Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for SIRM Analysis of human P493 cells under hypoxia in [U-13C/15N] labeled Glutamine medium (Both positive and ion mode FTMS) (Study ST000110)

GCMS positive ion mode (Analysis AN000185)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4
Succinate-[13C,15N]0	ME665489	0.89	0.86	1.49	0.76
Ser-[13C,15N]0	ME665319	0.53	0.55	1.26	1.65
Gln-[13C,15N]1	ME665311	1.03	0.55	1.08	1.34
Glu-[13C,15N]0	ME665368	0.56	1.13	0.61	1.70
Arg-[13C,15N]1	ME665420	1.43	0.39	0.83	1.35
Lys-[13C,15N]2	ME665482	NA	1.02	NA	0.97
Lys-[13C,15N]1	ME665444	0.57	NA	NA	1.43
Phe-ALL	ME665288	0.63	0.90	1.09	1.39
Glu-[13C,15N]6	ME665494	0.68	0.80	1.26	1.26
Phe-[13C,15N]3	ME665439	1.93	0.07	NA	NA
Malate-[13C,15N]1	ME665412	0.35	0.79	0.67	2.19
Malate-ALL	ME665283	0.56	0.70	1.15	1.59
Val-[13C,15N]5	ME665344	1.08	1.53	0.36	1.02
Ala-[13C,15N]4	ME665366	0.43	0.03	3.10	0.44
Gly-ALL	ME665277	0.55	0.72	1.41	1.32
bOHbutyrate-[13C,15N]0	ME665418	0.79	1.76	0.73	0.72
OHPro-[13C,15N]5	ME665349	0.40	0.98	1.13	1.49
Pro258-ALL	ME665290	0.79	0.63	1.69	0.89
GAB-[13C,15N]0	ME665396	0.41	0.54	1.66	1.39
GAB-[13C,15N]3	ME665411	0.54	0.12	2.10	0.80
Pro258-[13C,15N]5	ME665446	0.70	0.49	2.26	0.55
a-glycerol-3P_#2-[13C,15N]2	ME665378	0.57	1.24	1.37	0.93
Gln-[13C,15N]5	ME665473	1.04	0.62	1.80	0.53
Thr-[13C,15N]1	ME665403	0.56	0.38	1.58	1.97
Ala-[13C,15N]3	ME665459	0.55	0.06	2.94	0.45
Malate-[13C,15N]4	ME665398	0.62	0.66	1.33	1.40
Succinate-[13C,15N]2	ME665467	0.48	0.95	1.10	1.47
Leu-[13C,15N]0	ME665488	0.66	1.01	0.96	1.37
Ser-[13C,15N]3	ME665390	0.27	0.40	1.45	1.88
Malate-[13C,15N]3	ME665328	0.54	0.74	0.92	1.80
fumarate-[13C,15N]1	ME665498	0.43	0.84	0.63	2.10
Leu-ALL	ME665281	0.68	0.91	1.10	1.31
Malate-[13C,15N]0	ME665416	0.62	0.75	1.12	1.51
Glu-ALL	ME665276	0.61	0.86	1.03	1.50
Tyr-[13C,15N]2	ME665327	1.15	0.57	0.07	2.63
Val-[13C,15N]0	ME665425	0.61	0.95	0.99	1.46
Ala-[13C,15N]0	ME665384	0.58	0.67	1.34	1.41
OHPro-[13C,15N]3	ME665415	0.77	0.60	1.28	1.24
GAB-[13C,15N]2	ME665300	0.37	0.99	0.70	1.94
Gln-[13C,15N]6	ME665360	0.66	0.36	1.62	1.37
Cys-[13C,15N]2	ME665468	0.62	0.63	0.45	2.11
Tyr-[13C,15N]3	ME665305	NA	0.52	1.21	1.13
Tyr-[13C,15N]5	ME665342	1.42	1.00	1.77	0.19
Met-[13C,15N]0	ME665367	0.65	0.89	0.98	1.48
OHPro-[13C,15N]4	ME665442	0.38	0.65	1.29	1.68
a-glycerol-3P_#2-[13C,15N]0	ME665402	0.54	0.93	1.13	1.40
Tyr-[13C,15N]0	ME665407	0.52	0.83	1.07	1.59
Thr-[13C,15N]3	ME665449	1.31	0.84	NA	NA
Pro258-[13C,15N]3	ME665405	0.63	0.70	1.62	1.05
Glu-[13C,15N]3	ME665469	0.42	0.92	0.80	1.86
fumarate-ALL	ME665273	0.52	0.79	1.06	1.63
Gln-ALL	ME665275	0.62	0.35	1.68	1.35
