Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with heatmap algorithm for (Study ST001992)

This analysis uses the 'heatmap.2' function of gplots package in the R statistics environment

The rows are scaled to have mean=0 and standard deviation=1

Factors:

F1	Agemonths:12 \| Case:CTR \| sex:1
F2	Agemonths:12 \| Case:CTR \| sex:2
F3	Agemonths:12 \| Case:P1Ab \| sex:1
F4	Agemonths:12 \| Case:P1Ab \| sex:2
F5	Agemonths:12 \| Case:P2Ab \| sex:1
F6	Agemonths:12 \| Case:P2Ab \| sex:2
F7	Agemonths:18 \| Case:CTR \| sex:1
F8	Agemonths:18 \| Case:CTR \| sex:2
F9	Agemonths:18 \| Case:P1Ab \| sex:1
F10	Agemonths:18 \| Case:P1Ab \| sex:2
F11	Agemonths:18 \| Case:P2Ab \| sex:1
F12	Agemonths:18 \| Case:P2Ab \| sex:2
F13	Agemonths:24 \| Case:CTR \| sex:1
F14	Agemonths:24 \| Case:CTR \| sex:2
F15	Agemonths:24 \| Case:P1Ab \| sex:1
F16	Agemonths:24 \| Case:P1Ab \| sex:2
F17	Agemonths:24 \| Case:P2Ab \| sex:1
F18	Agemonths:24 \| Case:P2Ab \| sex:2
F19	Agemonths:2 \| Case:CTR \| sex:2
F20	Agemonths:36 \| Case:CTR \| sex:1
F21	Agemonths:36 \| Case:CTR \| sex:2
F22	Agemonths:36 \| Case:P1Ab \| sex:1
F23	Agemonths:36 \| Case:P1Ab \| sex:2
F24	Agemonths:36 \| Case:P2Ab \| sex:1
F25	Agemonths:36 \| Case:P2Ab \| sex:2
F26	Agemonths:3 \| Case:CTR \| sex:1
F27	Agemonths:3 \| Case:CTR \| sex:2
F28	Agemonths:3 \| Case:P1Ab \| sex:1
F29	Agemonths:3 \| Case:P1Ab \| sex:2
F30	Agemonths:3 \| Case:P2Ab \| sex:1
F31	Agemonths:6 \| Case:CTR \| sex:1
F32	Agemonths:6 \| Case:CTR \| sex:2
F33	Agemonths:6 \| Case:P1Ab \| sex:1
F34	Agemonths:6 \| Case:P1Ab \| sex:2
F35	Agemonths:6 \| Case:P2Ab \| sex:1
F36	Agemonths:6 \| Case:P2Ab \| sex:2

Data matrix