Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST003842)

(Analysis AN006314)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15	F16	F17	F18	F19	F20	F21	F22	F23	F24	F25	F26
CE 15:2[M+NH4]+	ME1015961	0.06	0.89	0.28	2.17	0.42	2.33	0.75	0.07	0.04	0.52	0.04	0.49	1.33	0.05	0.83	2.12	0.15	0.17	0.06	0.06	0.03	1.95	0.04	0.07	1.63	0.09
Cer 29:1;O2\|Cer 14:1;O2/15:0[M+H]+	ME1015964	2.56	1.39	0.18	1.72	0.23	1.70	0.55	1.52	3.52	1.25	0.02	1.47	3.04	4.93	0.29	1.22	0.14	2.07	0.58	1.92	0.14	1.31	2.41	1.40	1.12	0.55
Cer 30:0;O2\|Cer 14:0;O2/16:0[M+H]+	ME1015965	2.42	1.80	0.11	1.76	0.06	1.68	0.21	0.72	3.53	2.46	0.07	1.09	2.53	3.95	0.10	1.48	0.19	0.21	0.27	1.68	0.02	2.13	0.71	0.79	0.70	1.29
CAR 18:1[M+H]+	ME1015956	7.48	0.62	0.23	0.96	0.22	2.09	0.60	0.73	0.71	0.54	0.20	3.19	0.69	1.61	0.70	1.27	0.24	0.71	1.01	1.14	0.10	1.54	0.60	1.63	0.58	0.90
CAR 7:0[M+H]+	ME1015960	1.55	1.21	0.14	0.30	0.27	1.09	0.11	4.65	1.30	0.49	0.03	2.02	1.21	3.02	0.21	1.27	0.10	5.98	4.09	3.97	0.12	1.88	2.79	3.90	0.37	0.57
CAR 22:1[M+H]+	ME1015957	0.84	1.47	0.03	1.29	0.03	1.76	0.06	4.01	2.73	3.51	0.01	0.78	2.53	2.34	0.05	1.52	0.02	2.42	0.56	3.39	0.01	1.17	3.71	0.68	0.67	1.65
CAR 18:0[M+H]+	ME1015955	1.44	1.11	0.44	0.57	0.50	1.60	0.62	1.14	1.42	0.83	0.20	2.02	1.28	1.37	1.20	0.88	0.20	1.22	2.67	2.57	0.19	1.51	1.51	3.91	0.70	1.28
CAR 5:0[M+H]+	ME1015959	3.09	1.03	0.79	0.95	2.66	1.01	1.01	1.51	0.97	0.85	0.22	2.13	0.96	1.78	0.83	0.98	0.43	2.20	2.02	2.40	0.56	1.24	1.44	1.77	0.46	0.68
Cer 28:1;O2\|Cer 14:1;O2/14:0[M+H]+	ME1015963	2.37	1.31	1.03	1.12	0.16	1.21	0.43	2.06	2.26	1.13	0.02	1.94	1.49	2.21	0.28	1.02	1.95	0.60	0.77	2.59	0.04	1.68	0.82	2.84	0.79	1.16
Cer 24:1;O2\|Cer 14:1;O2/10:0[M+H]+	ME1015962	0.78	3.28	0.12	0.70	0.20	1.35	0.20	0.79	1.35	0.86	0.02	4.58	0.87	0.87	0.41	0.88	0.04	1.47	1.26	2.52	0.08	2.13	1.37	3.65	0.59	0.73
CAR 13:0[M+H]+	ME1015954	1.53	1.16	0.35	0.81	0.18	1.60	0.55	1.65	1.44	0.97	0.05	1.69	1.45	1.78	0.48	1.57	0.22	0.66	0.95	2.41	0.13	1.75	1.93	2.73	0.69	1.16
CAR 4:0[M+H]+	ME1015958	4.99	0.39	2.19	1.20	4.61	0.68	4.10	0.45	0.12	0.37	0.41	1.02	0.24	1.35	1.65	0.59	0.46	0.63	0.35	0.52	0.49	0.65	0.16	0.33	0.33	0.20

Factors:

F1	Sample source:Cocoon shell \| Region:Armenia \| Sample_type:Old
F2	Sample source:Cocoon shell \| Region:China \| Sample_type:Old
F3	Sample source:Cocoon shell \| Region:Europe \| Sample_type:New
F4	Sample source:Cocoon shell \| Region:Europe \| Sample_type:Old
F5	Sample source:Cocoon shell \| Region:France \| Sample_type:New
F6	Sample source:Cocoon shell \| Region:France \| Sample_type:Old
F7	Sample source:Cocoon shell \| Region:Georgia \| Sample_type:New
F8	Sample source:Cocoon shell \| Region:Georgia \| Sample_type:Old
F9	Sample source:Cocoon shell \| Region:Germany \| Sample_type:Old
F10	Sample source:Cocoon shell \| Region:Greece \| Sample_type:Old
F11	Sample source:Cocoon shell \| Region:Hungary \| Sample_type:New
F12	Sample source:Cocoon shell \| Region:India \| Sample_type:Old
F13	Sample source:Cocoon shell \| Region:Iran \| Sample_type:Old
F14	Sample source:Cocoon shell \| Region:Iraq \| Sample_type:Old
F15	Sample source:Cocoon shell \| Region:Italy \| Sample_type:New
F16	Sample source:Cocoon shell \| Region:Italy \| Sample_type:Old
F17	Sample source:Cocoon shell \| Region:Japan \| Sample_type:New
F18	Sample source:Cocoon shell \| Region:Japan \| Sample_type:Old
F19	Sample source:Cocoon shell \| Region:Korea \| Sample_type:Old
F20	Sample source:Cocoon shell \| Region:Russia \| Sample_type:Old
F21	Sample source:Cocoon shell \| Region:Spain \| Sample_type:New
F22	Sample source:Cocoon shell \| Region:Spain \| Sample_type:Old
F23	Sample source:Cocoon shell \| Region:Switzerland \| Sample_type:Old
F24	Sample source:Cocoon shell \| Region:Thailand \| Sample_type:Old
F25	Sample source:Cocoon shell \| Region:Turkey \| Sample_type:Old
F26	Sample source:Cocoon shell \| Region:Uzbekistan \| Sample_type:Old

Data matrix