Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST002077)

(Analysis AN003385)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13
thymine	ME478624	0.02	0.05	3.84	0.54	3.16	5.18	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04
(5^ or 2^)-deoxyadenosine	ME478627	0.10	0.06	5.58	0.43	2.49	2.61	0.01	0.04	0.12	0.10	0.15	0.06	0.01
cytosine	ME478633	0.00	0.05	5.08	0.40	2.02	4.11	0.00	0.01	0.31	0.06	0.38	0.59	0.00
indole-3-acetaldehyde	ME478622	0.03	0.40	5.89	0.57	1.64	3.53	0.27	0.05	0.18	0.09	0.16	0.17	0.03
uracil	ME478625	0.03	0.03	5.46	0.16	0.86	3.56	0.03	0.03	0.08	0.04	0.04	NA	0.03
biotin	ME478630	NA	0.54	3.78	1.01	1.10	3.41	0.50	0.00	0.01	0.04	0.30	0.05	NA
5^-methylthioadenosine	ME478626	0.00	0.01	3.74	0.18	1.50	3.81	0.00	0.00	0.66	0.03	1.24	1.08	0.00
cytidine	ME478635	0.37	0.18	4.23	0.24	1.44	2.90	0.15	0.21	0.83	0.23	0.32	1.13	0.17
4-methoxyphenylacetic acid	ME478621	0.14	0.24	6.80	0.26	0.49	0.74	0.26	0.18	2.54	0.15	0.19	0.88	0.13
pyridoxine	ME478628	0.51	0.10	7.47	0.14	0.30	2.86	0.11	0.11	0.02	0.11	0.07	0.01	0.19
trigonelline	ME478638	0.08	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	10.51	0.08	0.71	1.44	0.02
betaine	ME478636	0.16	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.13	0.13	9.04	0.17	0.80	1.75	0.13
choline	ME478631	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	9.74	0.02	0.29	2.69	0.01
adenosine	ME478629	0.01	0.07	3.15	0.20	1.10	2.75	0.01	0.01	3.84	0.03	0.15	1.67	0.01
guanine	ME478634	0.03	0.01	1.12	0.01	0.10	2.35	0.01	0.01	6.36	0.02	0.29	2.69	0.01
nicotinamide	ME478623	0.66	0.39	1.24	0.39	0.54	0.63	0.42	0.38	2.17	0.34	1.96	3.53	0.34
glutathione	ME478640	0.11	NA	0.07	0.10	0.28	0.21	0.14	0.18	2.73	0.12	0.60	1.81	0.12
riboflavin	ME478632	NA	0.13	1.20	0.51	0.36	0.84	NA	0.04	3.05	0.08	1.31	2.50	0.03
NAD+	ME478641	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	4.61	0.07	2.46	3.43	0.01
carnitine	ME478639	0.09	0.03	0.28	0.03	0.11	0.22	0.06	0.04	5.60	0.08	0.37	6.06	0.04
thiamine	ME478637	0.00	0.01	0.23	0.01	0.03	0.15	0.01	0.01	5.59	0.02	0.57	4.38	NA

Factors:

F1	Type:extraction control \| Time Point:extraction control
F2	Type:exudate \| Time Point:0 days
F3	Type:exudate \| Time Point:12 days
F4	Type:exudate \| Time Point:3 days
F5	Type:exudate \| Time Point:6 days
F6	Type:exudate \| Time Point:9 days
F7	Type:exudate \| Time Point:medium control
F8	Type:pellet \| Time Point:0 days
F9	Type:pellet \| Time Point:12 days
F10	Type:pellet \| Time Point:3 days
F11	Type:pellet \| Time Point:6 days
F12	Type:pellet \| Time Point:9 days
F13	Type:pellet \| Time Point:medium control

Data matrix