Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for Mutation Study (Study ST000013)

GCMS positive ion mode (Analysis AN000030)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15
urea	ME644060	1.60	1.17	2.86	0.64	1.25	0.69	1.48	0.40	0.20	1.03	0.94	0.31	1.25	0.43	0.74
arachidic acid	ME643968	0.67	0.60	4.26	1.03	0.64	0.50	0.57	0.74	0.58	0.99	0.66	1.08	1.41	0.69	0.58
oxoproline	ME644033	1.01	0.70	3.84	1.00	1.65	0.86	0.55	0.56	0.62	0.80	0.56	0.90	0.74	0.67	0.54
maleic acid	ME644022	0.91	1.10	0.88	0.85	1.04	0.69	1.02	3.06	0.82	0.86	0.64	0.55	0.85	0.94	0.80
proline	ME644040	0.81	0.86	0.55	0.67	1.23	2.21	0.83	1.33	0.81	0.98	0.50	0.97	0.81	1.68	0.76
glucose non-meox	ME643989	0.99	1.12	0.65	1.48	0.69	0.44	0.65	0.73	2.48	0.76	0.87	1.57	0.52	0.99	1.07
suberyl glycine	ME644049	1.16	0.37	0.94	1.09	0.88	1.17	0.51	0.93	2.31	1.57	0.68	0.79	0.58	0.92	1.10
glucose	ME643988	0.83	0.99	0.63	0.87	0.65	1.24	0.63	1.05	1.01	0.75	2.79	1.23	0.82	0.75	0.76
threitol	ME644052	0.92	0.80	1.33	1.01	0.93	0.73	1.01	0.68	0.70	0.78	2.14	0.75	0.99	0.82	1.42
ribitol	ME644043	0.96	1.73	1.10	0.91	0.62	1.18	0.99	0.67	0.62	0.62	0.53	1.08	1.02	1.13	1.84
raffinose	ME644042	1.48	0.97	0.61	1.08	1.15	0.67	1.57	1.71	0.45	0.97	0.74	1.16	0.80	0.85	0.80
1-monostearin	ME643954	0.69	1.00	1.50	1.45	0.90	0.91	0.86	0.92	0.94	0.92	1.11	1.92	0.67	0.51	0.69
erythronic acid lactone	ME643981	0.91	1.31	0.71	1.44	0.83	0.72	0.87	0.53	1.03	1.10	0.87	2.05	1.03	0.95	0.64
1,2-anhydro-myo-inositol NIST	ME643953	1.05	0.98	0.72	1.52	0.94	0.70	0.77	1.12	1.31	0.74	0.74	1.90	0.73	0.93	0.83
3,6-anhydrogalactose	ME643958	0.76	1.17	0.42	1.35	0.95	0.84	0.75	1.09	1.47	0.96	0.89	1.83	0.75	0.88	0.90
citric acid	ME643976	1.14	0.80	0.96	1.23	1.37	0.57	1.53	0.62	0.74	0.57	0.72	0.90	1.82	0.77	1.25
sucrose	ME644051	1.07	1.00	1.07	1.07	0.97	0.87	0.89	0.87	0.92	0.95	0.72	0.40	2.21	0.95	1.03
myristic acid	ME644027	1.08	0.99	1.35	1.23	0.80	1.18	1.05	1.72	1.00	0.57	0.88	0.49	0.60	1.03	1.03
glutamic acid	ME643993	0.67	0.72	1.16	1.24	0.77	0.89	1.09	1.17	1.45	1.44	0.73	0.39	1.05	1.00	1.24
hydroxycarbamate NIST	ME644004	0.76	0.78	1.72	1.23	0.77	1.48	0.95	0.90	1.48	0.91	0.76	0.63	1.10	0.67	0.83
hydroxylamine	ME644005	0.89	0.69	1.47	0.87	0.80	1.03	1.33	0.79	1.68	0.87	1.00	0.55	1.34	0.79	0.91
lauric acid	ME644013	0.91	0.57	1.99	1.17	0.69	0.76	0.93	0.85	0.80	1.23	0.88	1.30	1.39	0.70	0.83
