Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001045)

(Analysis AN001709)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4
pyroGlu-13C4	ME252870	0.04	0.03	0.87	1.77
pyroGlu-13C5	ME252871	0.13	0.07	1.30	1.30
a-ketoglutarate-13C5	ME252831	0.07	0.33	1.27	1.26
pyroGlu-13C1	ME252867	0.60	0.82	1.15	1.04
Arg-13C0	ME252642	0.62	0.61	1.32	0.94
Pro-13C5	ME252766	0.17	NA	1.24	1.04
Ile-13C0	ME252699	0.78	0.77	1.25	0.90
Gly-13C2	ME252689	NA	0.73	0.56	1.53
Asn-13C0	ME252650	1.11	1.20	0.99	0.90
Arg-13C2	ME252644	0.31	0.43	1.06	1.38
ascorbate-13C3	ME252836	0.95	0.63	NA	1.21
Asp-13C1	ME252657	0.70	0.64	1.10	1.12
Pro-ALL	ME252767	0.76	0.77	1.22	0.93
a-ketoglutarate-13C1	ME252827	0.60	1.35	0.85	1.17
Phe-13C1	ME252751	0.88	0.73	1.27	0.86
pyroGlu-13C0	ME252866	0.91	1.12	1.12	0.87
a-ketoglutarate-13C2	ME252828	0.13	NA	1.27	1.02
Glu-ALL	ME252686	0.80	0.94	1.15	0.93
Orn-13C5	ME252748	0.04	0.08	1.35	1.27
pyroGlu-13C3	ME252869	NA	NA	1.12	0.88
Malate-13C2	ME252725	0.09	0.01	1.24	1.39
Lys-ALL	ME252722	0.54	0.81	1.24	0.98
pyroGlu-13C2	ME252868	NA	NA	0.97	1.03
Arg-13C4	ME252646	NA	1.53	1.09	0.65
Asn-13C1	ME252651	0.20	0.55	1.27	1.15
Ala-13C0	ME252637	1.54	1.60	0.92	0.70
Ala-13C1	ME252638	0.39	1.74	1.30	0.65
a-ketoglutarate-13C3	ME252829	NA	0.09	1.35	0.95
Pro-13C3	ME252764	0.03	0.14	1.38	1.23
a-ketoglutarate-ALL	ME252832	0.78	0.77	1.19	0.96
Arg-13C3	ME252645	1.07	1.16	0.30	1.16
a-ketoglutarate-13C4	ME252830	0.04	0.11	1.37	1.24
Ala-13C2	ME252639	0.32	0.32	1.33	1.12
Malate-13C4	ME252727	NA	0.03	0.85	1.47
Ile-13C2	ME252701	0.27	0.18	1.30	1.48
Gln-13C3	ME252676	NA	NA	0.77	1.23
Asp-ALL	ME252661	0.81	1.00	1.08	0.98
GAB-13C1	ME252668	1.09	0.32	1.38	0.82
Malate-ALL	ME252728	0.72	1.02	1.02	1.07
Malate-13C3	ME252726	NA	0.05	1.11	1.20
Lys-13C3	ME252718	NA	NA	1.63	0.37
Gln-13C1	ME252674	0.58	0.84	1.31	0.88
fumarate-13C4	ME252859	NA	NA	1.05	0.95
GAB-ALL	ME252672	0.97	0.75	1.30	0.79
Orn-13C0	ME252743	1.16	1.42	1.05	0.75
Leu-13C4	ME252711	NA	0.63	1.40	0.78
Ile-13C5	ME252704	NA	0.64	0.87	1.20
Asn-13C3	ME252653	0.05	NA	1.24	1.08
bOHbutyrate-13C1	ME252842	NA	0.43	1.17	1.03
a-glycerol-3P_#2-ALL	ME252825	0.66	0.83	1.21	0.96
lactate-13C3	ME252864	0.02	0.04	1.35	1.30
Leu-13C3	ME252710	0.95	NA	0.55	1.46
Leu-ALL	ME252714	0.75	0.77	1.23	0.93
