Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST002817)

(Analysis AN004584)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6
LPC(o-16:0)	ME728489	0.35	0.31	0.36	0.39	4.80	0.78
1_Cholesterol d7 iSTD	ME728435	0.47	0.47	0.48	0.49	4.28	0.48
LPC(p-16:0) or LPC(o-16:1)	ME728490	0.56	0.44	0.57	0.49	4.45	0.47
CE(18:2)	ME728461	0.05	0.04	0.04	0.03	6.77	0.06
CE(20:4)	ME728462	0.12	0.10	0.14	0.11	6.40	0.14
LPC(20:4)	ME728483	0.24	0.19	0.27	0.33	5.72	0.25
LPC(p-18:0) or LPC(o-18:1)	ME728491	0.22	0.14	0.21	0.28	5.41	0.72
SM(d33:1)	ME728555	0.97	1.03	0.82	0.94	1.94	1.29
SM(d41:2) A	ME728563	1.00	1.01	0.96	0.96	1.82	1.24
Cholesterol	ME728466	1.08	1.03	1.06	1.07	1.73	1.04
PC(34:3) B	ME728499	1.01	1.09	0.98	1.02	1.61	1.28
SM(d36:2)	ME728558	0.82	0.80	0.93	0.91	2.39	1.15
1_Cer(d18:1_17:0) iSTD	ME728434	0.87	0.86	0.83	0.86	2.14	0.87
1_MG(17:0_0:0_0:0) iSTD	ME728440	0.81	0.79	0.82	0.73	2.17	0.83
1_SM(d18:1_17:0) iSTD	ME728443	0.96	0.96	0.91	0.97	2.02	1.00
1_LPE(17:1) iSTD	ME728439	0.89	0.84	0.83	0.90	1.87	0.85
1_Sphingosine(d17:1) iSTD	ME728444	0.85	0.85	0.84	0.85	2.00	0.86
1_DG(18:1_2:0_0:0) iSTD	ME728437	0.86	0.85	0.85	0.92	1.96	0.88
1_PE(17:0_17:0) iSTD	ME728442	0.89	0.87	0.90	0.91	1.95	0.87
Gal-Gal-Cer(d18:1_16:0) or Lactosylceramide(d18:1_16:0)	ME728481	0.84	0.69	1.15	0.75	2.72	0.81
1_CE(22:1) iSTD	ME728433	0.76	0.76	0.79	0.78	2.41	0.72
1_DG(12:0_12:0_0:0) iSTD	ME728436	0.78	0.77	0.76	0.78	2.47	0.78
1_TG d5(17:0_17:1_17:0) iSTD	ME728445	0.61	0.74	0.72	0.63	2.85	0.66
1_PC(12:0_13:0) iSTD	ME728441	0.71	0.74	0.71	0.80	2.60	0.75
1_CUDA iSTD	ME728446	0.71	0.70	0.72	0.72	2.73	0.74
1_LPC(17:0) iSTD	ME728438	0.73	0.69	0.71	0.76	2.71	0.75
PC(p-40:3) or PC(o-40:4)	ME728535	0.66	0.66	0.58	0.69	3.45	0.94
CE(22:6)	ME728463	0.77	0.63	0.73	0.70	2.96	1.19
PC(p-38:2) or PC(o-38:3)	ME728532	0.59	0.58	0.65	0.64	3.11	1.37
TAG(50:0)	ME728590	1.94	2.37	0.52	0.62	0.68	0.85
TAG(52:0)	ME728601	2.14	2.52	0.43	0.30	0.75	0.79
TAG(46:0)	ME728574	1.48	1.89	0.58	1.06	0.99	0.98
TAG(48:0)	ME728580	1.36	2.14	0.76	0.95	0.79	0.98
TAG(49:0)	ME728586	1.45	1.68	0.49	0.83	1.51	0.97
TAG(54:0)	ME728616	1.77	1.80	0.65	0.33	1.39	0.91
TAG(56:0)	ME728635	1.71	1.66	0.74	0.30	1.36	1.11
TAG(58:0)	ME728653	1.62	1.65	0.77	0.38	1.22	1.21
