Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for PGC1-A effect on TCA enzymes (Study ST001044)

Targeted GC POSITIVE ION MODE (Analysis AN001708)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4
Leu-13C4	ME252452	1.90	0.23	1.49	0.38
Leu-13C3	ME252451	2.03	0.50	0.17	0.89
Ile-13C0	ME252404	1.24	1.36	0.64	0.76
Asn-13C0	ME252355	NA	NA	1.16	0.84
GAB-ALL	ME252377	1.45	1.20	0.67	0.68
lactate-13C2	ME252619	0.62	1.49	1.13	0.76
Gln-13C3	ME252381	NA	0.05	1.61	0.86
bOHbutyrate-13C2	ME252599	NA	0.48	0.86	1.33
a-glycerol-3P_#2-13C0	ME252570	0.47	0.65	1.64	1.24
a-glycerol-3P_#2-13C3	ME252573	0.44	1.01	1.37	1.19
aOHglutarate-13C2	ME252584	0.62	0.73	1.25	1.40
Leu-13C6	ME252454	0.65	1.56	0.73	0.78
bOHbutyrate-13C4	ME252601	1.33	1.06	0.79	0.83
GAB-13C3	ME252375	0.68	0.94	0.43	1.78
Itaconate-13C1	ME252421	1.10	1.19	0.96	0.76
a-glycerol-3P_#1-13C0	ME252565	0.48	0.68	1.58	1.25
aOHglutarate-13C1	ME252583	0.32	0.36	1.36	1.97
Lys-13C3	ME252459	NA	1.12	0.75	1.01
Kynurenic_acid-13C5	ME252432	0.52	0.55	1.41	1.29
Glu-13C2	ME252387	0.77	0.66	1.24	1.33
Itaconate-13C4	ME252424	0.27	2.31	0.71	0.71
Leu-ALL	ME252455	1.32	1.30	0.64	0.73
Kynurenic_acid-13C3	ME252430	0.63	0.69	1.67	1.35
Kynurenic_acid-13C10	ME252428	0.28	2.01	0.97	1.48
Kynurenic_acid-13C1	ME252427	1.60	1.20	0.10	0.31
Gln-13C0	ME252378	0.00	0.00	1.55	1.45
GAB-13C2	ME252374	1.54	1.82	NA	0.05
citrate-ALL	ME252610	0.22	0.11	2.19	1.48
citrate-13C1	ME252604	0.19	0.12	2.42	1.27
Asp-13C2	ME252363	0.54	0.41	1.75	1.30
Asn-13C3	ME252358	NA	NA	1.51	0.49
Arg-13C1	ME252348	0.49	0.50	1.65	1.36
a-ketoglutarate-13C1	ME252576	NA	NA	1.21	0.59
aOHglutarate-13C3	ME252585	0.47	0.77	1.24	1.52
a-glycerol-3P_#2-13C1	ME252571	0.14	0.11	0.91	2.41
lactate-ALL	ME252621	1.10	0.51	1.06	1.33
lactate-13C0	ME252617	1.39	0.00	1.14	1.46
Kynurenic_acid-13C6	ME252433	1.97	0.74	0.61	0.55
Ile-ALL	ME252411	1.26	1.35	0.64	0.75
Ile-13C4	ME252408	NA	1.08	0.72	1.40
Gly-13C2	ME252394	1.91	1.52	0.05	0.05
Gly-13C1	ME252393	1.78	1.63	0.25	0.34
Gly-13C0	ME252392	1.60	1.56	0.45	0.38
Glu-13C3	ME252388	0.76	0.80	1.15	1.29
Glu-13C1	ME252386	0.72	0.64	1.22	1.42
Gln-13C5	ME252383	0.24	0.14	1.58	1.23
fumarate-13C4	ME252615	0.48	0.22	1.04	1.61
citrate-13C5	ME252608	0.29	0.16	1.84	1.71
aOHglutarate-13C5	ME252587	0.74	1.57	0.53	1.16
Ala-ALL	ME252346	1.35	1.65	0.41	0.60
Ala-13C0	ME252342	1.26	1.45	0.54	0.74
a-glycerol-3P_#2-13C2	ME252572	0.27	0.56	1.49	1.31
a-glycerol-3P_#1-13C1	ME252566	NA	0.80	0.93	1.27
a-glycerol-3P_#1-ALL	ME252569	0.49	0.73	1.54	1.24
Kynurenic_acid-13C8	ME252435	1.20	0.77	0.79	1.14
Ala-13C1	ME252343	1.42	1.47	0.40	0.71
Ile-13C3	ME252407	3.05	0.90	0.08	NA
Arg-13C5	ME252352	1.56	0.55	0.33	NA
Leu-13C1	ME252449	1.33	0.98	0.81	0.89
Kynurenic_acid-13C9	ME252436	0.88	1.86	0.86	0.41
Kynurenic_acid-13C7	ME252434	0.72	0.71	0.77	1.66
Kynurenic_acid-13C0	ME252426	1.66	1.41	0.51	0.41
Itaconate-13C3	ME252423	1.28	1.31	0.69	0.72
Itaconate-13C0	ME252420	1.18	1.22	0.37	1.23
Ile-13C5	ME252409	0.73	1.99	0.97	0.81
Ile-13C2	ME252406	1.19	1.03	0.43	1.35