lactate-ALL	ME252865	0.58	0.91	1.16	1.01
a-glycerol-3P_#1-13C0	ME252816	1.32	1.89	0.73	0.87
ascorbate-13C0	ME252833	0.68	1.07	NA	1.12
OHPro-13C4	ME252740	0.76	0.01	1.80	0.88
OHPro-13C1	ME252737	0.88	1.05	0.95	1.07
Leu-13C5	ME252712	NA	NA	1.48	0.04
lactate-13C2	ME252863	0.20	NA	1.24	1.02
Gln-13C2	ME252675	1.12	0.24	1.30	0.92
fumarate-13C2	ME252857	0.02	0.10	1.37	1.26
fumarate-ALL	ME252860	0.77	0.82	1.15	0.99
Pro-13C1	ME252762	0.83	0.27	1.27	1.03
Gln-13C0	ME252673	0.82	0.83	1.21	0.90
Lys-13C0	ME252715	0.56	0.71	1.24	1.01
OHPro-13C0	ME252736	0.83	0.76	1.29	0.84
Glu-13C5	ME252685	NA	0.05	1.15	1.16
a-glycerol-3P_#2-13C2	ME252823	NA	0.27	1.21	1.05
Asp-13C4	ME252660	NA	0.05	0.99	1.33
OHPro-13C5	ME252741	NA	2.72	0.48	0.32
lactate-13C0	ME252861	1.19	1.88	0.93	0.71
a-glycerol-3P_#1-13C1	ME252817	1.52	0.47	0.94	1.04
citrate-13C5	ME252852	0.02	NA	1.25	1.07
Phe-ALL	ME252760	0.77	0.80	1.25	0.90
Phe-13C8	ME252758	0.47	0.70	1.62	0.66
Gln-ALL	ME252679	0.81	0.82	1.22	0.91
citrate-13C4	ME252851	0.01	NA	1.35	0.98
Asp-13C2	ME252658	0.00	0.03	1.40	1.26
a-glycerol-3P_#1-13C3	ME252819	0.00	0.04	1.36	1.29
a-glycerol-3P_#1-ALL	ME252820	0.76	1.08	1.01	1.04
Glu-13C2	ME252682	0.06	0.05	1.43	1.20
Ala-13C3	ME252640	NA	NA	1.05	0.95
citrate-13C0	ME252847	2.46	2.42	0.61	0.43
Orn-13C1	ME252744	NA	0.31	1.19	1.04
Met-13C5	ME252734	NA	NA	0.69	1.16
Arg-ALL	ME252649	0.66	0.63	1.25	0.98
Ile-13C4	ME252703	1.61	NA	1.33	0.06
Pro-13C4	ME252765	0.05	0.33	1.16	1.37
Orn-ALL	ME252749	0.76	0.90	1.18	0.93
Gln-13C5	ME252678	0.03	0.59	0.91	1.74
OHPro-ALL	ME252742	0.83	0.80	1.26	0.87
ascorbate-ALL	ME252840	0.93	0.94	NA	1.07
GAB-13C0	ME252667	0.95	0.79	1.28	0.80
Phe-13C6	ME252756	0.98	1.45	1.07	0.81
ascorbate-13C1	ME252834	NA	1.28	NA	0.86
Pro-13C2	ME252763	NA	NA	1.21	0.79
Ala-ALL	ME252641	0.82	0.89	1.15	0.95
ascorbate-13C2	ME252835	1.04	0.97	NA	1.00
Gly-13C0	ME252687	0.85	0.87	1.18	0.91
Phe-13C9	ME252759	0.76	1.03	NA	1.21
a-glycerol-3P_#2-13C1	ME252822	NA	0.11	1.45	0.84
bOHbutyrate-13C2	ME252843	0.46	NA	1.45	0.64
Phe-13C5	ME252755	0.60	1.00	1.59	0.54
Glu-13C3	ME252683	0.04	NA	1.25	1.08
citrate-13C2	ME252849	0.03	0.04	1.60	1.05
fumarate-13C1	ME252856	0.52	0.69	1.19	1.08
Phe-13C7	ME252757	1.07	0.38	0.54	1.73
Met-13C4	ME252733	0.79	0.76	1.22	0.93
Met-13C2	ME252731	0.89	0.75	1.29	0.83