Acylcarnitine(18:0)	ME728454	1.42	2.43	0.64	1.32	0.01	1.17
Acylcarnitine(16:0)	ME728452	1.35	2.72	0.50	1.24	0.02	1.17
Acylcarnitine(18:3)	ME728457	1.32	2.71	0.53	1.24	0.09	1.09
Acylcarnitine(14:1)	ME728450	1.67	2.26	0.80	1.27	0.08	0.90
Acylcarnitine(16:2)	ME728453	1.71	2.36	0.77	1.24	0.01	0.91
Acylcarnitine(20:1)	ME728459	1.69	2.56	0.62	1.25	0.01	0.86
Acylcarnitine(18:1)	ME728455	1.80	2.64	0.52	1.24	0.02	0.79
Acylcarnitine(18:2)	ME728456	1.85	2.56	0.57	1.23	0.06	0.72
TAG(40:0)	ME728565	1.54	1.11	1.06	1.19	0.91	0.75
TAG(42:1)	ME728568	1.94	1.18	0.72	1.28	1.00	0.77
TAG(42:0)	ME728567	1.74	1.15	0.85	1.36	0.74	0.95
TAG(44:1)	ME728572	1.94	1.27	0.75	1.45	0.55	1.01
TAG(44:2)	ME728573	2.02	1.29	0.65	1.52	0.28	1.23
TAG(46:3) A	ME728577	1.92	1.32	0.72	1.48	0.31	1.24
TAG(46:2)	ME728576	1.82	1.23	0.73	1.34	0.54	1.34
TAG(48:3)	ME728583	1.74	1.24	0.71	1.28	0.68	1.34
TAG(48:4) A	ME728584	1.93	1.25	0.77	1.34	0.46	1.23
TAG(46:1)	ME728575	1.84	1.41	0.67	1.31	0.57	1.19
TAG(46:4) A	ME728578	1.80	1.45	0.69	1.34	0.46	1.20
TAG(51:2)	ME728598	1.54	1.18	0.60	1.11	0.91	1.66
TAG(51:3)	ME728599	1.48	1.20	0.64	1.13	0.88	1.66
TAG(49:1)	ME728587	1.56	1.30	0.61	1.16	0.85	1.50
TAG(51:4)	ME728600	1.44	1.27	0.68	1.12	0.94	1.54
TAG(44:0)	ME728571	1.61	1.46	0.69	1.26	0.79	1.12
TAG(42:2)	ME728569	1.61	1.41	0.57	1.20	0.92	1.27
TAG(48:1)	ME728581	1.68	1.33	0.59	1.27	0.79	1.33
TAG(62:1)	ME728687	1.71	1.51	1.19	0.92	0.34	1.30
Acylcarnitine(12:1)	ME728449	1.64	1.58	1.12	1.20	0.45	0.98
PC(p-42:5) or PC(o-42:6) B	ME728540	1.59	1.38	1.21	1.24	0.50	1.01
TAG(40:1)	ME728566	1.71	1.73	0.52	1.33	0.37	1.29
Acylcarnitine(10:0)	ME728447	1.86	1.57	0.94	1.27	0.25	1.10
Acylcarnitine(14:2)	ME728451	1.83	1.78	0.89	1.18	0.31	0.97
TAG(46:4) B	ME728579	1.99	1.76	0.80	1.15	0.26	0.97
Acylcarnitine(22:1)	ME728460	1.75	2.07	0.86	1.31	0.03	0.96
TAG(58:10) or TAG(18:2_18:2_22:6)	ME728657	1.66	2.07	0.98	1.35	0.01	0.93
Acylcarnitine(20:0)	ME728458	1.52	2.10	0.80	1.40	0.02	1.16
Acylcarnitine(12:0)	ME728448	1.46	2.06	0.95	1.27	0.12	1.13
TAG(58:9)	ME728669	1.57	2.03	1.00	1.32	0.02	1.06
TAG(58:9) or TAG(18:2_18:2_22:5)	ME728670	1.54	1.98	1.08	1.32	0.01	1.07
TAG(58:10) A	ME728655	1.56	1.92	0.98	1.40	0.03	1.09
TAG(58:11)	ME728658	1.54	2.02	0.93	1.40	0.01	1.09
