Clustering data with heatmap algorithm for (Study ST003301)

This analysis uses the 'heatmap.2' function of gplots package in the R statistics environment

The rows are scaled to have mean=0 and standard deviation=1

Factors:

F1	donor:D1 | timepoint:0h | oxyesgeno:fresh
F2	donor:D1 | timepoint:168h | oxyesgeno:no
F3	donor:D1 | timepoint:168h | oxyesgeno:yes
F4	donor:D1 | timepoint:24h | oxyesgeno:no
F5	donor:D1 | timepoint:24h | oxyesgeno:yes
F6	donor:D1 | timepoint:48h | oxyesgeno:no
F7	donor:D1 | timepoint:48h | oxyesgeno:yes
F8	donor:D1 | timepoint:4h | oxyesgeno:no
F9	donor:D1 | timepoint:4h | oxyesgeno:yes
F10	donor:D2 | timepoint:0h | oxyesgeno:fresh
F11	donor:D2 | timepoint:168h | oxyesgeno:no
F12	donor:D2 | timepoint:168h | oxyesgeno:yes
F13	donor:D2 | timepoint:24h | oxyesgeno:no
F14	donor:D2 | timepoint:24h | oxyesgeno:yes
F15	donor:D2 | timepoint:48h | oxyesgeno:no
F16	donor:D2 | timepoint:48h | oxyesgeno:yes
F17	donor:D2 | timepoint:4h | oxyesgeno:no
F18	donor:D2 | timepoint:4h | oxyesgeno:yes
F19	donor:D3 | timepoint:0h | oxyesgeno:fresh
F20	donor:D3 | timepoint:168h | oxyesgeno:no
F21	donor:D3 | timepoint:168h | oxyesgeno:yes
F22	donor:D3 | timepoint:24h | oxyesgeno:no
F23	donor:D3 | timepoint:24h | oxyesgeno:yes
F24	donor:D3 | timepoint:48h | oxyesgeno:no
F25	donor:D3 | timepoint:48h | oxyesgeno:yes
F26	donor:D3 | timepoint:4h | oxyesgeno:no
F27	donor:D3 | timepoint:4h | oxyesgeno:yes
F28	donor:D4 | timepoint:0h | oxyesgeno:fresh
F29	donor:D4 | timepoint:168h | oxyesgeno:no
F30	donor:D4 | timepoint:168h | oxyesgeno:yes
F31	donor:D4 | timepoint:24h | oxyesgeno:no
F32	donor:D4 | timepoint:24h | oxyesgeno:yes
F33	donor:D4 | timepoint:48h | oxyesgeno:no
F34	donor:D4 | timepoint:48h | oxyesgeno:yes
F35	donor:D4 | timepoint:4h | oxyesgeno:no
F36	donor:D4 | timepoint:4h | oxyesgeno:yes
F37	donor:D5 | timepoint:0h | oxyesgeno:fresh
F38	donor:D5 | timepoint:168h | oxyesgeno:no
F39	donor:D5 | timepoint:168h | oxyesgeno:yes
F40	donor:D5 | timepoint:24h | oxyesgeno:no
F41	donor:D5 | timepoint:24h | oxyesgeno:yes
F42	donor:D5 | timepoint:48h | oxyesgeno:no
F43	donor:D5 | timepoint:48h | oxyesgeno:yes
F44	donor:D5 | timepoint:4h | oxyesgeno:no
F45	donor:D5 | timepoint:4h | oxyesgeno:yes
F46	donor:D6 | timepoint:0h | oxyesgeno:fresh
F47	donor:D6 | timepoint:168h | oxyesgeno:no
F48	donor:D6 | timepoint:168h | oxyesgeno:yes
F49	donor:D6 | timepoint:24h | oxyesgeno:no
F50	donor:D6 | timepoint:24h | oxyesgeno:yes
F51	donor:D6 | timepoint:48h | oxyesgeno:no
F52	donor:D6 | timepoint:48h | oxyesgeno:yes
F53	donor:D6 | timepoint:4h | oxyesgeno:no
F54	donor:D6 | timepoint:4h | oxyesgeno:yes

Data matrix