Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST002542)

(Analysis AN004188)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9
Phosphorylcholine	ME616642	0.16	0.18	7.76	0.05	0.07	0.20	0.17	0.10	0.30
7-Methylguanosine	ME616672	0.28	0.32	5.10	0.27	0.24	1.16	0.25	1.05	0.33
Glycerophosphocholine	ME616660	0.42	0.07	5.92	0.36	0.46	0.25	0.33	0.11	1.08
Ethanolamine	ME616587	0.37	4.02	0.54	0.58	0.36	1.22	0.38	1.32	0.20
N-Acetylputrescine	ME616611	0.11	4.86	0.62	0.19	0.12	0.95	0.09	1.97	0.10
Dimethylglycine	ME616594	0.05	4.00	3.59	0.03	0.03	0.36	0.03	0.78	0.05
Asymmetric dimethylarginine	ME616648	0.54	2.10	2.89	0.24	0.27	1.03	0.55	0.98	0.39
Gamma-Aminobutyric acid	ME616593	0.38	1.39	3.40	0.29	0.29	1.44	0.51	1.03	0.27
1-Methyladenosine	ME616668	0.28	1.85	3.00	0.25	0.30	0.97	0.33	1.71	0.32
L-Kynurenine	ME616651	0.16	1.42	3.29	0.22	0.13	1.29	0.20	1.62	0.68
13C-Arginine-1	ME616719	0.13	1.26	2.39	0.20	0.64	0.27	0.68	1.73	1.69
13C-Aspartate-1	ME616718	0.43	2.36	1.77	0.37	0.41	0.46	0.38	1.34	1.48
L-Cystine	ME616656	NA	2.47	1.33	0.24	0.14	0.23	0.56	1.01	0.79
Pyridoxine	ME616634	0.64	0.70	0.39	2.28	2.76	0.69	0.35	0.89	0.30
Adenosine	ME616667	0.71	0.40	0.45	0.49	0.75	4.18	1.06	0.49	0.48
S-Ribosyl-L-homocysteine	ME616665	0.89	0.60	0.85	0.94	0.87	2.95	0.87	0.98	0.63
Homocysteine	ME616619	0.15	1.51	0.29	0.21	0.13	2.27	0.18	4.17	0.10
L-Methionine	ME616626	0.02	1.74	0.48	0.34	0.02	2.39	0.03	3.95	0.03
Methionine sulfoxide	ME616631	0.02	3.10	0.78	0.37	0.02	2.32	0.03	2.33	0.03
L-Aspartic acid	ME616616	0.38	1.07	0.66	0.63	0.43	2.32	0.54	2.64	0.31
L-Glutamine	ME616623	0.33	1.32	0.87	0.83	0.58	2.28	0.50	2.10	0.20
Pipecolic acid	ME616610	0.34	1.32	0.85	0.81	0.58	2.25	0.52	2.10	0.22
L-Glutamic acid	ME616625	0.37	1.18	0.78	0.59	0.52	2.35	0.57	2.32	0.32
Indole	ME616599	0.55	1.17	0.89	0.56	0.51	2.21	0.65	2.21	0.25
L-Tryptophan	ME616650	0.50	1.19	1.06	0.50	0.50	2.27	0.52	2.25	0.21
L-Phenylalanine	ME616632	0.34	1.52	0.99	0.38	0.26	2.79	0.40	2.19	0.13
Purine	ME616604	0.40	1.39	1.00	0.48	0.33	2.68	0.41	2.13	0.19
L-Asparagine	ME616615	0.29	1.47	1.16	0.52	0.38	2.05	0.44	2.46	0.23
L-Proline	ME616598	0.41	1.42	1.26	0.32	0.32	2.34	0.49	2.20	0.23
L-Leucine	ME616613	0.28	1.54	1.34	0.37	0.28	2.40	0.29	2.35	0.16
L-Valine	ME616601	0.24	1.77	1.21	0.41	0.32	2.33	0.24	2.36	0.10
Sarcosine	ME616711	0.35	2.19	1.13	0.33	0.23	2.09	0.40	1.91	0.35
L-Alanine	ME616590	0.20	2.19	1.13	0.34	0.20	2.21	0.26	2.31	0.15