Trp-[13C,15N]0	ME665437	0.76	0.81	0.61	1.81
Asn-[13C,15N]2	ME665359	0.48	NA	0.35	1.85
Asp-[13C,15N]2	ME665353	0.27	0.90	0.77	2.07
Tyr-[13C,15N]6	ME665306	0.68	0.26	0.79	2.28
OHPro-[13C,15N]1	ME665397	0.35	0.61	1.54	1.50
Met-[13C,15N]3	ME665457	0.74	1.16	1.33	0.76
Gln-[13C,15N]8	ME665343	2.42	0.44	1.33	0.37
Ala-[13C,15N]2	ME665503	0.64	0.23	2.28	0.85
Asp-[13C,15N]0	ME665382	0.30	0.83	0.74	2.12
bOHbutyrate-[13C,15N]4	ME665453	0.05	NA	2.20	0.76
Tyr-[13C,15N]9	ME665318	NA	0.33	1.08	1.30
Pro258-[13C,15N]7	ME665337	0.75	0.25	2.26	0.62
Pro258-[13C,15N]4	ME665456	0.78	0.61	1.78	0.83
Ile-ALL	ME665279	0.64	0.92	1.14	1.29
fumarate-[13C,15N]3	ME665362	0.45	0.73	1.04	1.79
c-aconitate-ALL	ME665410	0.59	0.74	1.04	1.63
a-glycerol-3P_#1-[13C,15N]0	ME665413	0.54	0.92	1.16	1.39
a-glycerol-3P_#1-[13C,15N]2	ME665445	0.59	NA	1.41	NA
Trp-[13C,15N]1	ME665480	1.53	0.84	NA	0.63
Orn-[13C,15N]3	ME665356	0.92	1.26	0.76	1.06
OHPro-[13C,15N]0	ME665340	0.51	0.52	1.48	1.50
Malate-[13C,15N]2	ME665326	0.44	0.70	0.97	1.89
Lys-[13C,15N]5	ME665314	0.85	1.67	0.56	0.69
Gln-[13C,15N]3	ME665463	0.58	0.26	0.28	2.88
lactate-[13C,15N]0	ME665502	0.90	0.93	1.12	1.05
Phe-[13C,15N]5	ME665351	0.50	0.66	1.18	1.66
Asn-ALL	ME665268	0.49	0.41	1.78	1.31
fumarate-[13C,15N]0	ME665466	0.55	0.99	0.97	1.48
Phe-[13C,15N]6	ME665363	1.61	0.45	NA	0.32
Lys-[13C,15N]4	ME665307	0.54	0.93	1.11	1.96
Lys-ALL	ME665282	1.06	0.91	1.16	0.87
Arg-[13C,15N]0	ME665451	0.78	0.98	1.13	1.11
Tyr-ALL	ME665296	0.53	0.83	1.06	1.58
Orn-[13C,15N]4	ME665392	NA	0.02	0.32	2.66
Gln-[13C,15N]4	ME665303	0.17	0.25	1.80	1.36
citrate-[13C,15N]1	ME665357	0.30	0.40	0.88	2.43
GAB-[13C,15N]4	ME665354	0.55	0.23	2.34	0.88
Thr-[13C,15N]4	ME665385	0.86	1.07	NA	NA
citrate-[13C,15N]0	ME665350	0.45	0.56	1.44	1.54
Succinate-[13C,15N]4	ME665388	0.67	0.60	1.50	1.23
Val-[13C,15N]3	ME665476	0.01	2.66	NA	0.33
a-glycerol-3P_#2-ALL	ME665298	0.53	0.91	1.14	1.42
Asp-ALL	ME665269	0.37	0.74	1.07	1.81
Ile-[13C,15N]5	ME665313	1.34	0.54	1.56	0.57
Orn-[13C,15N]5	ME665408	0.26	0.16	3.38	0.94
citrate-[13C,15N]5	ME665346	0.25	0.39	0.83	2.53
Arg-[13C,15N]3	ME665389	NA	0.41	0.55	1.52
fumarate-[13C,15N]2	ME665441	0.44	0.73	0.77	2.06
Orn-ALL	ME665287	0.69	1.07	1.04	1.21
Ser-ALL	ME665292	0.47	0.52	1.29	1.72
lactate-ALL	ME665280	0.88	0.92	1.14	1.05
a-glycerol-3P_#1-ALL	ME665299	0.55	0.90	1.17	1.38
Asn-[13C,15N]4	ME665338	NA	NA	1.29	0.71
Val-[13C,15N]4	ME665375	0.75	NA	0.64	1.43
Ile-[13C,15N]6	ME665333	1.08	0.36	1.63	0.94
Val-[13C,15N]2	ME665358	0.53	0.46	2.10	0.64
Leu-[13C,15N]1	ME665438	0.73	0.74	1.31	1.21
Ser-[13C,15N]2	ME665394	0.23	0.47	1.30	2.00