stearic acid	ME644048	0.98	0.65	2.15	1.40	0.76	0.58	0.68	1.03	0.81	1.03	0.75	1.65	1.24	0.61	0.66
oleic acid	ME644030	1.09	1.00	1.88	1.01	0.99	0.70	1.02	0.96	0.95	0.75	1.17	0.78	0.96	1.04	0.71
palmitic acid	ME644034	1.02	0.88	1.76	1.14	0.84	0.84	0.80	1.03	0.91	0.96	0.97	1.14	0.99	0.87	0.83
levoglucosan	ME644016	0.86	0.92	1.70	1.15	0.92	0.72	1.04	0.75	0.73	1.04	0.83	1.20	1.46	1.04	0.68
pelargonic acid	ME644035	0.77	0.93	2.11	0.97	0.92	1.00	0.81	0.73	0.99	0.86	0.84	1.21	1.19	0.94	0.73
phosphoric acid	ME644038	0.94	0.73	1.30	1.16	0.85	1.18	0.39	1.08	1.04	1.36	1.10	0.82	0.74	1.32	0.98
asparagine	ME643971	0.87	0.70	0.73	0.81	0.86	0.75	0.88	0.95	1.16	1.41	1.16	1.08	0.78	1.86	0.99
glucuronic acid	ME643992	1.00	1.09	0.95	0.79	0.83	0.84	0.61	0.89	0.92	0.93	1.12	1.19	1.08	1.78	0.98
tocopherol	ME644055	1.64	1.02	1.93	0.76	1.11	0.88	0.83	0.53	1.25	0.50	0.99	0.52	1.13	0.87	1.05
2-ketoisocaproic acid	ME643957	1.19	1.18	1.12	1.06	1.07	1.14	1.10	0.80	1.21	0.63	1.26	0.27	1.13	0.82	1.02
cis-sinapinic acid	ME643975	1.13	1.32	1.56	0.86	1.00	1.00	1.00	0.74	1.26	0.63	1.41	0.57	0.97	0.64	0.91
maltose	ME644023	0.72	1.14	0.59	1.49	1.20	1.01	0.91	1.12	1.40	1.38	0.90	0.90	0.80	0.74	0.70
threonic acid	ME644053	0.64	1.42	0.62	1.28	1.06	1.06	1.29	1.28	0.52	1.20	0.75	1.27	1.03	0.89	0.67
citrulline	ME643977	0.68	1.16	0.92	0.85	0.83	0.92	0.98	1.07	1.46	1.34	0.89	1.08	0.72	1.01	1.11
ornithine	ME644031	0.74	1.00	0.76	0.78	0.79	0.85	1.07	0.92	1.76	1.63	0.95	0.82	0.54	0.98	1.42
arginine + ornithine	ME643969	0.61	1.31	0.89	0.78	0.74	0.99	1.00	0.71	1.24	1.49	0.78	1.54	0.78	0.96	1.20
lysine	ME644019	0.86	0.99	1.27	0.87	0.96	0.89	1.08	0.71	0.87	1.39	0.90	1.37	0.94	0.86	1.06
glycolic acid	ME644000	0.92	0.94	1.41	0.87	0.77	0.79	1.02	1.10	0.94	1.06	0.83	0.75	1.40	1.22	0.97
lyxitol	ME644020	1.11	0.86	1.60	1.00	0.89	0.77	1.63	0.75	0.76	0.86	0.93	0.78	1.21	0.90	0.97
glucoheptulose	ME643987	1.09	1.30	0.92	1.03	1.00	0.72	1.80	0.83	0.79	0.73	0.66	1.02	1.05	0.93	1.10
oxalic acid	ME644032	0.88	1.33	0.79	1.28	1.12	0.89	1.51	1.01	0.64	1.07	0.60	0.85	1.34	0.78	0.93
trehalose	ME644057	1.07	1.19	0.85	1.31	1.16	0.75	1.03	0.99	0.74	0.81	0.86	0.77	1.57	1.02	0.90
erythritol	ME643979	1.01	0.89	1.37	1.31	1.12	0.72	1.09	1.09	0.70	0.66	0.74	0.94	0.97	0.74	1.64
phenylalanine	ME644036	1.02	1.03	1.18	1.13	0.86	0.82	1.00	1.09	0.93	0.97	0.90	0.73	0.94	0.99	1.41
