Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST003430)

(Analysis AN005633)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12
HEPES 107	ME897849	1.01	1.06	0.92	0.99	1.05	0.67	0.73	0.63	0.60	0.32	3.51	7.01
HEPES 80	ME897848	1.01	1.04	0.96	0.98	1.03	0.67	0.71	0.65	0.60	0.32	3.48	7.09
Butyryl-CoA 408	ME897880	1.84	0.55	0.29	3.25	6.68	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00
Butyryl-CoA 79	ME897879	1.91	0.52	0.31	3.06	6.62	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00
Palmitoleyl-CoA (16:1) 79	ME897893	1.90	1.39	1.42	4.00	3.72	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01
Lauroyl-CoA 408	ME897889	1.73	0.78	0.54	4.20	4.58	0.12	0.11	0.10	0.13	0.09	0.16	0.09
Myristoyl-CoA 408	ME897892	1.81	0.95	0.68	4.42	4.55	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03
Palmitoyl-CoA (16:0) 79	ME897894	1.82	1.04	0.80	4.43	4.53	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01
Phenol Red 195	ME897858	0.15	0.21	0.18	0.24	0.30	1.56	1.59	1.65	1.58	1.47	2.79	2.79
Folic 311	ME897862	0.21	0.27	0.26	0.31	0.37	1.53	1.60	1.55	1.56	1.42	1.71	3.68
Glucose 59	ME897842	0.23	0.30	0.29	0.32	0.35	1.56	1.59	1.61	1.53	1.63	1.25	2.68
Glucose 71	ME897843	0.22	0.27	0.26	0.29	0.32	1.55	1.59	1.60	1.52	1.64	1.36	2.95
Phenol Red 93	ME897857	0.14	0.20	0.18	0.24	0.29	1.61	1.63	1.63	1.63	1.51	1.42	2.94
Cystine 120	ME897850	0.06	0.12	0.08	0.09	0.15	1.88	1.90	1.88	1.91	2.05	0.19	0.47
Cystine 74	ME897851	0.06	0.12	0.08	0.09	0.15	1.87	1.90	1.86	1.89	2.08	0.20	0.45
Penicillin G 289	ME897856	0.35	0.47	0.44	0.50	0.61	1.54	1.55	1.62	1.59	1.94	0.00	0.00
Uric 124	ME897835	0.34	0.34	0.34	0.30	0.46	1.72	2.04	1.72	1.66	1.64	0.00	0.00
Uric 96	ME897836	0.32	0.32	0.31	0.30	0.38	1.63	1.90	1.58	1.59	1.38	NA	NA
aCD 101	ME897891	NA	1.06	1.11	1.12	1.04	0.97	NA	0.85	NA	0.84	NA	NA
Pemetrexed 321	ME897861	1.32	NA	0.61	1.24	NA	0.99	0.55	0.64	0.92	1.11	0.50	NA
Citrulline 131	ME897839	1.19	1.17	1.22	1.08	1.18	1.10	1.15	1.04	1.07	0.74	0.05	0.10
Lactic 71	ME897816	1.25	0.88	1.18	1.02	1.41	1.01	0.85	0.96	1.04	0.61	0.01	NA
Lactic 87	ME897815	1.33	0.93	1.24	1.09	1.50	1.07	0.92	1.03	1.12	0.65	0.01	0.00
Ascorbic acid 79	ME897841	0.15	NA	0.44	0.68	0.90	1.36	1.57	0.87	0.66	0.90	0.59	0.46
aCD 161	ME897890	1.04	0.73	0.83	0.97	1.21	0.97	0.86	1.66	0.94	0.95	1.08	0.37
Riboflavin 243	ME897859	1.06	1.01	1.10	1.07	1.11	1.06	1.26	1.08	1.12	0.74	0.53	1.07
Pemetrexed 297	ME897860	0.77	0.87	0.58	0.54	0.50	1.15	1.00	1.17	0.75	1.39	0.75	0.80
Arginine 131	ME897837	0.64	0.69	0.73	0.71	0.81	1.33	1.31	1.33	1.34	1.41	0.50	0.99
Arginine 156	ME897838	0.63	0.68	0.72	0.70	0.79	1.34	1.33	1.34	1.36	1.43	0.49	0.99
Malonyl-CoA 426	ME897884	1.90	1.36	2.42	0.11	0.10	0.00	0.00	NA	0.00	0.00	NA	0.00
Malonyl-CoA 408	ME897883	3.20	2.29	4.12	0.17	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Malonic 59	ME897817	3.85	1.01	3.54	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