PC(42:11)	ME728524	1.71	1.86	1.35	1.29	0.00	0.79
TAG(62:14)	ME728693	1.62	1.90	1.15	1.38	0.00	0.95
PC(42:5)	ME728525	1.39	1.35	1.60	1.24	0.10	1.31
SM(d37:2) or SM(d18:0_19:2)	ME728560	1.36	1.23	1.55	1.31	0.13	1.42
PE(40:8)	ME728549	1.59	1.70	1.44	1.32	0.00	0.95
PC(42:9)	ME728526	1.62	1.59	1.59	1.27	0.01	0.92
PC(40:9)	ME728521	1.53	1.56	1.64	1.32	0.00	0.95
PC(p-38:6) or PC(o-38:7)	ME728534	1.57	1.52	1.55	1.37	0.01	0.98
PC(p-40:6) or PC(o-40:7) B	ME728538	1.42	1.46	1.78	1.32	0.07	0.95
PC(p-40:7) or PC(o-40:8)	ME728539	1.48	1.43	1.76	1.32	0.01	1.00
PC(40:7) B	ME728520	1.50	1.45	1.52	1.35	0.06	1.12
PE(40:8e) or PE(18:2e_22:6)	ME728550	1.47	1.46	1.58	1.30	0.00	1.19
PE(40:5)	ME728548	1.50	1.47	1.51	1.33	0.00	1.18
PE(41:6)	ME728551	1.54	1.49	1.49	1.28	0.01	1.17
LPC(40:9)	ME728488	1.46	1.50	1.62	1.32	0.01	1.09
PC(p-40:5) or PC(o-40:6)	ME728536	1.51	1.47	1.66	1.31	0.05	1.01
PC(p-38:5) or PC(o-38:6) B	ME728533	1.50	1.40	1.61	1.34	0.06	1.09
PC(p-40:6) or PC(o-40:7) A	ME728537	1.50	1.42	1.66	1.32	0.05	1.06
DAG(36:4) A	ME728475	1.64	1.79	1.00	1.30	0.10	1.17
TAG(50:6)	ME728596	1.57	1.75	0.83	1.40	0.23	1.20
TAG(56:7) A	ME728646	1.42	1.80	0.94	1.28	0.24	1.32
TAG(56:8) A	ME728648	1.40	1.84	0.97	1.26	0.23	1.29
TAG(58:8)	ME728667	1.50	1.92	0.98	1.32	0.04	1.23
TAG(56:8) B	ME728649	1.49	1.92	0.87	1.33	0.05	1.33
TAG(56:9)	ME728650	1.46	1.83	0.96	1.32	0.08	1.34
TAG(56:7) B	ME728647	1.41	1.80	0.87	1.34	0.08	1.49
TAG(54:6) A	ME728625	1.54	1.72	0.87	1.33	0.14	1.40
TAG(55:5) or TAG(18:2_18:2_19:1)	ME728634	1.61	1.69	0.85	1.29	0.13	1.42
TAG(58:7) or TAG(18:0_18:1_22:6)	ME728665	1.42	1.78	1.03	1.34	0.02	1.42
TAG(58:6)	ME728664	1.39	1.68	1.15	1.32	0.08	1.38
TAG(60:12) or TAG(16:0_22:6_22:6)	ME728676	1.47	1.66	1.12	1.36	0.00	1.39
TAG(56:4)	ME728639	1.41	1.70	0.94	1.48	0.07	1.40
TAG(56:5) A	ME728640	1.53	1.78	0.88	1.40	0.05	1.37
TAG(58:4)	ME728661	1.51	1.67	1.04	1.43	0.02	1.33
TAG(58:5) or TAG(18:2_18:2_22:1)	ME728663	1.50	1.76	0.97	1.42	0.03	1.31
DAG(40:8) or DAG(18:2_22:6)	ME728468	1.72	1.59	1.16	1.39	0.02	1.12
TAG(62:13) or TAG(18:1_22:6_22:6)	ME728692	1.50	1.74	1.30	1.35	0.00	1.11
TAG(58:7) or TAG(18:1_18:2_22:4)	ME728666	1.49	1.86	1.11	1.28	0.05	1.21
TAG(58:8) or TAG(18:1_18:2_22:5)	ME728668	1.49	1.93	1.11	1.30	0.02	1.15