L-Tyrosine	ME616641	0.23	1.98	1.34	0.44	0.19	2.11	0.26	2.32	0.14
Methylcysteine	ME616618	0.27	2.01	1.37	0.41	0.21	2.00	0.26	2.32	0.14
L-Lysine	ME616622	0.22	2.33	1.18	0.28	0.39	1.55	0.43	2.48	0.13
L-Threonine	ME616602	0.41	1.82	1.03	0.50	0.51	1.72	0.48	2.29	0.24
N6-Acetyl-L-lysine	ME616644	0.31	2.23	0.82	0.34	0.47	1.70	0.62	2.15	0.37
N-Alpha-acetyllysine	ME616645	0.32	2.19	0.82	0.34	0.48	1.62	0.61	2.26	0.36
N-Acetylornithine	ME616636	0.49	2.15	0.94	0.38	0.49	1.75	0.44	2.26	0.10
Ornithine	ME616614	0.28	2.32	0.85	0.47	0.48	1.73	0.32	2.44	0.11
Cytidine	ME616657	0.31	0.43	0.44	0.64	0.58	3.34	0.51	2.47	0.27
Ureidosuccinic acid	ME616639	0.50	0.60	0.55	0.51	0.40	2.77	0.53	2.66	0.49
1-Methylhistidine	ME616635	0.73	0.84	0.82	0.66	0.59	2.18	0.70	1.87	0.60
AICA-riboside	ME616661	0.63	0.94	0.50	0.81	0.85	1.90	0.76	2.12	0.51
Citrulline	ME616638	0.65	0.87	0.12	0.85	0.87	2.68	0.68	2.12	0.16
N-Acetylglutamic acid	ME616647	0.97	0.98	0.30	1.08	0.77	2.27	0.71	1.75	0.16
Propionyl-CoA	ME616704	1.94	0.58	0.67	0.40	1.22	0.38	2.01	0.35	1.46
L-Cystathionine	ME616654	2.12	0.17	0.16	0.17	2.69	0.27	2.48	0.30	0.62
S-Adenosylhomocysteine	ME616689	1.58	0.28	0.32	0.28	2.18	0.75	2.14	0.81	0.67
Deoxyguanosine	ME616666	1.72	0.41	0.29	0.63	2.20	1.28	0.94	1.14	0.40
S-Adenosylmethioninamine	ME616685	0.59	0.30	1.04	0.67	3.09	0.63	1.47	0.70	0.49
13C-Glutamic acid-1	ME616721	1.94	0.24	0.65	1.60	1.23	0.89	0.86	0.41	0.59
Malonyl-CoA	ME616706	2.33	0.45	0.27	1.87	0.62	0.44	1.27	0.47	0.28
Glucosamine 6-phosphate	ME616662	0.96	NA	0.47	0.82	0.33	0.71	1.91	1.19	1.19
Creatine	ME616606	1.17	2.09	1.41	0.18	0.35	1.17	1.08	0.25	1.31
Creatinine	ME616597	1.86	1.91	1.49	0.21	0.38	1.09	0.89	0.22	0.95
Betaine	ME616600	1.37	0.90	1.30	0.36	0.33	2.11	1.48	0.39	0.76
Carnitine	ME616630	1.53	1.15	1.01	0.40	0.27	1.63	1.38	0.94	0.69
Choline	ME616592	2.00	0.99	1.79	0.31	0.36	1.11	1.25	0.51	0.69
DL-2-Aminooctanoic acid	ME616629	1.21	1.13	2.15	0.42	0.16	1.44	0.96	0.97	0.57
L-Homoserine	ME616603	0.77	0.27	1.53	0.37	1.87	0.60	2.05	0.47	1.08
Glutathione	ME616674	1.36	0.38	1.38	0.42	1.51	0.62	1.73	0.78	0.81
S-Adenosylmethionine	ME616690	1.41	0.35	1.58	0.69	1.51	0.72	1.35	0.48	0.92
5^-Methylthioadenosine	ME616671	1.06	0.27	1.61	0.45	1.85	0.64	1.56	0.67	0.89
Adenine	ME616617	1.30	0.23	1.46	0.57	1.97	0.73	1.55	0.37	0.83
NADH	ME616697	1.04	0.53	1.29	0.64	1.14	0.95	1.46	0.69	1.25