Ile-ALL	ME252706	0.81	0.78	1.22	0.92
Ile-13C1	ME252700	1.26	0.91	0.89	1.05
a-ketoglutarate-13C0	ME252826	1.17	1.12	1.09	0.82
Glu-13C0	ME252680	1.20	1.39	1.02	0.79
Pro-13C0	ME252761	1.05	1.08	1.12	0.83
OHPro-13C2	ME252738	NA	1.16	0.59	1.08
Met-13C1	ME252730	0.77	1.16	1.60	0.43
Met-13C0	ME252729	0.80	0.71	1.33	0.84
lactate-13C1	ME252862	0.72	1.05	1.19	0.89
ascorbate-13C4	ME252837	1.02	0.67	NA	1.15
Gln-13C4	ME252677	NA	0.38	1.02	1.18
Malate-13C0	ME252723	1.15	1.59	0.87	0.88
Phe-13C2	ME252752	0.01	0.88	0.91	1.43
Lys-13C1	ME252716	0.20	1.21	1.30	0.99
Met-ALL	ME252735	0.80	0.76	1.30	0.84
Malate-13C1	ME252724	0.17	0.66	1.34	1.05
Leu-13C6	ME252713	0.45	NA	2.02	0.53
Gly-13C1	ME252688	1.86	1.03	1.08	0.63
Glu-13C1	ME252681	0.74	1.07	1.21	0.85
fumarate-13C3	ME252858	0.04	0.16	1.41	1.19
a-glycerol-3P_#2-13C0	ME252821	1.43	1.74	0.81	0.80
Asp-13C3	ME252659	0.05	0.07	1.32	1.30
GAB-13C2	ME252669	1.10	0.00	1.56	0.61
Orn-13C2	ME252745	0.11	0.09	1.36	1.24
Leu-13C1	ME252708	0.37	0.55	1.48	0.88
Glu-13C4	ME252684	NA	0.01	1.18	1.15
citrate-ALL	ME252854	0.92	0.87	1.21	0.86
GAB-13C3	ME252670	0.48	2.51	0.82	0.79
Asn-13C4	ME252654	0.13	0.05	1.40	1.20
Asn-ALL	ME252655	0.77	0.86	1.11	1.02
OHPro-13C3	ME252739	0.95	NA	0.81	1.31
Orn-13C4	ME252747	NA	0.03	0.87	1.45
Lys-13C2	ME252717	0.73	0.68	1.59	NA
Leu-13C0	ME252707	0.79	0.82	1.19	0.94
citrate-13C6	ME252853	NA	0.00	1.32	1.01
Asp-13C0	ME252656	1.16	1.45	0.97	0.83
a-glycerol-3P_#1-13C2	ME252818	0.18	0.98	1.44	0.84
Asn-13C2	ME252652	NA	0.02	1.16	1.16
Orn-13C3	ME252746	0.40	NA	1.26	0.91
citrate-13C1	ME252848	1.27	0.64	1.31	0.72
bOHbutyrate-13C0	ME252841	0.83	0.75	1.12	1.02
bOHbutyrate-ALL	ME252846	0.75	0.70	1.21	0.98
citrate-13C3	ME252850	0.06	0.02	1.41	1.23
Ile-13C3	ME252702	0.45	2.60	0.04	0.97
fumarate-13C0	ME252855	1.14	1.16	1.04	0.86
Gly-ALL	ME252690	0.88	0.88	1.17	0.91
Leu-13C2	ME252709	0.03	NA	1.32	NA
a-glycerol-3P_#2-13C3	ME252824	NA	NA	1.14	0.86
Arg-13C1	ME252643	0.93	0.58	1.05	1.11
Met-13C3	ME252732	0.87	2.75	0.20	1.39
Phe-13C4	ME252754	NA	0.47	NA	1.18
Lys-13C4	ME252719	NA	0.76	1.24	NA
Phe-13C0	ME252750	0.78	0.77	1.25	0.91

Factors:

F1	protocol.id:12CGlc_FASN_shRNA
F2	protocol.id:12CGlc_NTC_shRNA
F3	protocol.id:13CGlc_FASN_shRNA
F4	protocol.id:13CGlc_NTC_shRNA

Data matrix