xylonic acid	ME644063	0.86	1.19	0.86	0.99	1.19	0.81	1.04	1.01	0.76	0.82	0.96	0.77	0.96	1.00	1.78
glucose-1-phosphate	ME643990	1.00	1.11	1.05	1.20	0.93	0.69	0.68	0.97	0.71	1.12	1.08	1.32	1.33	0.91	0.89
glycine	ME643999	0.82	0.82	1.28	1.03	0.82	0.82	0.91	1.02	1.20	0.84	1.15	1.44	0.94	0.85	1.05
glycerol	ME643996	0.82	0.92	1.27	0.92	1.07	1.21	1.11	0.81	1.46	0.95	1.02	0.79	0.99	0.84	0.82
allantoin	ME643966	1.12	0.76	1.50	1.04	0.85	0.75	0.88	0.70	1.19	1.22	1.02	0.92	0.96	0.91	1.18
linoleic acid	ME644017	1.08	0.96	1.31	0.98	0.92	0.89	0.88	0.87	1.19	0.88	1.10	0.89	0.96	1.20	0.90
isofucostanol	ME644009	1.04	0.93	1.34	0.95	1.13	0.96	0.94	0.84	1.32	0.89	0.91	0.94	0.98	0.78	1.06
linolenic acid	ME644018	1.02	1.05	1.47	0.83	1.01	0.89	0.86	0.66	1.27	1.07	1.10	0.87	0.99	0.88	1.03
lactobionic acid	ME644012	1.09	1.03	0.99	1.32	1.21	0.83	0.98	1.08	1.17	1.08	0.92	0.75	0.93	0.79	0.82
succinic acid	ME644050	1.13	1.08	1.04	1.32	0.76	1.00	0.86	1.10	1.20	1.06	1.10	0.64	1.17	0.80	0.74
isoleucine	ME644011	1.13	0.86	1.55	1.29	1.23	0.80	1.20	0.76	0.74	0.91	0.91	0.81	0.99	0.86	0.97
tyrosine	ME644059	1.06	0.92	1.49	1.34	1.12	0.75	0.97	0.95	0.75	0.93	1.01	0.88	1.03	0.79	1.01
alanine	ME643965	1.30	0.84	1.17	0.99	1.38	0.74	1.30	0.83	0.80	0.66	0.79	0.92	1.33	0.92	1.04
2-deoxyerythritol NIST	ME643955	1.35	0.90	1.38	1.05	1.04	0.64	1.01	0.83	0.79	0.82	0.93	0.75	1.28	1.04	1.19
4-hydroxyphenyl-2-ethylglucopyranoside NIST	ME643959	1.28	0.97	1.13	1.34	1.11	0.72	0.99	1.09	0.76	0.68	0.80	0.98	1.13	0.95	1.08
adenosine	ME643962	0.77	0.92	0.86	1.30	1.58	0.85	1.02	0.70	1.11	0.96	1.29	0.81	1.05	0.80	0.97
guanosine	ME644001	0.95	0.98	0.83	1.14	1.46	0.86	0.95	0.78	1.23	1.05	1.08	0.90	0.92	0.87	0.99
idonic acid NIST	ME644006	0.91	0.87	1.09	1.11	1.20	0.90	0.81	1.00	0.92	1.08	0.73	1.24	1.23	0.88	1.04
glutamine	ME643994	0.81	1.03	1.13	0.90	1.04	0.97	1.11	1.06	1.09	1.11	0.83	1.02	1.04	0.70	1.16
inositol myo-	ME644007	0.83	1.00	1.15	0.92	1.07	0.87	1.10	1.08	1.01	0.94	0.93	1.06	1.08	0.99	0.97
galactinol	ME643984	0.95	1.13	0.93	1.08	1.28	0.83	0.96	0.99	0.80	0.87	0.98	1.21	1.15	0.79	1.04
monopalmitin-1-glyceride	ME644026	0.83	1.12	0.89	1.05	1.36	0.98	0.95	0.84	0.93	0.83	1.17	1.24	1.01	0.82	0.98
beta alanine	ME643973	0.87	1.06	0.71	1.18	1.31	0.85	1.24	0.79	1.11	0.91	0.94	1.04	1.03	0.89	1.06