Oxidized glutathione	ME616695	0.86	0.64	2.00	0.33	1.10	0.64	1.58	0.65	1.21
1-Methylnicotinamide	ME616620	1.52	0.41	2.23	0.10	1.60	0.35	1.04	0.51	1.24
13C-Proline1	ME616712	1.15	0.53	2.20	0.82	1.19	0.94	0.77	0.64	0.74
L-Cysteine	ME616605	1.23	0.52	2.19	0.91	1.04	0.78	0.97	0.49	0.70
Biotin	ME616658	1.25	0.32	0.56	2.48	1.38	1.96	0.19	0.70	0.15
L-Histidine	ME616628	0.35	NA	0.83	1.57	1.32	1.48	0.60	1.67	0.26
5-Methoxytryptophan	ME616655	0.55	0.58	0.64	1.67	1.31	1.51	0.61	1.18	0.95
NADPH	ME616700	1.27	0.35	0.47	1.70	1.05	1.57	0.77	1.30	0.52
3,5-Diiodothyronine	ME616694	0.93	0.46	1.67	0.91	0.71	0.99	0.55	1.60	1.18
Guanine	ME616627	0.86	0.48	2.50	0.29	0.87	1.54	0.61	1.26	0.60
Guanosine	ME616669	1.05	0.37	2.01	0.31	0.98	1.66	0.59	1.46	0.56
Coenzyme A	ME616701	1.48	0.95	1.17	1.16	1.01	1.47	0.67	0.90	0.15
13C-Histidine-1	ME616722	1.20	0.50	0.38	1.43	1.63	1.33	1.03	0.63	0.87
13C-Lysine-1	ME616724	1.49	0.66	0.72	1.14	1.46	1.40	0.97	0.52	0.94
13C-Phenylalanine-1	ME616726	1.18	0.60	0.60	1.28	1.03	0.92	0.97	0.68	1.40
5-Thymidylic acid	ME616675	1.60	0.74	0.60	1.25	1.01	0.96	1.10	0.69	1.05
Betaine aldehyde	ME616591	1.54	0.71	0.84	1.25	0.89	1.21	0.94	0.64	0.98
13C tyrosine	ME616729	1.59	0.65	1.03	1.28	0.88	1.11	0.81	0.52	1.13
13C-Tyrosine	ME616727	1.65	0.62	0.99	1.33	0.89	1.11	0.80	0.48	1.11
L-Histidinol	ME616621	0.87	0.58	0.64	1.09	1.40	1.09	1.07	1.32	0.83
Riboflavin	ME616688	1.11	0.37	0.60	0.90	1.44	1.32	1.15	1.09	1.02
DL-O-Phosphoserine	ME616643	1.24	0.50	0.86	1.25	0.96	0.83	1.43	0.93	0.75
NADP	ME616699	0.98	0.72	0.89	1.29	0.94	1.17	0.94	1.29	0.78
Dihydrofolic acid	ME616692	1.45	0.89	1.04	0.92	0.93	0.82	0.99	0.88	1.08
Deoxyadenosine monophosphate	ME616678	0.90	0.77	1.10	0.86	1.07	1.07	1.35	0.93	0.96
NAD	ME616696	0.95	0.84	1.25	0.80	1.13	0.97	1.20	1.02	0.83
13C-Methionine-1	ME616725	1.21	0.72	1.27	0.99	1.13	1.04	0.93	0.70	1.02
Acetoacetyl-CoA	ME616705	1.06	0.92	1.10	1.30	1.00	1.03	0.88	0.88	0.77
Flavone	ME616653	1.00	0.92	1.07	1.05	1.22	1.13	0.86	0.90	0.86
Glycine	ME616589	0.90	0.83	1.00	1.15	1.22	1.04	0.95	0.90	1.01
Glucosamine	ME616640	0.92	0.93	1.01	1.02	1.11	1.07	0.96	1.00	0.98
Hydroxyproline	ME616612	0.99	0.91	0.99	1.04	1.13	1.03	0.91	0.97	1.02
FAD	ME616702	0.97	0.51	1.06	1.14	1.09	1.10	1.08	0.88	1.18
Acetyl-CoA	ME616703	1.22	0.59	0.83	1.09	1.21	1.01	1.14	1.02	0.89
Folic acid	ME616691	1.23	0.73	0.97	1.01	1.06	1.00	1.04	0.96	1.00
AICAR	ME616680	0.79	0.72	0.64	1.13	1.06	1.10	1.41	1.01	1.15