Gly-ALL	ME252395	1.65	1.58	0.41	0.35
Glu-ALL	ME252391	0.73	0.62	1.29	1.36
Glu-13C0	ME252385	0.70	0.49	1.40	1.41
Gln-ALL	ME252384	0.00	0.00	1.55	1.45
Gln-13C4	ME252382	NA	NA	0.39	1.61
GAB-13C0	ME252372	1.52	1.23	0.64	0.61
citrate-13C6	ME252609	NA	0.25	1.82	0.86
citrate-13C2	ME252605	0.27	0.11	2.06	1.55
bOHbutyrate-13C0	ME252597	1.49	1.40	0.61	0.51
Asp-13C1	ME252362	0.44	0.33	1.60	1.63
Asn-13C1	ME252356	NA	NA	1.69	0.66
Arg-13C4	ME252351	0.93	1.13	NA	0.90
Arg-13C3	ME252350	NA	NA	1.49	0.51
Arg-13C2	ME252349	0.60	0.68	1.53	1.38
Arg-13C0	ME252347	0.58	0.46	1.57	1.38
aOHglutarate-ALL	ME252588	0.57	0.64	1.24	1.54
aOHglutarate-13C4	ME252586	0.64	0.68	1.07	1.60
aOHglutarate-13C0	ME252582	0.60	0.57	1.29	1.55
Ala-13C2	ME252344	1.14	1.54	0.46	0.86
a-ketoglutarate-ALL	ME252581	0.52	0.46	1.92	1.10
a-ketoglutarate-13C5	ME252580	0.94	0.92	1.25	0.64
a-ketoglutarate-13C3	ME252578	0.13	0.26	1.82	0.98
a-glycerol-3P_#2-ALL	ME252574	0.42	0.65	1.54	1.39
a-glycerol-3P_#1-13C2	ME252567	0.38	0.78	2.94	0.87
a-glycerol-3P_#1-13C3	ME252568	0.59	0.98	1.30	1.13
Itaconate-13C2	ME252422	0.63	0.44	1.74	0.92
fumarate-13C0	ME252611	0.44	0.32	1.71	1.54
Asp-13C4	ME252365	0.32	0.48	1.66	1.53
Leu-13C5	ME252453	NA	1.61	NA	0.39
Itaconate-ALL	ME252425	0.78	1.62	0.78	0.83
Glu-13C5	ME252390	0.67	1.01	1.05	1.27
Gln-13C2	ME252380	0.01	NA	1.31	1.19
fumarate-13C3	ME252614	0.59	0.27	1.60	1.54
Asn-13C2	ME252357	NA	NA	0.65	1.35
bOHbutyrate-13C1	ME252598	1.25	1.53	0.49	0.73
Leu-13C0	ME252448	1.32	1.33	0.63	0.72
lactate-13C3	ME252620	0.80	0.77	1.08	1.35
Ile-13C1	ME252405	1.43	1.35	0.64	0.58
Gln-13C1	ME252379	0.00	0.02	1.52	1.47
GAB-13C1	ME252373	1.07	1.05	0.91	0.97
fumarate-13C1	ME252612	0.56	0.38	1.53	1.53
Asp-13C3	ME252364	0.41	0.38	1.58	1.63
Asp-13C0	ME252361	0.50	0.29	1.75	1.46
a-ketoglutarate-13C4	ME252579	1.01	1.04	NA	0.95
Ala-13C3	ME252345	1.45	1.88	0.27	0.41
Kynurenic_acid-13C2	ME252429	NA	0.47	0.66	1.61
fumarate-13C2	ME252613	0.47	0.33	1.60	1.61
a-ketoglutarate-13C0	ME252575	0.41	0.24	2.04	1.32
Lys-13C0	ME252456	0.05	0.05	1.94	1.96
citrate-13C3	ME252606	0.20	0.10	2.18	1.52
a-ketoglutarate-13C2	ME252577	0.60	0.59	2.09	0.72
bOHbutyrate-13C3	ME252600	0.96	1.35	NA	0.66
fumarate-ALL	ME252616	0.47	0.32	1.64	1.57
lactate-13C1	ME252618	0.35	2.75	0.37	0.52
Lys-13C2	ME252458	0.12	0.24	2.11	0.42
Leu-13C2	ME252450	1.25	0.97	1.47	0.54
Kynurenic_acid-13C4	ME252431	1.37	0.96	0.36	0.97
Asp-ALL	ME252366	0.49	0.34	1.71	1.47
GAB-13C4	ME252376	1.05	0.64	1.01	1.60
citrate-13C0	ME252603	0.16	0.06	2.26	1.52
Arg-13C6	ME252353	0.59	0.01	2.23	0.34
Asn-ALL	ME252360	NA	NA	1.13	0.87
Lys-13C1	ME252457	0.20	0.19	1.91	2.15
Ile-13C6	ME252410	1.68	0.50	0.56	1.53
Glu-13C4	ME252389	0.78	0.86	1.17	1.19
citrate-13C4	ME252607	0.24	0.20	2.26	1.31
Arg-ALL	ME252354	0.55	0.48	1.61	1.36
bOHbutyrate-ALL	ME252602	1.34	1.34	0.61	0.70

Factors:

F1	cell_type:Caki-1 \| protocol.id:adGFP_13CGlc
F2	cell_type:Caki-1 \| protocol.id:adPGC1A_13CGlc
F3	cell_type:RCC4 \| protocol.id:adGFP_13CGlc
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Data matrix