Succinic 73	ME897819	3.46	1.35	3.52	0.29	0.42	0.06	0.04	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01
Succinic 99	ME897820	3.57	1.23	3.39	0.27	0.37	0.06	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01
Propionic PARENT	ME897811	1.54	1.28	1.58	1.39	1.36	0.64	0.77	0.26	0.55	0.30	2.19	0.03
HMG-CoA 426	ME897888	1.44	1.38	1.40	1.76	1.45	0.00	0.00	0.00	NA	0.00	0.00	NA
NAD+ 273	ME897866	1.20	1.10	1.10	1.07	1.13	0.00	0.00	NA	NA	0.00	NA	NA
Myristic PAR	ME897847	1.79	1.15	1.21	1.72	2.31	0.45	0.37	0.34	0.50	0.67	0.47	0.91
Ascorbic acid 157	ME897840	1.84	1.79	1.67	2.17	2.41	0.27	0.34	0.27	0.17	0.23	0.58	0.73
Butyric PAR	ME897814	1.94	1.58	1.67	1.84	2.25	0.32	0.29	0.27	0.41	0.26	0.55	0.97
Palmitic PAR	ME897854	1.79	1.20	1.50	1.78	1.73	0.54	0.42	0.46	0.64	0.75	0.08	0.09
Asparagine 113	ME897824	1.62	1.63	1.76	1.58	1.69	0.58	0.57	0.58	0.58	0.63	0.05	0.13
Glutamic acid 128	ME897832	1.68	1.75	1.70	1.68	1.64	0.58	0.60	0.55	0.58	0.48	0.06	0.15
Stearic PAR	ME897855	1.66	1.22	1.39	1.50	1.37	0.66	0.65	0.62	0.71	0.82	0.20	0.33
Glutamic acid 102	ME897831	1.55	1.59	1.55	1.55	1.50	0.70	0.70	0.68	0.70	0.60	0.09	0.21
Aspartic 115	ME897826	1.49	1.52	1.49	1.55	1.50	0.71	0.69	0.68	0.71	0.71	0.13	0.28
Aspartic 88	ME897825	1.45	1.47	1.45	1.50	1.43	0.75	0.74	0.71	0.73	0.75	0.14	0.31
Octanoyl-CoA 79	ME897886	1.80	1.86	2.46	2.06	1.93	0.23	0.34	0.41	0.07	0.25	0.07	0.01
Palmitoleic PAR	ME897853	2.30	1.40	1.83	1.83	1.80	0.28	0.24	0.22	0.34	0.43	0.05	0.06
Ketoglutaric 57	ME897830	1.88	1.73	1.80	1.88	1.97	0.40	0.43	0.42	0.40	0.38	0.07	0.08
myo-Inositol 161	ME897844	1.93	1.82	1.71	1.70	1.73	0.41	0.41	0.41	0.41	0.40	0.22	0.55
GSSG 179	ME897864	2.30	1.49	1.43	2.51	3.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	NA
GSSG 306	ME897863	2.49	1.58	1.39	2.60	3.24	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00
NADPH 408	ME897869	2.93	2.45	2.69	1.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Oleoyl-CoA (18:1) 79	ME897895	2.19	1.91	2.19	3.39	2.24	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
Oxaloacetic 87	ME897823	2.29	1.09	2.79	2.02	2.07	0.15	0.21	0.19	0.30	0.12	0.05	0.03
NADH 408	ME897867	2.55	1.93	2.24	2.55	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
HMG-CoA 408	ME897887	2.30	2.20	2.12	2.72	2.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01
Coenzyme A 408	ME897872	2.35	2.46	2.50	2.23	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Coenzyme A 79	ME897871	2.34	2.42	2.53	2.26	2.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Fumaric 71	ME897818	2.38	2.01	2.22	2.11	2.38	0.05	0.05	0.08	0.06	0.04	0.03	0.07
Malic 115	ME897827	2.32	2.09	2.24	2.19	2.38	0.06	0.06	0.06	0.07	0.04	0.00	0.00
Malic 71	ME897828	2.35	2.05	2.24	2.17	2.41	0.06	0.06	0.06	0.06	0.04	0.00	0.00
Methylcrotonyl-CoA 79	ME897881	2.47	2.25	2.23	2.18	2.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00