Xanthylic acid	ME616687	1.06	0.95	0.64	1.04	1.42	0.94	1.29	0.73	0.81
dGMP	ME616682	0.66	1.03	1.46	0.69	1.35	0.69	0.82	1.21	1.10
13 C phenylalanine	ME616730	0.91	1.06	1.26	0.86	1.31	1.30	1.10	0.72	0.59
dCMP	ME616673	0.80	1.02	1.32	0.78	1.03	1.26	1.03	1.08	0.68
Glucosamine-1P	ME616663	0.71	1.25	1.34	0.75	1.19	1.10	0.78	1.05	0.82
Urea	ME616586	1.36	1.25	1.03	0.66	0.86	1.24	0.93	0.50	1.17
13C-Threonine-1	ME616715	1.46	1.55	1.11	0.87	1.46	0.91	1.01	0.48	0.45
5-Methyltetrahydrofolic acid	ME616693	1.02	1.63	0.81	0.73	1.28	0.99	0.90	0.75	0.87
Putrescine	ME616708	1.00	1.40	1.26	1.03	0.74	0.59	0.69	0.95	1.34
Pyridoxamine	ME616633	0.59	1.73	1.16	0.86	0.77	0.99	1.31	0.83	0.77
Cytosine	ME616596	1.16	0.92	0.59	0.69	0.73	1.89	0.84	1.22	0.97
Deoxyadenosine	ME616659	0.98	1.03	0.64	0.59	1.39	1.74	0.82	1.52	0.29
O-Acetylserine	ME616624	0.58	0.89	0.47	0.89	1.48	1.65	0.80	1.26	0.98
GMP	ME616686	0.71	0.95	0.57	0.80	1.12	1.49	1.34	1.34	0.69
Dephospho-CoA	ME616698	0.73	0.65	0.56	0.96	0.87	1.75	1.10	1.58	0.80
Thiamine monophosphate	ME616681	0.75	0.82	0.48	0.90	1.11	1.53	1.05	1.76	0.61
Adenosine monophosphate	ME616683	0.64	0.88	0.51	0.58	1.47	1.51	1.62	1.07	0.71
IMP	ME616684	0.63	0.82	0.56	0.59	1.49	1.45	1.64	1.07	0.74
13C-Cystine-1	ME616720	0.45	1.26	0.89	0.89	1.04	1.82	0.95	1.01	0.68
Thymine	ME616609	0.38	0.92	0.91	1.16	1.32	1.26	1.24	0.98	0.83
N-Acetyl-D-glucosamine	ME616652	1.03	1.32	0.89	0.46	0.62	1.23	0.97	1.35	1.13
L-Acetylcarnitine	ME616649	1.26	1.43	0.90	0.45	0.52	1.28	0.76	1.71	0.69
Thiamine	ME616664	1.21	1.01	0.71	0.73	0.68	1.44	0.75	1.84	0.64
Niacinamide	ME616607	0.41	1.03	1.11	0.60	1.36	1.15	0.94	1.69	0.71
Cytidine monophosphate	ME616676	0.41	1.47	1.22	0.61	0.60	1.31	0.81	1.80	0.76
Imidazoleacetic acid	ME616608	0.84	1.35	0.93	0.47	0.70	1.59	0.89	1.65	0.58
Imidazole	ME616588	0.43	1.57	0.91	0.65	0.78	1.50	0.79	1.55	0.82
L-Arginine	ME616637	0.46	1.30	0.77	0.63	0.94	1.68	0.95	1.61	0.65
Argininosuccinic acid	ME616670	0.51	1.52	0.63	0.70	0.82	1.96	0.83	1.60	0.42
Nicotinamide ribotide	ME616679	0.54	1.20	1.02	0.76	0.82	1.74	0.79	1.81	0.31
Uridine 5^-monophosphate	ME616677	0.46	1.47	1.86	0.58	0.60	1.34	0.76	1.44	0.47
N-Acetylglutamine	ME616646	0.46	1.00	1.49	0.62	0.77	1.61	1.07	1.64	0.34
Serine	ME616595	0.75	1.29	1.39	0.59	0.44	1.87	0.68	1.57	0.44

Factors:

F1	label:0h
F2	label:15h
F3	label:15h+
F4	label:2h
F5	label:2h+
F6	label:4h
F7	label:4h+
F8	label:6h
F9	label:6h+

Data matrix