methionie sulfoxide	ME644025	0.72	1.08	0.69	1.04	1.24	0.82	1.19	0.90	1.08	1.05	0.85	1.19	1.04	1.04	1.08
xylitol	ME644062	0.74	0.90	0.91	1.22	1.08	0.82	1.28	1.10	0.86	1.00	0.73	1.25	1.18	0.99	0.94
arabinose	ME643967	0.96	1.10	0.99	1.10	1.15	0.75	1.09	0.88	0.90	0.92	0.92	1.05	1.14	1.14	0.90
glyceric acid	ME643995	0.86	1.09	0.99	1.23	1.13	0.77	1.22	1.12	0.94	0.78	0.86	0.96	1.17	0.91	0.97
serine	ME644045	1.06	1.00	1.09	0.98	0.88	1.10	1.23	0.74	0.99	0.95	1.06	1.00	1.02	1.06	0.84
5-hydroxynorvaline NIST	ME643961	1.11	0.98	0.82	1.11	1.21	0.77	1.05	0.74	1.11	1.24	0.93	0.72	1.05	1.05	1.11
2-hydroxyglutaric acid	ME643956	0.96	1.24	0.89	0.90	1.35	0.98	0.97	0.81	1.02	1.01	0.89	0.87	0.93	1.05	1.11
glycerol-beta-phosphate	ME643998	1.16	1.14	0.99	1.02	1.10	0.83	0.97	0.87	1.05	0.99	0.96	0.80	1.04	0.95	1.14
mannonic acid NIST	ME644024	1.14	1.27	0.85	1.03	1.11	0.80	1.01	0.93	0.89	0.94	0.84	0.86	1.14	1.04	1.15
galactose-6-phosphate_199932	ME643986	0.98	1.13	0.84	0.97	1.01	0.91	0.93	0.90	1.14	1.05	0.88	1.11	0.97	1.05	1.13
glucose-6-phosphate	ME643991	0.98	1.13	0.84	0.96	1.01	0.90	0.96	0.92	1.18	1.06	0.77	1.15	0.96	1.02	1.13
adenosine-5-monophosphate	ME643963	1.07	1.05	0.93	1.03	1.18	0.77	0.96	0.92	1.25	0.92	0.90	1.03	0.94	0.97	1.10
shikimic acid	ME644046	1.00	1.22	0.92	0.97	1.13	0.76	1.06	0.90	1.04	0.94	0.93	1.04	1.02	1.01	1.06
aspartic acid	ME643972	1.10	1.11	1.04	0.97	1.17	0.78	1.24	0.72	1.00	0.86	0.90	0.68	1.12	1.08	1.24
homoserine	ME644003	1.05	0.97	1.12	0.93	1.24	0.82	1.15	0.82	1.07	0.92	0.90	0.69	1.17	1.03	1.12
malate	ME644021	1.07	1.08	1.03	1.04	1.23	0.76	1.19	1.02	0.83	0.83	0.71	0.84	1.11	1.08	1.18
fumarate	ME643983	0.96	1.22	1.16	1.06	1.22	0.91	1.17	0.83	0.74	0.97	0.80	0.82	0.99	1.01	1.14
threonine	ME644054	1.00	1.05	1.06	1.22	1.13	0.79	1.31	0.86	0.83	1.01	0.81	0.79	0.99	0.99	1.15
trans-sinapinic acid	ME644056	1.29	1.04	1.22	0.91	1.04	0.79	1.18	0.69	1.00	0.88	1.18	1.00	1.05	0.78	0.98
N-acetyl-D-mannosamine	ME644029	1.16	1.05	1.27	1.13	1.03	0.75	1.07	0.81	0.80	0.87	0.90	0.95	1.18	0.98	1.07
5^-deoxy-5^-methylthioadenosine	ME643960	1.24	1.05	1.10	1.08	1.22	0.72	1.00	0.74	0.92	0.77	1.02	0.90	1.10	0.98	1.16
glycerol-alpha-phosphate	ME643997	1.14	1.11	1.08	1.02	1.15	0.72	1.11	0.79	0.91	0.95	0.99	1.01	1.10	0.91	1.01
inositol-4-monophosphate	ME644008	1.09	1.05	1.23	1.03	1.13	0.88	1.03	0.81	1.18	0.99	0.85	0.92	1.06	0.86	0.89