Thr-[13C,15N]2	ME665443	0.81	NA	0.78	1.83
Cys-[13C,15N]3	ME665401	0.81	0.93	0.86	1.39
Ser-[13C,15N]1	ME665458	0.33	0.46	1.36	1.85
citrate-[13C,15N]4	ME665370	0.37	0.51	1.11	2.02
a-glycerol-3P_#2-[13C,15N]3	ME665417	0.29	0.33	1.44	1.94
OHPro-[13C,15N]2	ME665374	0.58	0.65	1.48	1.14
a-ketoglutarate-[13C,15N]4	ME665404	0.94	1.31	0.59	1.30
Phe-[13C,15N]9	ME665495	1.08	1.43	1.14	0.35
a-ketoglutarate-[13C,15N]5	ME665434	1.72	0.61	1.40	0.26
Ile-[13C,15N]3	ME665500	NA	1.09	NA	0.91
a-ketoglutarate-[13C,15N]3	ME665497	1.50	1.11	0.58	0.81
Val-ALL	ME665297	0.64	0.88	1.12	1.36
Succinate-[13C,15N]1	ME665352	0.71	1.02	1.05	1.22
c-aconitate-[13C,15N]2	ME665348	0.31	0.98	0.30	2.42
citrate-[13C,15N]6	ME665361	0.45	0.44	1.31	1.80
Tyr-[13C,15N]8	ME665474	0.42	0.20	0.09	4.09
Phe-[13C,15N]0	ME665302	0.56	0.87	1.11	1.47
Lys-[13C,15N]0	ME665490	1.07	0.88	1.20	0.84
Asp-[13C,15N]4	ME665355	0.40	0.74	1.13	1.72
citrate-[13C,15N]2	ME665381	0.13	0.61	0.70	2.56
c-aconitate-[13C,15N]5	ME665433	0.36	NA	1.49	1.07
Met-[13C,15N]5	ME665477	0.65	0.89	0.98	1.48
Glu-[13C,15N]4	ME665460	0.49	0.77	0.89	1.85
a-glycerol-3P_#1-[13C,15N]1	ME665483	1.08	1.58	1.07	0.60
a-ketoglutarate-[13C,15N]2	ME665454	NA	1.39	1.07	0.74
Gly-[13C,15N]1	ME665486	0.36	0.66	1.45	1.54
a-glycerol-3P_#1-[13C,15N]3	ME665423	0.12	0.18	1.70	2.01
bOHbutyrate-ALL	ME665270	0.68	1.47	0.90	0.96
Lys-[13C,15N]3	ME665336	1.39	NA	0.46	1.15
Met-ALL	ME665284	0.66	0.90	1.01	1.44
Ile-[13C,15N]2	ME665475	0.76	0.93	1.61	0.70
a-ketoglutarate-[13C,15N]1	ME665424	0.99	1.24	0.54	NA
Pro258-[13C,15N]2	ME665432	0.61	0.75	1.40	1.24
GAB-ALL	ME665274	0.63	0.70	1.56	1.11
Thr-ALL	ME665294	0.55	0.60	1.34	1.51
Glu-[13C,15N]5	ME665395	0.70	0.87	1.08	1.35
Tyr-[13C,15N]4	ME665383	1.23	0.92	0.74	0.97
Phe-[13C,15N]7	ME665419	0.81	0.71	1.93	0.55
Leu-[13C,15N]6	ME665369	1.67	0.90	0.70	0.91
Lys-[13C,15N]6	ME665310	0.94	NA	0.79	1.27
Asp-[13C,15N]3	ME665470	0.40	0.77	0.93	1.90
Tyr-[13C,15N]1	ME665481	0.56	0.99	1.12	1.32
Orn-[13C,15N]2	ME665330	1.24	1.55	NA	0.21
Orn-[13C,15N]1	ME665461	0.50	0.02	1.75	1.25
Leu-[13C,15N]5	ME665301	1.26	0.33	1.75	0.31
c-aconitate-[13C,15N]4	ME665309	0.47	0.50	1.48	1.55
Arg-[13C,15N]6	ME665478	1.46	1.11	0.62	0.74
Asn-[13C,15N]1	ME665341	0.31	0.59	2.38	0.73
lactate-[13C,15N]2	ME665372	0.55	1.52	0.51	1.41
Val-[13C,15N]1	ME665462	0.73	0.65	1.52	1.10
Leu-[13C,15N]2	ME665379	0.55	0.89	1.46	1.10
Cys-[13C,15N]0	ME665315	0.37	0.77	0.84	2.02
Glu-[13C,15N]2	ME665317	0.40	0.97	0.50	2.13
c-aconitate-[13C,15N]1	ME665452	0.94	0.44	NA	1.34
a-glycerol-3P_#2-[13C,15N]1	ME665304	0.21	0.54	1.36	2.36
Pro258-[13C,15N]6	ME665329	2.85	0.06	1.03	0.06