NAD+ 540	ME897865	2.44	2.25	2.27	2.20	2.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Taurine 80	ME897822	2.32	2.23	2.26	2.27	2.27	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.00
FAD 408	ME897874	2.33	2.20	2.20	2.27	2.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	NA
FAD 79	ME897873	2.43	2.17	2.22	2.28	2.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Methylcrotonyl-CoA 408	ME897882	2.20	1.87	1.99	1.90	1.93	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	NA
Alanine NEG PAR	ME897813	2.18	1.99	2.02	2.17	2.46	0.13	0.11	0.11	0.15	0.18	0.03	0.06
Ketoglutaric 101	ME897829	2.08	1.88	1.91	2.05	2.22	0.26	0.26	0.26	0.30	0.19	0.01	0.01
Succinyl-CoA 408	ME897885	2.65	2.46	3.06	1.76	1.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00
Acetyl-CoA 408	ME897876	2.25	2.16	2.49	1.73	1.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	NA	NA
Acetyl-CoA 461	ME897877	2.31	2.21	2.54	1.76	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	NA
Acetyl-CoA 79	ME897875	2.47	2.47	2.82	1.89	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Citric 173	ME897846	2.42	2.46	2.57	1.99	1.74	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00
Propionyl-CoA 408	ME897878	2.52	2.38	2.56	2.00	1.54	0.02	0.04	0.03	0.03	0.04	0.01	0.08
Acetic PAR	ME897810	1.49	1.05	0.10	0.58	3.50	0.63	0.18	0.40	0.37	0.25	2.70	2.12
Formic PARENT	ME897809	0.83	0.67	1.12	1.26	1.07	0.95	0.78	1.08	0.76	0.93	1.64	3.54
Phenylalanine 147	ME897833	1.23	1.25	1.29	1.24	1.30	0.77	0.77	0.76	0.74	0.90	0.89	1.85
Phenylalanine 72	ME897834	1.20	1.22	1.26	1.21	1.27	0.74	0.74	0.75	0.73	0.87	1.87	1.92
Pyruvic 32	ME897812	1.50	1.01	1.18	1.55	2.46	0.55	0.48	0.43	0.74	0.46	1.06	2.08
C75 209	ME897852	1.40	1.88	1.31	1.86	1.93	0.43	0.55	0.44	0.24	0.55	0.71	1.84
Cysteine PARENT	ME897821	1.32	1.74	1.25	1.76	2.12	0.62	0.30	0.63	0.52	0.70	0.07	2.24

Factors:

F1	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Intracellular \| Drug Treatment:10 nM GSK214069
F2	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Intracellular \| Drug Treatment:200 nM GSK214069
F3	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Intracellular \| Drug Treatment:500 nM GSK214069
F4	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Intracellular \| Drug Treatment:50 nM GSK214069
F5	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Intracellular \| Drug Treatment:Control
F6	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Medium \| Drug Treatment:10 nM GSK214069
F7	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Medium \| Drug Treatment:200 nM GSK214069
F8	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Medium \| Drug Treatment:500 nM GSK214069
F9	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Medium \| Drug Treatment:50 nM GSK214069
F10	Sample source:BT-474 breast cancer cells \| Sample Type:Medium \| Drug Treatment:Control
F11	Sample source:NA \| Sample Type:NA \| Drug Treatment:NA
F12	Sample source:NA \| Sample Type:QC \| Drug Treatment:NA

Data matrix