TAG(60:9)	ME728686	1.49	1.86	1.17	1.33	0.01	1.15
TAG(58:5)	ME728662	1.44	1.74	1.25	1.30	0.02	1.25
TAG(60:8) B	ME728685	1.44	1.80	1.18	1.32	0.01	1.24
TAG(60:8) or TAG(18:2_20:1_22:5)	ME728683	1.45	1.76	1.16	1.40	0.02	1.22
PC(42:10)	ME728523	1.39	1.50	1.47	1.30	0.07	1.28
TAG(62:10)	ME728688	1.28	1.71	1.24	1.36	0.02	1.38
TAG(62:11) or TAG(14:1_22:6_26:4)	ME728690	1.35	1.64	1.36	1.34	0.01	1.30
TAG(62:12)	ME728691	1.38	1.61	1.39	1.33	0.00	1.29
TAG(60:10) or TAG(18:2_20:2_22:6)	ME728674	1.41	1.65	1.28	1.36	0.02	1.27
TAG(60:7)	ME728682	1.40	1.72	1.32	1.30	0.01	1.25
TAG(60:6)	ME728681	1.40	1.67	1.33	1.30	0.02	1.28
TAG(60:8) A	ME728684	1.40	1.67	1.37	1.31	0.01	1.25
TAG(62:3)	ME728695	1.58	1.51	1.23	1.18	0.10	1.39
TAG(60:4)	ME728679	1.67	1.54	1.06	1.23	0.03	1.47
TAG(60:5)	ME728680	1.61	1.55	1.10	1.25	0.03	1.46
PC(38:6) A	ME728516	1.50	1.67	1.18	1.30	0.15	1.19
TAG(64:2)	ME728697	1.53	1.57	1.26	1.24	0.13	1.26
PC(32:2) B	ME728495	1.61	1.37	1.31	1.36	0.01	1.35
DAG(38:6) B	ME728467	1.50	1.51	1.15	1.36	0.04	1.39
PE(38:6) B	ME728545	1.47	1.49	1.26	1.34	0.00	1.43
DAG(40:7)	ME728480	1.59	1.56	1.18	1.38	0.01	1.28
DAG(40:6)	ME728479	1.52	1.52	1.33	1.32	0.02	1.28
PC(38:9)	ME728519	1.46	1.52	1.31	1.38	0.02	1.29
TAG(62:4)	ME728696	1.55	1.52	1.21	1.32	0.05	1.33
TAG(64:3)	ME728698	1.57	1.48	1.26	1.33	0.05	1.29
TAG(64:4)	ME728699	1.57	1.42	1.29	1.31	0.06	1.32
PE(38:5)	ME728544	1.55	1.37	1.27	1.27	0.00	1.54
PS(40:6) or PS(18:0_22:6)	ME728554	1.43	1.29	1.41	1.41	0.00	1.47
PC(41:7)	ME728522	1.42	1.36	1.36	1.25	0.07	1.53
PE(38:6e) or PE(18:1e_20:5)	ME728546	1.35	1.33	1.35	1.32	0.09	1.55
PC(38:4) C	ME728515	1.32	1.32	1.26	1.34	0.32	1.43
TAG(60:3)	ME728678	1.52	1.43	1.13	1.27	0.16	1.48
DAG(38:5)	ME728477	1.44	1.46	1.19	1.30	0.20	1.40
TAG(62:2)	ME728694	1.55	1.42	1.21	1.25	0.21	1.36
PC(37:5) B	ME728513	1.40	1.43	1.30	1.31	0.13	1.41
PE(34:3e) or PE(16:1e_18:2)	ME728541	1.39	1.41	1.20	1.31	0.16	1.52
TAG(38:2)	ME728564	1.68	1.65	0.42	1.28	0.03	1.92
TAG(54:1)	ME728617	1.88	1.40	0.62	1.09	0.25	1.77
TAG(56:2)	ME728637	1.83	1.43	0.75	1.10	0.10	1.78
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Factors:

F1	Treatment:Control MHC
F2	Treatment:Control TNT
F3	Treatment:MHC
F4	Treatment:Pool QC
F5	Treatment:QC
F6	Treatment:TNT

Data matrix