lactate-[13C,15N]3	ME665387	0.88	0.80	1.29	1.03
c-aconitate-[13C,15N]0	ME665430	0.75	0.78	1.26	1.20
Asp-[13C,15N]5	ME665450	0.43	0.64	1.35	1.58
Ile-[13C,15N]4	ME665471	0.45	1.85	2.23	0.24
Orn-[13C,15N]0	ME665429	0.40	1.12	0.96	1.52
citrate-[13C,15N]3	ME665376	0.27	0.54	0.80	2.39
Ala-ALL	ME665266	0.58	0.42	2.00	1.01
Trp-ALL	ME665295	1.30	0.95	0.36	1.40
OHPro-ALL	ME665286	0.49	0.54	1.47	1.51
Arg-[13C,15N]4	ME665491	0.97	0.50	1.34	0.89
Arg-[13C,15N]5	ME665323	0.91	0.44	1.65	1.00
fumarate-[13C,15N]4	ME665421	0.54	0.64	1.29	1.53
Gly-[13C,15N]0	ME665496	0.58	0.72	1.40	1.29
a-ketoglutarate-ALL	ME665265	1.08	1.19	1.04	0.69
Pro258-[13C,15N]0	ME665386	0.56	0.85	1.27	1.32
Leu-[13C,15N]4	ME665472	0.66	1.59	0.34	1.21
Tyr-[13C,15N]7	ME665399	0.25	0.47	0.74	2.55
Phe-[13C,15N]2	ME665391	0.05	1.56	0.79	1.12
Succinate-ALL	ME665293	0.87	0.85	1.46	0.82
GAB-[13C,15N]1	ME665484	1.13	1.21	1.04	0.61
Cys-ALL	ME665272	0.38	0.80	0.84	1.98
Arg-[13C,15N]2	ME665373	0.83	0.75	1.34	NA
Cys-[13C,15N]1	ME665347	0.75	1.64	1.03	0.45
Met-[13C,15N]1	ME665377	0.70	0.84	1.30	1.16
Gly-[13C,15N]2	ME665371	0.28	0.73	1.45	1.54
Gln-[13C,15N]2	ME665455	0.82	0.70	1.63	0.53
Gln-[13C,15N]7	ME665427	0.62	0.33	1.69	1.36
Succinate-[13C,15N]3	ME665322	0.71	0.40	1.12	1.77
Asn-[13C,15N]0	ME665345	0.50	0.40	1.77	1.32
Thr-[13C,15N]0	ME665464	0.54	0.61	1.33	1.53
Pro258-[13C,15N]1	ME665393	0.62	0.80	1.39	1.19
bOHbutyrate-[13C,15N]1	ME665426	0.65	1.47	0.87	1.00
lactate-[13C,15N]1	ME665485	0.43	0.55	1.89	1.13
Met-[13C,15N]2	ME665501	0.60	1.69	1.38	0.03
Ile-[13C,15N]1	ME665332	0.70	0.68	1.34	1.28
Leu-[13C,15N]3	ME665316	0.48	NA	0.78	1.96
bOHbutyrate-[13C,15N]3	ME665365	1.02	1.54	1.11	0.33
Ile-[13C,15N]0	ME665364	0.60	1.07	0.99	1.34
a-ketoglutarate-[13C,15N]0	ME665409	0.39	1.26	1.36	0.99
Arg-ALL	ME665267	0.88	0.88	1.15	1.08
Ala-[13C,15N]1	ME665428	0.58	0.35	2.29	0.79
bOHbutyrate-[13C,15N]2	ME665339	0.91	0.77	1.33	0.99
c-aconitate-[13C,15N]3	ME665331	0.20	1.25	1.29	1.26
Phe-[13C,15N]8	ME665436	1.01	1.06	1.07	0.90
c-aconitate-[13C,15N]6	ME665325	0.58	0.68	0.86	1.87
citrate-ALL	ME665271	0.34	0.51	1.09	2.06
Phe-[13C,15N]4	ME665380	0.27	2.69	0.04	NA
Phe-[13C,15N]1	ME665321	0.66	0.79	0.80	1.76
Asn-[13C,15N]3	ME665448	0.90	1.07	1.08	0.98
Asp-[13C,15N]1	ME665431	0.25	0.79	0.82	2.15
Gln-[13C,15N]0	ME665400	0.58	0.85	1.29	1.28
Met-[13C,15N]4	ME665414	0.72	0.43	1.13	1.72

Factors:

F1	Oxygen Condition:hypoxia \| Treatment:None
F2	Oxygen Condition:hypoxia \| Treatment:Tetracycline
F3	Oxygen Condition:normoxia \| Treatment:None
F4	Oxygen Condition:normoxia \| Treatment:Tetracycline

Data matrix