.07	0.32	1.35	0.09	1.71	0.03	0.19	0.14	0.04	0.07	0.01	0.17	0.66	0.19	0.30	0.02	0.01
TwMCA	ME460980	1.80	2.53	2.44	2.51	0.43	1.46	1.25	0.73	0.88	0.42	0.32	1.40	0.75	0.15	1.49	2.90	0.94	0.00	0.00	0.19	1.91	0.97	0.08	0.79	0.00	0.70	0.26	0.19	0.00	0.00	0.52	0.87	0.52	2.44	0.06	0.00
UDCA	ME460988	2.50	0.92	1.79	1.32	0.40	1.02	2.08	1.05	1.51	0.78	0.52	0.44	2.22	0.41	0.54	1.21	1.70	2.12	0.03	0.63	1.46	1.05	0.07	0.62	0.02	0.13	0.02	0.15	0.04	0.03	0.56	0.13	0.28	0.01	0.01	0.00
OXODCA	ME460985	1.15	0.56	0.56	1.15	0.42	1.91	1.62	0.51	0.57	0.38	0.31	1.09	1.01	0.30	0.20	0.23	0.65	1.33	4.29	0.18	1.82	0.30	0.03	0.13	0.02	1.96	2.22	2.16	6.66	0.62	0.68	0.99	0.94	3.52	0.45	1.73
GHCA	ME460968	0.51	0.56	2.05	5.50	0.77	0.47	0.52	0.68	0.40	0.35	0.45	0.30	1.05	0.59	0.67	0.48	1.83	0.38	1.55	0.38	0.52	1.22	0.35	0.46	0.30	0.81	1.39	0.91	5.59	0.40	1.07	2.31	1.21	2.76	0.43	0.46
aMCA	ME460983	1.70	0.71	0.87	2.98	1.05	3.07	1.39	0.69	1.08	0.62	0.80	0.80	1.46	0.39	0.37	0.54	0.62	0.93	1.15	0.30	1.33	0.63	0.22	0.27	0.13	1.19	1.89	0.98	0.77	1.16	0.80	1.07	0.81	1.15	0.69	0.66
GDHCA	ME460967	0.94	1.00	0.79	1.48	1.19	1.05	0.97	0.66	0.94	0.99	0.75	0.54	0.75	0.62	0.54	0.68	0.80	0.85	0.54	0.67	0.61	0.60	0.73	0.54	0.54	1.37	1.13	1.86	2.50	0.94	1.19	2.37	1.27	1.88	0.71	1.00
DCA	ME460965	1.02	1.09	1.18	1.57	0.96	1.49	0.98	0.56	0.95	0.31	0.63	0.64	0.99	0.41	0.75	0.40	1.07	0.58	1.70	0.33	0.67	0.81	0.36	0.62	0.06	1.61	1.49	1.66	1.66	1.17	1.50	1.53	1.32	1.23	1.23	0.81
CA	ME460989	1.29	0.72	0.88	3.08	1.53	2.09	0.98	0.41	0.92	0.48	0.25	0.71	0.92	0.22	0.49	0.25	0.65	0.45	1.29	0.14	0.79	0.34	0.01	0.17	0.01	2.15	2.06	1.30	1.37	0.67	1.39	2.25	1.20	1.55	0.75	0.88
CDCA	ME460992	0.95	1.01	1.06	2.50	1.40	1.36	0.76	0.42	0.68	0.15	0.34	0.38	0.90	0.41	0.65	0.28	1.01	0.27	1.63	0.12	0.39	0.58	0.03	0.10	0.01	2.40	1.46	1.42	1.55	0.72	1.63	2.51	1.59	1.38	1.34	0.37
HCA	ME460987	0.95	0.39	0.65	1.64	1.04	0.50	0.68	0.36	0.51	0.32	0.29	0.45	0.56	0.28	0.28	0.35	0.54	0.57	3.95	0.30	0.87	0.42	0.08	0.18	0.12	2.98	3.09	2.60	2.05	1.51	1.66	2.29	1.17	1.92	0.93	0.93
oxoHDCA	ME460963	1.01	0.40	0.46	0.37	0.15	0.92	0.75	0.49	0.43	0.31	0.30	0.53	0.75	0.37	0.26	0.47	0.71	1.20	2.55	0.45	2.50	0.78	0.12	0.25	0.22	3.66	2.38	2.67	3.61	1.00	1.09	1.00	0.96	1.72	0.74	1.01

Factors:

F1	Agemonths:12 \| Case:CTR \| sex:1
F2	Agemonths:12 \| Case:CTR \| sex:2
F3	Agemonths:12 \| Case:P1Ab \| sex:1
F4	Agemonths:12 \| Case:P1Ab \| sex:2
F5	Agemonths:12 \| Case:P2Ab \| sex:1
F6	Agemonths:12 \| Case:P2Ab \| sex:2
F7	Agemonths:18 \| Case:CTR \| sex:1
F8	Agemonths:18 \| Case:CTR \| sex:2
F9	Agemonths:18 \| Case:P1Ab \| sex:1
F10	Agemonths:18 \| Case:P1Ab \| sex:2
F11	Agemonths:18 \| Case:P2Ab \| sex:1
F12	Agemonths:18 \| Case:P2Ab \| sex:2
F13	Agemonths:24 \| Case:CTR \| sex:1
F14	Agemonths:24 \| Case:CTR \| sex:2
F15	Agemonths:24 \| Case:P1Ab \| sex:1
F16	Agemonths:24 \| Case:P1Ab \| sex:2
F17	Agemonths:24 \| Case:P2Ab \| sex:1
F18	Agemonths:24 \| Case:P2Ab \| sex:2
F19	Agemonths:2 \| Case:CTR \| sex:2
F20	Agemonths:36 \| Case:CTR \| sex:1
F21	Agemonths:36 \| Case:CTR \| sex:2
F22	Agemonths:36 \| Case:P1Ab \| sex:1
F23	Agemonths:36 \| Case:P1Ab \| sex:2
F24	Agemonths:36 \| Case:P2Ab \| sex:1
F25	Agemonths:36 \| Case:P2Ab \| sex:2
F26	Agemonths:3 \| Case:CTR \| sex:1
F27	Agemonths:3 \| Case:CTR \| sex:2
F28	Agemonths:3 \| Case:P1Ab \| sex:1
F29	Agemonths:3 \| Case:P1Ab \| sex:2
F30	Agemonths:3 \| Case:P2Ab \| sex:1
F31	Agemonths:6 \| Case:CTR \| sex:1
F32	Agemonths:6 \| Case:CTR \| sex:2
F33	Agemonths:6 \| Case:P1Ab \| sex:1
F34	Agemonths:6 \| Case:P1Ab \| sex:2
F35	Agemonths:6 \| Case:P2Ab \| sex:1
F36	Agemonths:6 \| Case:P2Ab \| sex:2

Data matrix