phosphoethanolamine	ME644037	1.06	1.08	1.19	1.10	1.06	0.90	0.98	0.85	1.00	1.02	0.92	0.92	0.96	0.87	1.10
valine	ME644061	1.06	0.95	1.17	1.10	1.14	0.86	1.07	0.97	0.96	1.01	0.87	0.85	1.11	0.92	0.98
cholesterol	ME643974	1.17	1.02	1.26	0.90	1.18	0.91	0.88	0.79	1.04	0.96	1.16	0.90	1.05	0.89	0.89
tryptophan	ME644058	1.20	0.99	1.18	1.06	1.30	0.77	0.87	0.97	0.93	0.92	0.98	0.94	0.98	0.91	1.00
agmatine	ME643964	1.14	1.07	0.98	0.74	1.04	0.85	1.10	1.33	1.12	0.85	1.03	1.26	0.82	0.85	0.80
putrescine	ME644041	1.27	1.02	0.84	0.80	1.08	0.81	1.08	1.16	1.20	0.95	1.03	1.25	0.73	0.86	0.92
erythronic acid	ME643980	1.12	1.22	0.72	0.98	1.04	0.92	1.11	1.38	0.77	1.06	0.77	1.26	0.93	0.74	0.98
isogalactinol	ME644010	1.07	1.23	0.74	1.07	1.17	0.81	1.13	1.22	0.83	0.88	0.88	1.04	0.88	0.96	1.10
sophorose	ME644047	0.97	0.96	0.77	1.12	1.08	0.88	0.99	1.03	1.03	1.11	0.81	1.30	0.92	1.06	0.97
homoglutamine	ME644002	0.82	1.03	0.89	1.08	1.15	0.99	0.97	0.87	1.18	1.09	0.82	1.45	0.98	0.82	0.87
xylose	ME644064	0.73	1.00	0.81	1.27	0.99	0.91	0.91	0.92	1.15	1.06	0.77	1.62	1.10	1.02	0.75
fructose	ME643982	1.06	1.27	0.69	1.19	0.97	0.94	0.73	0.91	1.31	1.08	0.60	1.36	0.94	0.88	1.07
N-acetyl-D-hexosamine	ME644028	0.80	1.50	0.58	1.08	0.94	0.89	0.79	0.86	1.12	1.07	1.04	1.37	0.84	1.00	1.13
leucine	ME644014	1.32	1.24	1.41	1.02	1.40	0.83	0.99	0.71	0.54	0.90	0.79	0.40	1.28	1.11	1.08
phytol	ME644039	0.84	1.08	1.18	1.05	1.97	0.76	1.17	0.70	0.93	0.92	0.89	0.81	0.82	0.87	1.01
galactose	ME643985	3.47	0.70	0.70	0.74	0.55	0.82	0.61	1.03	0.93	0.48	0.94	1.45	0.69	0.61	1.29
levanbiose	ME644015	3.12	0.84	2.38	0.62	0.84	0.44	0.35	0.37	1.00	0.31	0.67	0.24	0.85	1.01	1.96
dehydroascorbate	ME643978	2.98	0.92	2.91	0.50	0.70	0.65	0.52	0.38	0.76	0.43	0.70	0.80	0.84	0.98	0.92
ascorbic acid	ME643970	2.43	0.98	2.33	0.63	0.81	0.67	0.56	0.54	1.12	0.57	0.65	0.65	0.90	0.88	1.28
ribonic acid	ME644044	2.11	0.89	2.44	0.52	0.93	0.72	0.55	0.41	0.85	0.40	0.95	0.44	1.30	1.05	1.43

Factors:

F1	genotype:CS24090
F2	genotype:SAIL_6_G_02
F3	genotype:SALK_016312
F4	genotype:SALK_021832
F5	genotype:SALK_022584
F6	genotype:SALK_024747
F7	genotype:SALK_062847
F8	genotype:SALK_077749
F9	genotype:SALK_083600
F10	genotype:SALK_114456
F11	genotype:SALK_125505
F12	genotype:SALK_135268
F13	genotype:SALK_148208
F14	genotype:Wild type Col0: 1
F15	genotype:Wild type Col0: 2

Data matrix